BMKMANU S3000_Transkriptoma Cihanî
BMKMANU S3000 Bernameya Teknîkî ya Transcriptome Cihanî
Features
- Resolution: 3,5 μM
- Dirêjahiya deqê: 2,5 μM
- Hejmara deqan: Nêzîkî 4 Milyon
- 3 formatên qada girtina gengaz: 6,8 mm * 6,8 mm, 11 mm * 11 mm an 15 mm * 20 mm
- Her berika barkodkirî bi primerên ku ji 4 beşan pêk tên barkirî ye:
• dûvika poly(dT) ji bo primkirina mRNA û senteza cDNA,
• Nasnameya Molekulê ya Yekta (UMI) ji bo rastkirina biasiya mezinbûnê
• Barcode Cihanî
• Rêzeya girêdanê ya xwendina qismî 1 rêziksaziyê
- H&E û rengkirina beşan fluorescent
- Ihtîmala karanîna teknolojiya dabeşkirina şaneyê: entegrasyona rengdêra H&E, rengkirina floransent, û rêzgirtina RNA ji bo destnîşankirina sînorên her şaneyê û bi rêkûpêk vegotina genê ji her şaneyê re destnîşan dike. Pêvajoya analîza profîlkirina cîhê ya jêrîn li ser bingeha şaneya hucreyê.
- Mumkun e ku meriv analîza çareseriyê ya pir-astî bi dest bixe: Analîzek pir-asta maqûl ku ji 100um heya 3.5 um digire da ku taybetmendiyên cihêreng ên tevneyê di çareseriya çêtirîn de çareser bike.
Avantajên BMKMANU S3000
-Dubarekirina cihên girtina 4 Milyon: bi çareseriyek çêtir a 3.5 uM, dibe sedema bilindbûna gen û UMI-ê li ser hucreyê. Ev encam dibe sedema kombûna hucreyan a li ser bingeha profîlên veguheztinê, bi hûrguliyên hûrtir ên ku bi strukturên tevnvîsê re têkildar in.
- Çareserkirina bin-hucreyî:Her qada girtinê zêdetirî 2 mîlyon Deqên Barkodkirî yên fezayî yên bi dirêjahiya 2,5 μm û ferqa 5 μm di navbera navendên deqê de vedihewîne, ku analîza transkrîptomeya fezayî ya bi çareseriya bine-hucreyî (5 μm) gengaz dike.
-Analîza çareseriyê ya pir-ast:Analîzek pir-asta maqûl ku ji 100 μm heya 5 μm digire da ku taybetmendiyên cihêreng ên tevneyê di çareseriya çêtirîn de çareser bike.
-Ihtîmala karanîna teknolojiya dabeşkirina hucreyê "Se di yek slide" de:rengdêra fluoresansê, rengkirina H&E, û rêzkirina RNA li ser yek slaydekê berhev dike, algorîtmaya meya analîzê ya "sê-di-yek" nasîna sînorên hucreyê ji bo transkrîptomîka paşîn a hucreyê hêz dike.
-Bi gelek platformên rêzgirtinê re hevaheng e: Hem NGS û hem jî rêzgirtina dirêj-xwendin heye.
-Sêwirana maqûl a 1-8 qada girtina çalak: Mezinahiya qada girtinê maqûl e, bi karanîna 3 formatan mimkun e (6,8 mm * 6,8 mm., 11 mm * 11 mm û 15 mm * 20 mm)
-Xizmeta yek-stop: Hemî tecrube û gavên li ser bingehê jêhatîbûnê, di nav de kriyo-beşkirin, rengkirin, xweşbîniya tevnvîsê, barkodkirina cîhê, amadekirina pirtûkxaneyê, rêzkirin, û biyoinformatics yek dike.
-Bioinformatîkên Berfireh û dîmendera bikarhêner-heval a encaman:pakêt 29 analîz û 100+ reqemên kalîteya bilind vedihewîne, bi karanîna nermalava pêşkeftî ya hundurîn re ji bo dîtin û xweşkirina dabeşkirina hucreyê û komkirina deqê.
-Analîz û dîtbariya daneya xwerû: ji bo daxwazên lêkolînên cihêreng hene
-Tîmek teknîkî ya pir jêhatî: bi ezmûna zêdetirî 250 cureyên tevnvîsê û 100+ cureyên di nav de mirov, mişk, memik, masî û nebatan.
-Li ser tevahiya projeyê nûvekirinên di demek rastîn de: bi kontrolkirina tevahî ya pêşkeftina ceribandinê.
