Evolution Genome, Pangenome
Pan-Genome çi ye?
Evidences Accumulated destnîşan dike ku variance di navbera stûrên cûda yên cûrbecûr de dikare mezin be. Yek genim yek ji têra xwe pir dûr e ku tevahiya wêneyê agahdariya genetîkî ya cûreyek yekane bistîne. Armanca xwendina Pan-Genome ji bo wergirtina grafikek genomîk a berbiçav e û ji hêla Civata Genetîkî ya Genetîkî û Kifşên Genetîkî ve, ku destûrê dide cûrbecûr cûrbecûr û berfirehiya cûrbecûr cûrbecûr.
Trendên xwendina pan-genome
Hêjmar 1 Pêşbazên kaxezên lêkolînê yên Pan-Genome hatine weşandin.
Nîşe: Hêjmar encama girtina "Pan-Genome" wekî peyva sereke ji bo lêgerîna sernavên gotarên ku di xwezayê de hatine weşandin, hucre û zanistên rêze
yek. Ji gelek nimûneyên pirjimar têne xwendin li ser referansek û kesên unaligned têne civandin di kontigên romanê de. Bi zêdekirina van danûstandinên romanê li ser rêzika referansa bingehîn, referansek pangenome dikare were çêkirin. Herêmên belavkirî li gorî nexşeyê têne destnîşankirin ku hemî dixwînin pişta pangenê.
b. Meclîsa Novo ya Genomesê ya Genomên Pirjimar Destûr dide ku nêzîkî hevahengiyên hevbeş ên jenome ji bo naskirina herêmên genomîk ên belavkirî.
c. Grafikek Pan-Genome dikare ji tevahî li hevahiyên genome an ji hêla Meclîsa Grafîkî ya De Novo ve were çêkirin, ku bi bandor agahdariya guhêzbar a herêmên belavkirî wekî riyên bêhempa bi navgîniya grafîkê dikire.
Meriv çawa panekek ava dike?
Figureikil 2 Berhevdana nêzîkatiyên Pan-Genome1
yek. Ji gelek nimûneyên pirjimar têne xwendin li ser referansek û kesên unaligned têne civandin di kontigên romanê de. Bi zêdekirina van danûstandinên romanê li ser rêzika referansa bingehîn, referansek pangenome dikare were çêkirin. Herêmên belavkirî li gorî nexşeyê têne destnîşankirin ku hemî dixwînin pişta pangenê.
b. Meclîsa Novo ya Genomesê ya Genomên Pirjimar Destûr dide ku nêzîkî hevahengiyên hevbeş ên jenome ji bo naskirina herêmên genomîk ên belavkirî.
c. Grafikek Pan-Genome dikare ji tevahî li hevahiyên genome an ji hêla Meclîsa Grafîkî ya De Novo ve were çêkirin, ku bi bandor agahdariya guhêzbar a herêmên belavkirî wekî riyên bêhempa bi navgîniya grafîkê dikire.
Di van demên dawî de Pan-Genomes weşand
Pan Pan-Gen-Gen2
Pan-Tomato Pan-Genomes 3
● PAN -GENOME4
● Sunflower Pan-Genome5
● Soybean Pan-Genome 6
● Pan-Genome7
● Barley Pan-Genome8
● Pan-genoma genim9
Sorghum Pan-Genome10
● PHYTOPLANKTON PAN-GENOME11
Balkêşî
1. Bayer Pe, Golicz Aa, Scheben A, Batley J, Edwards D. San Plant Pan Referansa Nû ye. Nebatên nat. 2020; 6 (8): 914-920. DOI: 10.1038 / S41477-020-0733-0
2. Song JM, Guan Z, Hu J, et Al. Heşt genimên bilind-kalîteya bilind-avjeniya Pan-Genome diyar dikin ku cûdahiya ekotipe ya brassica napus. Nebatên nat. 2020; 6 (1): 34-45. DOI: 10.1038 / S41477-019-0577-7
3. Gao l, gonda ez, sun h, et al. Tomato Pan-Genome genên nû vedişêre û arîkalek birêkûpêk a rêjeya fêkî ye. Nat Genet. 2019; 51 (6): 1044-1051. DOI: 10.1038 / S41588-019-0410-2
4. Zhao Q, Feng Q, Lu H, et al. Analîzên Pan-Genome bi qasî guhertina genomîkî li orîstê çandî û çolê vedigire [sererastkirina weşandî di genet Nat de xuya dike. 2018 Tebax; 50 (8): 1196]. Nat Genet. 2018; 50 (2): 278-284. DOI: 10.1038 / S41588-018-0041-Z
5. Hübner S, Bercovich N, ToDesco M, et al. Analîzên Pan-Genome Sunflower destnîşan dike ku hybridization guherîn û berxwedana genim guherî. Nebatên nat. 2019; 5 (1): 54-62. DOI: 10.1038 / S41477-018-0329-0
6. liu y, du h, li p, et al. Pan-genoma soybeansên çol û çandî. Hûcre. 2020; 182 (1): 162-176.e13. DOI: 10.1016 / j.cell.2020.05.023
7. Qin p, lu h, du h, et al. Pan-Genome analîzên genimê cihêreng cûrbecûr cûrbecûr cûrbecûr cûrbecûr dike [weşana serhêl li pêş çapê, 2021 Gulan 25]. Hûcre. 2021; s0092-8674 (21) 00581-x. DOI: 10.1016 / j.cell.2021.04.046
8. Jayakodi M, PadMarasu S, Haberer G, et al. Paneya Bar-Genomî mîrasa veşartî ya mutasyonê ya mutasyonê diyar dike. Awa. 2020; 588 (7837): 284-289. DOI: 10.1038 / S41586-020-2947-8
9. Walkowiak S, Gao L, Monat C, Et Al. Genomên genimê pirjimar di çirûskek nûjen de guhertina gerdûnî diyar dikin. Awa. 2020; 588 (7837): 277-283. DOI: 10.1038 / S41586-020-2961-X
10. Tao Y, Luo H, Xu J, et al. Guhertina berfireh di nava pan-genomê ya Sorghum-ê ya çandî û Wilde [Serhêl pêş de çapê çapê, 2021 Gulan 20]. Nebatên nat. 2021; 10.1038 / S41477-021-00925-X. DOI: 10.1038 / S41477-021-00925-X
11. fan x, qiu h, han w, et al. Pangenome Pangenome veguhestina genimên berbiçav ên prozeryotî ya berbiçav eşkere dike. Sci adv. 2020; 6 (18): EABA0111. Published 2020 Apr 29. DOI: 10.1126 / sciadv.aba0111
Demjimêra paşîn: Jan-04-2022