Rêzkirina mRNA ya Eukaryotî-NGS
Features
● Girtina mRNA ya poly berî amadekirina pirtûkxaneyê
● Amadekirina pirtûkxaneya mRNA ya arasteyî ya vebijarkî ji bo bidestxistina daneya rêzikên rêzikan-taybetî
● Analîzkirina biyoinformatîk a vegotina genê û avahiya transkriptê
Avantajên
●Pisporê Berfireh: Tîma me li BMKgene zêdetirî 600,000 nimûneyan pêvajo kir, cûrbecûr cûrbecûr nimûneyên wekî çandên şaneyê, tevn û şilavên laş vedihewîne. Em ji her projeyê re dewlemendiyek ezmûnê tînin û zêdetirî 100,000 projeyên mRNA-Seq di warên cihêreng ên lêkolînê de bi serfirazî qedandine.
●Kontrola Kalîteyê ya hişk: Em xalên kontrolê yên bingehîn di hemî qonaxan de bicîh dikin, ji amadekirina nimûne û pirtûkxaneyê bigire heya rêzkirin û biyoinformatics. Vê çavdêriya berbiçav peydakirina encamên domdar ên bi kalîte misoger dike, ji we re piştrast dike ku projeya we di destên pêbawer de ye.
●Annotation Berfireh: Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel Genên Bi Ciyawazî Derbirandî (DEG) şîrove bikin û analîzên dewlemendkirina têkildar pêk bînin. Vê nêzîkatiya berfireh di derheqê pêvajoyên hucreyî û molekulî yên ku di binê bersiva transcriptome de ne nihêrînek peyda dike, û piştrast dike ku hûn di derheqê encamên projeya xwe de bi tevahî agahdar in.
●Piştgiriya Post-Firotinê: Peymana me ji temamkirina projeyê bi heyama karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî re dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.
Sample Requirements û Delivery
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzgirtinê | Daneyên pêşniyar kirin | Kontrola Kalîteyê |
| Poly A dewlemend kirin | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
Pêdiviyên Nimûne:
Nukleotîd:
| Pevçûn (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijiyê | Linavketinî | |
| Pirtûkxaneya Standard | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Li ser gêlê bi proteîn an ADN-ê bi sînorkirî an tune. | Ji bo nebatan: RIN≥4.0; Ji bo heywanan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindbûna bingehîn ya sînorkirî an tune |
| Pirtûkxaneya Directional | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Li ser gêlê bi proteîn an ADN-ê bi sînorkirî an tune. | Ji bo nebatan: RIN≥4.0; Ji bo heywanan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindbûna bingehîn ya sînorkirî an tune |
● Nebat:
Root, Stem an Petal: 450 mg
Pel an tov: 300 mg
Fêkî: 1,2 g
●Teba:
DIL an Rovî: 300 mg
Viscera an Mejî: 240 mg
Masûlk: 450 mg
Hestî, por an çerm: 1g
● Arthropods:
Kêzik: 6g
Crustacea: 300 mg
● Tevahiya xwînê: 1 lûle
● Hucreyên: 106 hucreyan
Pêşniyara Sample Delivery
Konteyner: 2 ml lûleya santrîfujê (Polê tin nayê pêşniyar kirin)
Etîketkirina nimûneyê: Kom+kobar, mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Barkirin:
1. Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne di torbeyan de bêne pakkirin û di qeşa hişk de bêne veşartin.
2. Tîpên tabloya ARN: Nimûneyên RNA dikarin di lûleya stabîlîzasyona ARN-ê de bêne hişk kirin (mînak RNAstable®) û di germahiya odeyê de bêne şandin.
Xizmeta Kar Herikîna
Design Experiment
Sample delivery
Derxistina RNA
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Bioinformatics
Eukaryotî Xebata analîzkirina rêza mRNAyê
Bioinformatics
ØKontrolkirina kalîteya daneya xav
ØLihevkirina genomê ya referansê
ØAnalîzkirina avahiya transcript
ØHêjdarkirina îfadeyê
ØAnalîza îfadeya cuda
ØAnnotation û dewlemendkirina fonksiyonê
Alignment Genome Reference
Têrbûna daneyan
Têkilî û nirxandina nimûneyên dubareyên biyolojîkî
Genên Ciyawazkirî (DEG)
Annotation Fonksiyonel yên DEGs
Dewlemendkirina Fonksiyonel ya DEG
Pêşketinên ku ji hêla karûbarên rêzkirina eukaryotîkî yên NGS mRNA yên BMKGene ve têne hêsan kirin bi navgîniya berhevokek belavokan vekolin.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan û triclocarban kapasîteya bîhnxweşiya masiyên zêrîn qels dike bi astengkirina naskirina bîhnxweş, têkbirina veguheztina sînyala bîhnxweşiyê, û tevlihevkirina pêvajoyek agahdariya bîhnxweşiyê', Lêkolîna Avê, 233, r. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus p11 mirovan direvîne da ku fagozomên fungal ber bi riya ne-hilweşînker vegerîne', Cell Host & Microbe, 31(3), rûp 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Faktorên Veguheztina TCP yên Di Pêşkeftina Pevçûn a Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro) de têkildar in', Frontiers in Plant Science, 13, r. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'Genoma Chrysanthemum lavandulifolium û mekanîzmaya molekulî ya ku di binê cûreyên cûrbecûr yên kapîtulûmê de ye', Lêkolîna Baxçevaniyê, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Nanoreaktorek cascade ji bo zêdekirina terapiya sonodînamîkî ya li ser penceşêra kolorektal bi navgîniya zêdekirina ROS-a synergistic û astengkirina otofagiyê', Nano Today, 49, r. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
