Rêzika metatranscriptomê
Taybetmendiyên karûbar
● RRNA DEPLETION Li dû amadekirina pirtûkxaneya MRNA ya MRNA.
● Sequencing li ser Illumina Novaseq.
Karûbarên karûbar
●Guherandinên civakên microbial tevlihev bixwînin:Ev di asta veguhastinê de diqewime û genimên nû yên potansiyel vedibêje.
●Ravekirina danûstandinên civaka mîkrobîkî bi mêvandar an jîngehê re.
●Analysis Bioinformatic: Ev di derheqê berhevokên baca baca civakê û fonksiyonel de, û her weha analîzên vegotinê yên cuda jî peyda dike.
●Annotasyona Gene ya Berfireh:Bikaranîna databasên fonksiyonê yên genim ji bo agahdariya ragihana genimên agahdariyê ji civakên microbial.
●Piştgiriya piştî firotanê:Baweriya me ji serdema karûbarê 3-mehî ya 3-mehî derbas dibe. Di vê demê de, em follow-up-up proje pêşkêş dikin, arîkariya pirsgirêkan, û Q & A danişîn ji bo çareserkirina her pirsnameyên têkildar.
Taybetmendiyên karûbar
| Platforma sequencing | Stratejiya Sequencing | Daneyên pêşniyaz kirin | Kontrola kalîteya daneyê |
| Illumina Novaseq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Pêdiviyên nimûneyê
| Tevlihevî (ng / μl) | Mîqdara giştî (μg) | Qumar (μL) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | Rin |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Karê karûbarê diherike
Delivery Sample
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzikname
Analîziya daneyê
Karûbarên piştî firotanê
Analîzên jêrîn pêk tîne:
Control Kontrola Kontrola Daneyên Sequencing
Meclîsa transcript
● Annotation Taxonal û Berhem
● Annotation Fonksiyonel
● hejmartina derbirînê û analîzên cihêreng
Dabeşkirina baca her nimûneyê:
Analîzên cihêrengiya beta: Upgma
Annotation Fonksiyonel - Gotin
Bacêkirina baca ciyawaz - Lefse
Pêşkeftinên ku ji hêla Meta Meta Transcriptomics ve hatî saz kirin bi navgîniya berhevoka qonaxên qamyonan ve hatî lêgerîn.
LU, Z. ET AL. (2023) 'Bi toleransa acîdê ya bakterî ya bacteroidalesê ya bacteroidales re têkildar dibe ku pêşîlêgirtina acidoza ruminal di nav bizinên ku bi parêzek bilind-elbetkirî ve girêdayî ye',Xwarina heywanan, 14, PP. 130-140. DOI: 10.1016 / J.Aninu.2023.0.05.006.
Song, Z. Et Al. (2017) 'Microbiota Fonksiyonel a Unraveling di fermentasyona Dewleta Yekbûyî ya kevneşopî de ji hêla amûrên bilind-dorpêçkirî û rêzika metatranscriptomics',Di mîkrobiolojiyê de, 8 (Jul). DOI: 10.3389 / fmicb.2017.01294 / tijî.
Wang, W. et al. (2022) 'Romana Mycoviruses ji lêkolînek metatranscriptomîk a Fungus Fungus vedîtin',Vîrus, 14 (11), p. 2552. DOI: 10.3390 / V14112552 / S1.
Wei, J. Et Al. (2022) 'Analîzkirina metatranscriptomê ya paralel eşkere dike ku ji hêla beytles û sembiontsên wan ên gûtî ve metabolên navîn ên nebatan diyar dike',Molecular Herêmparêzî, 31 (15), PP. 3999-4016. DOI: 10.1111 / MEC.16557.
