Meclîsa Genome ya Bingeha Hi-C
Hi-C rêbazek e ku ji bo girtina veavakirina kromozomê hatiye çêkirin bi berhevkirina danûstendinên li ser bingeha nêzikbûnê û rêzgirtina berbi bilind. Tê bawer kirin ku tundiya van têkiliyan bi dûrbûna laşî ya li ser kromozoman re bi neyînî ve girêdayî ye. Ji ber vê yekê, daneyên Hi-C ji bo rênîşandana kombûn, rêzkirin, û rêwerzkirina rêzikên berhevkirî di pêşnumayek genomê de têne bikar anîn û wan li ser hejmareke diyarkirî ya kromozoman girêdide. Di nebûna nexşeyek genetîkî ya nifûsê de, ev teknolojiyê kombûnek genom a asta kromozomê hêz dike. Her genomek yekane pêdivî bi Hi-C heye.
Taybetmendiyên Xizmetê
● Rêzkirina li ser Illumina NovaSeq bi PE150.
● Xizmet hewce dike ku nimûneyên tevnvîsê, li şûna asîdên nukleîk ên hatine derxistin, bi formaldehîdê ve werin girêdan û danûstendinên DNA-proteîn biparêzin.
● Ezmûna Hi-C bi sînorkirin û tamîrkirina dawî ya dawiya zeliqandî bi biotin re vedihewîne, li dûv wê jî bi dorvegerkirina dawiya nebatên ku encam têne peyda kirin digel ku têkiliyan diparêze. Paşê ADN bi mûçikên streptavîdîn tê kişandin û ji bo amadekirina pirtûkxaneyê ya paşîn tê paqij kirin.
Avantajên Service
Berhevoka Hi-C
(Lieberman-Aiden E et al.,Zanist, 2009)
●Rakirina Pêdiviya Daneyên Nifûsa Genetîkî:Hi-C agahdariya bingehîn a ku ji bo lêvekirina domdar hewce dike cîh digire.
●Dendika nîşankera bilind:rê li ber rêjeyek guheztinê ya bilind a li jor 90%.
●Pispor û tomarên weşanê yên berfireh:BMKGene bi zêdetirî 2000 bûyerên Civîna Genome ya Hi-C ji 1000 celebên cihêreng û patentên cihêreng xwedan ezmûnek mezin e. Zêdetirî 200 dozên hatine weşandin xwedan faktorek bandorek berhevkirî ya zêdeyî 2000 e.
●Tîma biyoinformatîk a pir jêhatî:digel patentên hundurîn û mafên nermalavê yên ji bo ceribandinên Hi-C û analîza daneyê, nermalava daneya dîtbarî ya xwe-pêşkeftî rê dide blokên bi destan veguheztin, vegerandin, betalkirin û ji nû ve kirin.
●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi serdemek karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.
●Annotation Berfireh: Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel genan bi cûrbecûrên naskirî bişopînin û analîza dewlemendkirina têkildar pêk bînin, li ser gelek projeyên lêkolînê nihêrînek peyda bikin.
Specifications Service
| Amadekirina pirtûkxaneyê | Stratejiya rêzgirtinê | Hilberîna daneya pêşniyarkirî | Kontrola kalîteyê |
| Pirtûkxaneya Hi-C | Illumina NovaSeq PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
Sample Requirements
| Desmal | Mîqdara pêwîst |
| Animal Viscera | ≥ 2 g |
| Animal Muscle | |
| Xwîna Mamikan | ≥ 2 ml |
| Mirîşk / Xwîna Masî | |
| Nebat- Pelê teze | ≥ 3 g |
| Hucreyên Çandî | ≥ 1x107 |
| Mêşik | ≥ 2 g |
Xizmeta Kar Herikîna
Design Experiment
Sample delivery
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
1) Daneyên xav QC
2) Pirtûkxaneya Hi-C QC: Texmîna danûstendinên Hi-C yên derbasdar
3) Civîna Hi-C: komkirina pevgirêdan di koman de, li dûv wê rêzkirina domdar di nav her komê de û destnîşankirina rêgezek hevgirtî
4) Nirxandina Hi-C
Pirtûkxaneya Hi-C QC - texmînkirina cotên pêwendiya derbasdar ên Hi-C
Civîna Hi-C - statîstîk
Nirxandina post-civînê - nexşeya germê ya xurtbûna sînyala di navbera çîtikan de
Pêşketinên ku ji hêla karûbarên meclîsa Hi-C yên BMKGene ve têne hêsan kirin bi navgîniya berhevokek weşanan ve bigerin.
Tian, T. et al. (2023) 'Civîna genomê û veqetandina genetîkî ya germplazmaya misrî ya berxwedêr a berbiçav', Nature Genetics 2023 55:3, 55 (3), rûpel 496-506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
Wang, ZL et al. (2020) 'Meclîsek Pîvana Kromozomê ya Genomeya Hingivê Apis cerana ya Asyayî', Sînorên di Genetîkê de, 11, r. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
Zhang, F. et al. (2023) 'Eşkerekirina pêşkeftina biosenteza alkaloid tropane bi analîzkirina du genomên di malbata Solanaceae de', Nature Communications 2023 14:1, 14 (1), rûpel 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
Zhang, X. et al. (2020) 'Genomên Dara Banyan û Waspê Pollinatorê Têgihîştina Hevevolusyona Fig-Wasp pêşkêş dikin', Cell, 183(4), rûp. 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
