Circrna Sequencing-illumina
Taybetmendiyên
● Dezgeha RRNA li pey amadekirina pirtûkxaneya rêwerzan, daneyên rêzika strand-taybetî-taybetî bicîh kir.
● Workflow Workflow Bioinformatic Pêşbîniya Circrna û Grûpa Gotinê
Karûbarên karûbar
●Pirtûkxaneyên RNA yên Berfireh:Em di amadekariyên pêşdebirina RNA-yê de li şûna xalîçeya RNA bikar tînin.
●Analîzên vebijarkî yên Torgilokên RNA (Cerna) RNA: Pêşniyarên kûr di mekanîzmayên birêkûpêk ên hucreyî de peyda dike
●Pisporiya berfireh: Bi tomara track ya pêvajoyê zêdetirî 20,000 nimûneyên li Bmkgene, cûrbecûr cûrbecûr cûrbecûr û projeyên LNCRNA, tîmê me dewlemendiyek ji her projeyê re tîne.
●Kontrola kalîteya hişk: Em li ser hemî qonaxan, ji amadekirina nimûneyê û pirtûkxaneyê ji rêza nimûne û pirtûkxaneyê bicîh dikin. Vê çavdêriya metirsîdar radestkirina encamên bi domdarî yên bi domdarî dike.
Piştgiriya Post-firotanê: Baweriya me ji serdema 3-meh a piştî firotanê ya 3-mehê derbas dibe. Di vê demê de, em follow-up-up proje pêşkêş dikin, arîkariya pirsgirêkan, û Q & A danişîn ji bo çareserkirina her pirsnameyên têkildar.
Pêdiviyên nimûne û radestkirinê
| Pirtûkxane | Rawesta axaftevan | Daneyên pêşniyazkirî | Data QC |
| RRNA Pirtûkxaneya Directional Depleed | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Pêdiviyên nimûneyê:
Nucleotides:
| Kon. (Ng / μl) | Mîqdara (μg) | Qiralîtî | Linavketinî |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Tixûbdar an proteîn an konteynirek DNA li ser gel tê nîşandan. | Rin≥6.0; 5.0≥28S / 18s≥1.0; Limited Limited an No Bingehîn |
● Plants:
Root, stem an petal: 450 mg
Leaf an tov: 300 mg
Fêkî: 1.2 g
● Animal:
Dil an zikê: 450 mg
Viscera an mejî: 240 mg
Muscle: 600 mg
Hestî, por an çerm: 1.5g
Arthropods:
Insanan: 9g
Crustacea: 450 mg
● xwîna tevahî:2 tubes
● Hucreyan: 106 hûner
● Serum û Plasma: 6 ml
Delivery Nimûneya Pêşniyar
Container: 2 ML Centrifuge TUBE (Foil Tin nayê pêşniyar kirin)
Labelê nimûneyê: Koma + dubare bikin mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Firotin:
1. Pîvaza-berfê: Divê nimûneyên ku di nav bagajan de têne pak kirin û di berfê ya hişk de têne veşartin.
2 Tubên Rnastable: Nimûneyên RNA dikarin di Tubên Stabê RNA de rûnin (mînak, Rnastable®) û li germahiya odeyê şandin.
Karê karûbarê diherike
Sêwirana ezmûnê
Delivery Sample
RNA derxistina
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzikname
Analîziya daneyê
Karûbarên piştî firotanê
Bioinformatics
Pêşbîniya Circrna: Belavkirina kromozomal
Circrnas cuda camcrnas - volcano plot
Circrnas cuda camcrnas - Kulîlkên Hierarchical
Dewlemendiya fonksiyonel a genên mêvandar ên Circrna
Pêşkeftinên lêkolînê lêkolîn bikin ku ji hêla Bmkgene 'Seqeencing Seqeencing Seqeencing bi navgîniya komeleyek curated ya weşangeriyê ve hêsantir bikin.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 Damezrandina Circrna û Micrornna Gene ya ku di carcinoma hepatocellular de bêdeng dike', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), 40 (25), 40 (25), 40. 4338-4351. DOI: 10.1038 / S41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'SPRIFTRAYA RNAYA RNAPER RNA133 RNA133 Di berxwedana nexweşî de bi rêzgirtina îfadeya Osarab di Rice', Fytopathology, 5 (1), rûpel. 1-14. doi: 10.1186 / S42483-023-00188-8 / hejmarên / 6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 balansa veguhastina dorpêç û linear di carcinoma hepatocellular de modul dike'. DOI: 10.21203 / Rs.R.RS-2418311 / V1.
Zhang, Y. Et Al. (2023) 'nirxandina berfireh a Circrnas li Circrnas Cardiomyopiya Cirrhotic berî û piştî veguheztina kezebê', Immunopharmacology International, 114, p. 109495. DOI: 10.1016 / J.InTimp.2022.109495.
