Exclusive Agency for Korea

BMKCloud Têkeve

Products

Têkiliya Kromatînê ya li ser bingeha Hi-C

Hi-C rêbazek e ku ji bo girtina veavakirina genomîk bi berhevkirina danûstendinên li ser bingeha nêzikbûnê û rêzgirtina berbi-bilind ve hatî çêkirin hatî çêkirin. Rêbaz li ser girêdana kromatînê ya bi formaldehîdê ve girêdayî ye, li dûv wê helandin û ji nû ve girêdana bi vî rengî ku tenê perçeyên ku bi hevahengî ve girêdayî ne dê hilberên girêdanê çêbikin. Bi rêzkirina van hilberên lîgasyonê, meriv dikare rêxistina 3D ya genomê lêkolîn bike. Hi-C vekolîna belavkirina beşên genomê yên ku bi sivikî têne pak kirin (parçeyên A, euchromatin) û îhtîmal e ku ji hêla veguheztinê ve çalaktir in, û deverên ku hişktir têne pak kirin (parçeyên B, Heterochromatin) vekolîn dike. Her weha Hi-C dikare were bikar anîn ji bo destnîşankirina Domênên Têkildar ên Topolojîkî (TAD), deverên genomê yên ku xwedan strukturên pelçiqandî ne û îhtîmal e ku şêwazên vegotinê yên mîna wan hebin, û ji bo destnîşankirina xelekên kromatîn, herêmên DNA yên ku ji hêla proteînan ve bi hev ve girêdayî ne û pir caran di hêmanên birêkûpêk de dewlemend dibin. Karûbarê rêzgirtina Hi-C ya BMKGene hêz dide lêkolîneran ku pîvanên cîhêyî yên genomîkê bikolin, rêyên nû ji bo têgihiştina rêziknameya genome û bandorên wê yên di tenduristî û nexweşiyê de vedikin.

Paqij bûn

Details Service

Bioinformatics

Encamên Demo

weşanên diyarkirî

Taybetmendiyên Xizmetê

● Rêzkirina li ser Illumina NovaSeq bi PE150.

● Xizmet hewce dike ku nimûneyên tevnvîsê, li şûna asîdên nukleîk ên hatine derxistin, bi formaldehîdê ve werin girêdan û danûstendinên DNA-proteîn biparêzin.

● Ezmûna Hi-C bi sînorkirin û tamîrkirina dawî ya dawiya zeliqandî bi biotin re vedihewîne, li dûv wê jî bi dorvegerkirina dawiya nebatên ku encam têne peyda kirin digel ku têkiliyan diparêze. Paşê ADN bi mûçikên streptavîdîn tê kişandin û ji bo amadekirina pirtûkxaneyê ya paşîn tê paqij kirin.

Avantajên Service

●Design Enzyme Restriction Optimal: Ji bo ku li ser cureyên cihêreng karîgeriyek Hi-C ya bilind bi 93% cotên danûstendina derbasdar peyda bike.

●Pisporên Berfireh û Qeydên Weşanê:BMKGene bi> 2000 projeyên rêzgirtina Hi-C ji 800 cureyên cihêreng û patentên cihêreng xwedan ezmûnek mezin e. Zêdetirî 100 dozên hatine weşandin ku bi faktorek bandorek berhevkirî ji 900 zêdetir e.

●Tîma Bioinformatics ya pir jêhatî:bi patentên hundurîn û mafên nermalavê yên ji bo ceribandinên Hi-C û analîzkirina daneyê û nermalava daneya dîtbarî ya xwe-pêşkeftî.

●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi serdemek karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.

●Annotation Berfireh: Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel genan bi cûrbecûrên naskirî bişopînin û analîza dewlemendkirina têkildar pêk bînin, li ser gelek projeyên lêkolînê nihêrînek peyda bikin.

Specifications Service

Pirtûkxane

Stratejiya Sequencing

Hilberîna daneya pêşniyarkirî

Çareserkirina sînyala Hi-C

Pirtûkxaneya Hi-C

Illumina PE150

Xala kromatînê: 150x

TAD: 50x

Xala Kromatînê: 10 Kb

TAD: 40 Kb

Pêdiviyên Xizmetê

Tîpa nimûne	Mîqdara pêwîst
Tevna heywanan	≥2g
Tevahiya Xwînê	≥2mL
Fungi	≥1g
Nebat- tevna ciwan	1 g / aliquot, 2-4 aliquot pêşniyar kirin
Hucreyên Çandî	≥1x10⁷

Pêşî: Kit RNA ya Nebatê Magnetic Smart TGuide

Piştî: Pirtûkxaneyên DNBSEQ yên pêş-çêkirî

Analîza jêrîn vedihewîne:

● Daneyên xav QC;

● Nexşekirin û pirtûkxaneya Hi-C QC: cotên danûstendinê yên derbasdar û Nîşaneyên Hilweşîna Têkilî (IDE);

● Profîlkirina Têkiliya Genome-yê berfireh: analîza cis/trans û nexşeya pêwendiya Hi-C;

● Analîzkirina dabeşkirina dabeşkirina A/B;

● Nasnameya TAD û lûpên kromatîn;

● Analîza cihêreng a li ser hêmanên avahiya kromatînê ya 3D di nav nimûneyan de û annotasyona fonksiyonel a têkildar a genên têkildar.

Cis û belavkirina rêjeya trans

Nexşeya germê ya danûstendinên kromozomî yên di navbera nimûneyan de

Belavbûna genom-berfireh a beşên A/B

Belavbûna genom-berfireh a lûpên kromatînê

Visualization of TADs

Pêşveçûnên lêkolînê yên ku ji hêla karûbarên rêzgirtina Hi-C yên BMKGene ve têne hêsan kirin bi navgîniya berhevokek weşanan ve bigerin.

Meng, T. et al. (2021) 'Analîzek pir-omîk a yekbûyî ya berawirdî CA2 wekî armancek nû ya chordoma destnîşan dike',Neuro-Onkolojî, 23(10), rûpel 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.

Xu, L. et al. (2021) 'Neorganîzekirina 3D û ji nû ve verastkirina genomê ji hêla Hi-C, Nanopore, û rêzgirtina RNA ya yekbûyî ve têgihîştina pathogenesis NAFLD peyda dike',Acta Pharmaceutica Sinica B, 11 (10), rûpel 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.