Genetics pêşveçûn
Karûbarên karûbar
Takagi et al.,Kovara nebatê, 2013
●Analysis BioinformaticGirtina cûrbecûrbûna genetîkî, ku potansiyela pêşkeftî ya cûrbecûr nîşan dide,
●Analîzên xwerû yên bijartî: wek texmîna texmînkirina dem û leza li ser bingeha guhertinên li asta nucleotide û amino acîd.
●Tomarbûnên pispor û weşanên berfireh: Bmkgene ji zêdetirî 15 salan, bi hezaran cureyên girseyî, hwd, hwd, bi hezaran cure, hwd.
Tîmê Bioinformatên pir jêhatî û cîvakek analîzên kurt: Bi ezmûna mezin di Analysis Genomics Pêşkeftî de, Tîmê Bmkgene bi demek kurt a turnaround re analîzên berfireh radigihîne.
Piştgiriya Firotina Post-firotanê:Baweriya me ji serdema karûbarê 3-mehî ya 3-mehî derbas dibe. Di vê demê de, em follow-up-up proje pêşkêş dikin, arîkariya pirsgirêkan, û Q & A danişîn ji bo çareserkirina her pirsnameyên têkildar.
Taybetmendiyên karûbarê û daxwazên karûbarê
| Cureya rêzgirtinê | Pîvana nifûsa pêşniyar kirin | Stratejiya Sequencing | Pêdiviyên Nucleotide |
| Tevahiya Genome | ≥ 30 kes, bi ≥ 10 kesan ji her subgroup
| 10x | Hezkirin: ≥ 1 ng / μl Mêjûya giştî 30ng Sînorkirin an jî bêserûberbûn an konteynir |
| Parçeyek amûrek taybetî-locus (slaf) | Kûrahiya Tagê: 10x Hejmara Tags: <400 MB: WGS tê pêşniyar kirin <1 GB: 100k Tags 1 GB > 2 GB: 300k Tags Max 500k Tags | Hêjmar ≥ 5 ng / μl Mîqdara tevahî 80 ng Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5 Agarose Gel: NO an DEGRADATION OR LIMITED
|
Karê karûbarê diherike
Sêwirana ezmûnê
Delivery Sample
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzikname
Analîziya daneyê
Karûbarên piştî firotanê
Xizmet analîzkirina avahiya nifûsê (dara phylogenetic, PCA, nexşeya stasyona nifûsê), cihêrengiya nifûsê, û hilbijartina nifûsa (girêdana girêdana selective ya selective Xizmet dikare di nav de analîzên xwerû (mînakî dema davêjî, genê jî).
*Encamên Demo li vir têne nîşandan hemî ji genomên ku bi Bmkgene hatine weşandin
1. Analîzkirina navgîniyê avakirina dara phylogenetîkî, avahiyên nifûsê û PCA li ser bingeha cûrbecûrên genetîkî.
Dara Phylogenetic di nav cûreyên bi bav û kalên hevbeş de têkiliyên baconomîk û pêşkeftî temsîl dike.
PCA armanc dike ku di navbera sub-nifûsa de nêzîkatiyê bibîne.
Struktura nifûsê hebûna sub-nifûsa genetîkî ya bi gelemperî di warê frekansên Allele de nîşan dide.
Chen, et. al.,Pnas, 2020
2.Selective sweep
Selektîf li ser pêvajoyek ku ji hêla pêvajoyek ve hatî hilbijartin û frekansên ji malperên neutir ên girêdayî ve têne hilbijartin û yên ku ji malperên bêpergal kêm dibin, encama kêmkirina herêmî kêm dibin.
Dîtina genome-berfireh li herêmên sweet ên seleksiyonê bi hesabkirina nifûsa nifûsê (π, fst, Tajima) ya hemî Snps (100 KB) di hin gav (10 KB) de.
Cihêrengiya nucleotide (π)
Tajima's D
Indeksa rastkirinê (FST)
Wu, et. al.,Nebatê molekulî, 2018
3.Gene diherike
Wu, et. al.,Nebatê molekulî, 2018
4. Dîroka Edemografî
Zhang, Et. al.,Ekolojiya Xwezayî & Evolution, 2021
5.Divergence Time
Zhang, Et. al.,Ekolojiya Xwezayî & Evolution, 2021
Pêşkeftinên ku ji hêla karûbarên genetîkî yên Bmkgene ve hatî sazkirin bi navgîniya berhevkirina weşangeriyê ve hatine lêgerîn:
Hassanyar, ak et al. (2023) Kifşkirina nîşangirên molekuler û genimên namzetê yên SNP-ê bi berxwedana vîrusê ya SacBrood re li Apis Cerana Cerana bi tevahî-genome vekir ',Kovara Navneteweyî ya Zanistên Molekuler, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS24076238.
Chai, j. et al. (2022) 'Kifşkirina çolê, salnamander a genetîkî ya genetîkî ya bi gelemperî derfetên parastina nû diafirîne',Lêkolînên Zoolojîk, 2022, vol. 43, Issue 3, Rûpelên: 43 (3), rûpel 469-480. DOI: 10.24272 / J.IsSn.2095-8137.2022.101.
Han, M. Et Al. (2022) 'Pîvana Phylogeografîk û Evolution Evolution Dîroka Indigenous Elymus Sibiricus L. li ser Qinghai-Tibetan Plateau',Li pêşberî zanistiya nebatê, 13, p. 882601. DOI: 10.3389 / fpls.2022.882601 / BIBTEX.
Wang, J. Et al. (2022) 'Serhildanên genomîk di pêşkeftina Longan de ji civata kromozome-asta kromozome û genomên nifûsa longan re',Lêkolîna Horticulture, 9. DOi: 10.1093 / HR / UHAC021.
