Plant / Animal Tevahiya Genom Sequencing
Taybetmendiyên Xizmetê
● Amadekirina pirtûkxaneyê dikare standard an bê PCR be
● Di 4 platformên rêzkirinê de peyda dibe: Illumina NovaSeq, MGI T7, Nanopore Promethion P48, an PacBio Revio.
● Analîzkirina biyoinformatîk li ser tespîtkirina guhertoyan hûr dibe: SNP, InDel, SV û CNV
Avantajên Service
●Pisporê Berfireh û Records Weşanê: Tecrûbeya berhevkirî ya di rêzgirtina genomê de ji bo zêdetirî 1000 cureyan, zêdetirî 1000 bûyerên hatine weşandin bi faktorek bandorek berhevkirî ya zêdetirî 5000 re encam daye.
●Analîza Bioinformatics Berfireh: Di nav de bangkirina guhertoyê û şirovekirina fonksiyonê.
● Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi serdemek karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.
●Annotation Berfireh: Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel genan bi guhertoyên naskirî ve bişopînin û analîza dewlemendkirina têkildar pêk bînin, li ser gelek projeyên lêkolînê nihêrînek peyda bikin.
Specifications Service
| Guhertoyên ku bêne naskirin | Stratejiya rêzgirtinê | Kûrahiya pêşniyar kirin |
| SNP û InDel | Illumina NovaSeq PE150 an MGI T7 | 10x |
| SV û CNV (kêm rast) | 30x | |
| SV û CNV (rasttir) | Nanopore Prom P48 | 20x |
| SNP, Indels, SV û CNV | PacBio Revio | 10x |
Sample Requirements
| Tîsîk an asîdên nukleîk ên jêkirî | Illumina / MGI | Nanopore | PacBio
| ||
| Animal Viscera | 0,5-1 g | ≥ 3,5 g
| ≥ 3,5 g
| ||
| Animal Muscle | ≥ 5 g
| ≥ 5 g
| |||
| Xwîna Mamikan | 1,5 ml | ≥ 0,5 mL
| ≥ 5 ml
| ||
| Mirîşk / Xwîna Masî | ≥ 0.1 mL
| ≥ 0,5 mL
| |||
| Nebat- Pelê teze | 1-2 g | ≥ 2 g
| ≥ 5 g
| ||
| Hucreyên Çandî |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| Tevna nermê ya kêzik / Kesane | 0,5-1 g | ≥ 1 g
| ≥ 3 g
| ||
| DNA hat derxistin
| Konsansasyon: ≥ 1 ng/µL Mîqdar: ≥ 30 ng Xerabûn an qirêjbûn bi sînor an tune
| Lisersekinî Biha
OD260/280
OD260/230
Xerabûn an qirêjbûn bi sînor an tune
| ≥ 40 ng/µL 4 μg / şaneya herikînê / nimûne
1.7-2.2
≥1.5 | Lisersekinî Biha
OD260/280
OD260/230
Xerabûn an qirêjbûn bi sînor an tune | ≥ 50 ng/µL 10 μg / şaneya herikînê / nimûne
1.7-2.2
1,8-2,5 |
| Amadekirina Pirtûkxaneya bê PCR: Konsantrekirin≥ 40 ng/µL Hejmar≥ 500 ng | |||||
Xizmeta Kar Herikîna
Sample delivery
derxistina DNA
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Radestkirina daneyan
Di nav de analîzên jêrîn hene:
- Kontrola Kalîteya Daneyên Raw
- Statîstîkên lihevhatinê bi genomê referansê re
- Nasnameya Variant: SNP, InDel, SV û CNV
- Annotation fonksîyonel yên variants
Statîstîkên lihevhatinê bi genomê referansê - dabeşkirina kûrahiyê ya rêzkirinê
SNP di nav gelek nimûneyan de bang dike
Nasnameya InDel - statîstîkên dirêjahiya InDel li herêma CDS û herêma genomê
Dabeşkirina cûrbecûr li seranserê genomê - Plana Circos
Annotasyona fonksiyonel a genan bi guhertoyên naskirî - Gene Ontology
Chai, Q. et al. (2023) 'A glutathione S-transferase GhTT19 bi rêgezkirina berhevkirina anthocyanin di pembû de pigmentasyona pelên kulîlkan diyar dike', Plant Biotechnology Journal, 21 (2), r. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
Cheng, H. et al. (2023) 'Jenoma Hevea brasiliensis ya çolê di asta kromozomê de amûrên nû peyda dike ji bo cotkirina bi alîkariya genomîk û cîhên hêja ji bo bilindkirina hilberîna gomê', Plant Biotechnology Journal, 21 (5), rûpel 1058-1072. doi: 10.1111/PBI.14018.
Li, A. et al. (2021) 'Genomeya îstirîdeya estuarine li ser bandora avhewayê û plastîkbûna adapteyî nihêrînên peyda dike', Communications Biology 2021 4:1, 4(1), rûp. 1–12. doi: 10.1038/s42003-021-02823-6.
Zeng, T. et al. (2022) 'Analîzkirina guherînên genom û metîlasyonê di mirîşkên xwecihî yên Çînî de bi demê re têgihîştina parastina cureyan peyda dike', Communications Biology, 5(1), rûpel 1–12. doi: 10.1038/s42003-022-03907-7.
