Analîzên Komeleya Genome-Wide
Xebata xebatê
Karûbarên karûbar
●Tomarbûnên pispor û weşanên berfireh: Bi ezmûna berhevkirî ya li Gwas, Bmkgene projeyên bi sedan cureyên di lêkolîna Gwas-ê de qedand, beşdarî lêkolînerên alîkar kirin ku zêdetirî 100 gotaran belav bikin, û faktora bandora hevokan gihîşt 500.
● Analîzên Bioinformatics: Workflow di nav analîzkirina komeleya SNP-ê de, radestkirina komek genimên namzedê û annotasyona wan ya têkildar radest dike.
●Tîmê biyoinformatên pir jêhatî û cîvakek analîzên kurt: Bi ezmûna mezin di Analysis Genomics Pêşkeftî de, Tîmê Bmkgene bi demek kurt a turnaround re analîzên berfireh radigihîne.
●Piştgiriya piştî firotanê:Baweriya me ji serdema karûbarê 3-mehî ya 3-mehî derbas dibe. Di vê demê de, em follow-up-up proje pêşkêş dikin, arîkariya pirsgirêkan, û Q & A danişîn ji bo çareserkirina her pirsnameyên têkildar.
Taybetmendiyên karûbarê û daxwazên karûbarê
| Cureya rêzgirtinê | Pîvana nifûsa pêşniyar kirin | Stratejiya Sequencing | Pêdiviyên Nucleotide |
| Tevahiya Genome | 200 nimûneyên | 10x | Hezkirin: ≥ 1 ng / μl Mêjûya giştî 30ng Sînorkirin an jî bêserûberbûn an konteynir |
| Parçeyek amûrek taybetî-locus (slaf) | Kûrahiya Tagê: 10x Hejmara Tags: <400 MB: WGS tê pêşniyar kirin <1 GB: 100k Tags 1 GB > 2 GB: 300k Tags Max 500k Tags | Hêjmar ≥ 5 ng / μl Mîqdara tevahî 80 ng Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5 Agarose Gel: NO an DEGRADATION OR LIMITED
|
Hilbijartina Materyalê
Cûrbecûr cûrbecûr, subpecies, landraces / genebanks / malbatên tevlihev / çavkaniyên çolê
Cûrbecûr cûrbecûr, subpecies, landraces
Malbata Half-Sib / Malbata Full-Sib / Resourcesavkaniyên Wild
Karê karûbarê diherike
Sêwirana ezmûnê
Delivery Sample
RNA derxistina
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzikname
Analîziya daneyê
Karûbarên piştî firotanê
Analîzên jêrîn pêk tîne:
- Analîziya Komeleya Genome-Wide: lm, lmm, emmax, fastlmm model
- Annotationalakiya Fonksiyonel ya Genesên Namzetê
Analîzkirina Komeleya SNP-Trait - Plot Manhattan
Analîzkirina Komeleya SNP-Trait - QQ Plot
Pêşkeftinên ku ji hêla Karûbarên Bmkgene ve Weşana Bmkgene ve hatî saz kirin bi navgîniya berhevkirina weşangerî:
LV, L. ET AL. (2023) 'Insirêj li bingeha genetîkî ya Ammonia Tolonance li Razor Clam Sinonovacula Constricta bi xwendina hevsengiya Genome-Wide',Aquubulture, 569, p. 739351. DOI: 10.1016 / J.Aquaculture.2023.739351.
Li, X. ET AL. (2022) 'Analîzên Multi-Omics ji 398 têketinên millet ên Foxtail herêmên genomîk ên ku bi domandin, taybetmendiyên metabolî re têkildar in,Nebatê molekulî, 15 (8), PP. 1367-1383. DOI: 10.1016 / J.MOLP.2022.07.003.
Li, J. Et Al. (2022) 'Komeleya Komeleya Genome-Wide ya ku di hawîrdora davêjî de nexşeya bêserûber a bêhêz e',Li pêşberî zanistiya nebatê, 13, p. 924892. DOI: 10.3389 / Fpls.2022.924892 / BibtEx.
Zhao, X. et al. (2021) 'GMST1, ku sulfotransferase vediqetîne, berxwedana li ser Virus Soybean Mozaic Virus G2 û G3',Nebat, hucre & jîngehê, 44 (8), PP. 2777-2792. DOI: 10.1111 / PCE.14066.
