Analîziya Segregant ya Bulked
Karûbarên karûbar
Takagi et al., Kovara Plant, 2013
Herêmîbûna rastîn: Bi zêdebûna girseyan bi 30 + 30 heta 200 + 200 kes ji bo kêmkirina dengê paşîn; pêşbîniya herêma hevdû ya non-sinonymous.
● Analîzên berfireh: Namzetmendiya Kevir Gene Annotation, di nav de NR, Swissprot, go, keg, cog, kog, hwd.
● Demê zivirandinê zûtir: Herêmîbûna Rapid Gene di nav 45 rojên xebatê de.
Tecrubeya Berfireh: BMK bi hezaran herêmî an jî herêmên cihêreng beşdarî kir, ku cûreyên cihêreng mîna çandiniyê, hilberên avê, daristan, daristan, fêkî, fêkiyan vedihewîne.
Taybetmendiyên karûbar
Gelî:
Progeny ji dêûbavan re bi fenotîpên dijber re veqetîne.
M.En F2 Progeny, Backcrossing (BC), Line Inbred Recombinant (Ril)
Hewşa tevlihevkirinê
Ji bo taybetmendiyên kalîteyî: 30 û 50 kes (kêmtirîn 20) / bulk
Ji bo tratis santitative: Top 5% ji 10% ji 10% kesan bi fenotîpên zehfî yên di tevahiya nifûsê de (kêmtirîn 30 + 30).
Kûrahiya rêzika pêşniyazkirî
Bi kêmî ve 20x / dêûbav û 1x / Offspring Kesek (mînakî ji bo Kişandina Poolê Mixabûna 30 + 30 Kesane, Kûrahiya Sequencing dê 30x per bulk be)
Analîzên bioinformatics
● Bi tevahî vexwendinê
Processing Daneyên
● SNP / indel bang kirin
● Screging herêma namzetê
● fonksiyonê genimê genê
Pêdiviyên nimûne û radestkirinê
Pêdiviyên nimûneyê:
Nucleotides:
| Gdna Sample | Nimûneya tansiyonê |
| Hêjbûn: ≥30 NG / μL | Nebat: 1-2 g |
| Mîqdar: ≥2 μg (Volumn ≥15 μl) | Heywan: 0.5-1 g |
| Paqij: OD260 / 280 = 1.6-2.5 | Tevahiya xwînê: 1.5 ml |
Karê karûbarê diherike
Sêwirana ezmûnê
Delivery Sample
RNA derxistina
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzikname
Analîziya daneyê
Karûbarên piştî firotanê
1.Association Analysis about on Euclidean Distance (Ed) ji bo naskirina herêma namzedê. Di kesayeta jêrîn de
X-Axis: Hejmara kromozom; Her dot nirxek ED-ê ya SNP temsîl dike. Rêzika reş bi nirxa ed-ê ve girêdayî ye. Nirxek ED ya bilindtir komeleyek girîng a di navbera malper û fenotipê de nîşan dide. Rengê Red Dash tîrêja Komeleya Girtî nîşan dide.
2.association Analîzasyona Bingehîn Bê Snp-Indeks
X-Axis: Hejmara kromozom; Her dot nirxa snp-index destnîşan dike. Rêza Reş ji bo nirxa SNP-SNP-ê ya Fitted radiweste. Nirxa mezintir e, komeleya girîngtir e.
BMK Case
Traitiyayê Mezinahî yên Mezin Locus FNL7.1 Kevirek dereng a proteînek pir a ku bi dirêjahiya fêkî ya ku bi dirêjahiya stûyê fêkî ve girêdayî ye
Weşandin: Kovara Kovara Bioteknolojiyê Plant, 2020
Stratejiya Sequencing:
Dêûbav (Jin5-508, YN): Bi tevahî ji bo 34 × û 20 ×.
DNA Pools (50 dirêj-stû û 50 kurt û kurt): ji bo 61 × û 52 × û 52
Encamên sereke
Di vê lêkolînê de, nifûsa veqetandinê (F2 û F2: 3) ji hêla xaça dirêj-stûyê xeta dirêj-stûyê JIN5-508 û kurt-stûyê YN hate çêkirin. Du hewşên DNA ji hêla 50 takekesên dirêj ên dirêj û 50 tundîyên tund ên tundtir hatin çêkirin. Major-Effect QTL li ser Chr07 ji hêla analîzên BSA û nexşeya kevneşopî ya QTL ve hate nasîn. Herêma namzetê ji bo nexşeya xweş-nexşeyê, ji hêla serlêdana genimê û ezmûnên transgenic ve hat teng kirin, ku di kontrolkirina çandina stûyê, CSFNL7.1 de diyar kir. Wekî din, polymorphism di CSFNL7.1 herêma Promoter de hate dîtin ku bi vegotina têkildar re têkildar e. Zêdetir analîzên phylogenetic pêşniyar kir ku fnl7.1 locus pir mimkun e ku ji Hindistanê were.
 QTL-Mapping li Analysis BSA da ku herêma namzedê bi dirêjahiya koka kapasîtî re têkildar bike |  Profîlên Lod ên QTL-ê ya QTL-ê li ser Chr07 nas kirin |
Xu, X., et al. "Traitiyayê Mezin-bandorker Locus FNL7.1 Kevirek dereng a proteînek bêkêmasî ya ku bi dirêjahiya stûyê fêkî re têkildar e." Kovara Junechnology a Plant 18.7 (2020).