-Analîza hevbeş a vebijarkî bi rêzgirtina mRNA ya yek-hucreyî
Specifications Service
| Sample Requirements | Pirtûkxane | Stratejiya Sequencing | Daneyên Pêşniyar kirin | Kontrola Kalîteyê |
| Nimûneyên cryo yên OCT-ê yên bicîbûyî (Dîrêjê çêtirîn: nêzîk. 6×6×6 mm³) 2 blokên her nimûne 1 ji bo ceribandinê, 1 ji bo hilanînê | Pirtûkxaneya cDNA ya S3000 | Illumina PE150 | 160K PE xwendin li 100υM (250 Gb) | RIN > 7 |
Ji bo bêtir agahdarî li ser rêbernameya amadekirina nimûneyê û xebata karûbarê karûbarê, ji kerema xwe bi dilxwazî biaxivin apisporê BMKGENE
Xizmeta Kar Herikîna
Di qonaxa amadekirina nimûneyê de, ceribandinek destpêkî ya derxistina RNA ya girseyî tê kirin da ku pê ewle bibe ku RNA-ya kalîteya bilind dikare were bidestxistin. Di qonaxa optimîzasyona tevnê de beş têne rengkirin û xuyang kirin û şert û mercên permeabilîzasyonê ji bo serbestberdana mRNA ji tevneyê xweştir dibin. Dûv re protokola xweşbînkirî di dema avakirina pirtûkxaneyê de, li dûv rêzkirin û analîza daneyê tê sepandin.
Karûbarê karûbarê bêkêmasî nûvekirinên rast-ê û pejirandinên xerîdar vedihewîne da ku dorvegerek bersivdayînê bidomîne, ku pêkanîna projeyek bêkêmasî misoger dike.
Daneyên ku ji hêla BMKMANU S3000 ve hatî hilberandin bi karanîna nermalava "BSTMatrix", ku ji hêla BMKGENE ve serbixwe ve hatî sêwirandin, tê analîz kirin, asta hucreyê û çareseriya pir-astî Gene Expression Matrix çêdike. Ji wir, raporek standard tê hilberandin ku tê de kontrolkirina kalîteya daneyê, analîza nimûneya hundurîn û analîza nav-komê vedihewîne.
- Kontrola Kalîteya Daneyê:
- Hilberîna daneyê û dabeşkirina pîvana kalîteyê
- Tespîtkirina genê li her cîhê
- Vegirtina tevnê
- Analîzkirina nimûneya hundurîn:
- Dewlemendiya genê
- Komkirina deqê, tevî analîza pîvanê kêmkirî
- Analîzkirina îfadeya cihêreng di navbera koman de: Naskirina genên nîşanker
- Danasîna fonksiyonel û dewlemendkirina genên nîşanker
- Analîza nav-komê
- Ji nû ve berhevkirina deqan ji her du nimûneyan (mînak nexweşî û kontrol) û ji nû ve kombûnê
- Nasnameya genên nîşanker ji bo her komê
- Danasîna fonksiyonel û dewlemendkirina genên nîşanker
- Daxuyaniya Cûda ya heman komê di navbera koman de
Wekî din, BMKGene pêşkeftî "BSTViewer" amûrek bikarhêner-heval e ku destûrê dide bikarhêner ku îfadeya genê dîtbar bike û di çareseriyên cihêreng de kombûnê bibîne.
BMKGene karûbarên profîlkirina cîhê bi çareseriya yek-hucreyê ya rast (li ser bingeha qulika hucreyê an qulika çargoşe ya pirastî ji 100um heya 3,5um) pêşkêşî dike.
Daneyên profîla cîhê ji beşên tevnvîsê yên li ser slide S3000 wekî jêrîn baş pêk hat.
Lêkolîna doza 1: Mejiyê mişkê
Analîza beşa mejiyê mişkê ya bi S3000 di encama tespîtkirina ~ 94 000 hucreyan de, bi rêzgirtina navînî ya ~ 2000 genan ji her şaneyek. Çareserkirina pêşkeftî ya 3.5 uM di encamê de kombûnek pir hûrgulî ya hucreyan li ser bingeha şêwazên veguheztinê, digel komên hucreyan strukturên cihêreng ên mêjî dişibînin. Ev bi hêsanî tê dîtin ku belavkirina hucreyên ku wekî oligodendrocytes û hucreyên mîkroglia têne kom kirin, ku hema hema bi taybetî di maddeya gewr û spî de cih digirin, têne dîtin.
Lêkolîna mesela 2: Embriyoya mişk
Analîza beşa embrîyoya mişkê ya bi S3000 di encama tespîtkirina ~ 2200 000 şaneyan de, bi rêzgirtina navînî ya ~ 1600 genan ji her şaneyê re. Çareseriya pêşkeftî ya 3.5 uM encam da ku li ser bingeha şêwazên veguheztinê, bi 12 koman li devera çav û 28 koman li devera mêjî kombûnek pir berfireh a şaneyan pêk anî.
Kombûna şaneya Analîza Nimûneya hundurîn:
Nasnameya genên nîşanker û belavkirina mekan:
- Çareserkirina jêr-hucreyî ya bilindtir: Li gorî slide S1000, her qada girtina S3000 di nav xwe de> 4 mîlyon Xalên Barkodkirî yên cihî yên bi dirêjahiya 2,5 μm û dûrbûna 3,5 μm di navbera navendên deqê de hene, ku analîza transkrîptoma fezayî bi çareseriya bine-hucreyî ya bilindtir dike. (Binca çargoşe: 3,5 μm).
- Berbiçavgirtina bilindtir: li gorî slide S1000, Median_UMI ji 30% ber 70% zêde dibe, Median_Gene ji 30% ber 60% zêde dibe
Plana çîpê S1000:
Plana çîpê S3000:
