●Analîza Bioinformatîk a Pêşketî û Annotasyona Berfireh:Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel genên ku bi herêmên girêdana proteîn-ADN-ê ve girêdayî ne şîrove bikin, li ser pêvajoyên hucreyî û molekulî yên di bin danûstendinê de têgihiştinê peyda dikin.
●Piştgiriya Piştî Firotanê:Pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi serdemek karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku pirsên ku bi encaman ve girêdayî ne çareser bikin.
●Tecrûbeya Berfireh:Bi tomarek şopandina bi serfirazî ya pir projeyên ChIP-Seq, pargîdaniya me zêdetirî deh salan pisporiyê tîne ser maseyê. Tîma meya analîzê ya pir jêhatî, digel naverokek berfireh û piştgiriya piştî firotanê, serkeftina projeyên we misoger dike.
● Kontrola Kalîteya hişk: Em xalên kontrolê yên bingehîn di hemî qonaxan de bicîh dikin, ji amadekirina nimûne û pirtûkxaneyê bigire heya rêzkirin û biyoinformatics. Vê çavdêriya berbiçav peydakirina encamên domdar ên bi kalîte misoger dike.
Pirtûkxane | Stratejiya Sequencing | Hilberîna daneya pêşniyarkirî | Kontrola kalîteyê |
Piştî Immunoprecipitation DNA paqij kirin | Illumina PE150 | 10 Gb | Q30≥85% Guhertina bisulfite > 99% Karbidestiya birrîna MspI> 95% |
Bi tevahî: ≥10 ng
Dabeşkirina mezinahiya perçeyê: 100-750 bps
Di nav de analîzên jêrîn hene:
● Kontrolkirina kalîteya daneya xam
● Peak bang li ser bingeha nexşeyê ji bo genoma referansê
● Şîrovekirina genên lûtkeyê
● Analîzkirina motîfê: Nasnameya cîhên girêdana faktora transkrîpsiyonê (TFBS)
● Analîz û annotasyon Peak Cûdahî
Nirxandina dewlemendkirina nêzîkî Malperên Destpêka Veguheztinê (TSS)
Belavbûna genomê ya lûtkeyên CHIP-ê
Dabeşkirina herêmên lûtkeyê
Dewlemendkirina fonksiyonel a genên girêdayî lûtkeyê (KEGG)