Meclîsa Genoma Bacterial a Novo
Em karûbarek Civata Qereqolek Bacterial a Bacterial pêşkêş dikin, garantîkirina 0 garantî. Ev yek bi yekdestkirina teknolojiyên demdirêj ên demdirêj, mîna nanopor û Pacbio ji bo civîna civînê û xwendina kurtefîlmê ya bi islonê re ji bo pejirandina meclîsê û sererastkirina çewtiyê ya li ser xwendin. Karûbarê me ji bo analîzasyona çalakî, fonksiyonel, û analîzên bioinformatic ên pêşkeftî, xebata bioinformatic a pêşkeftî peyda dike, pêkanîna armancên lêkolînê yên taybetî. Ev karûbar ji bo lêkolînên cûda yên genetîkî û genomîk pêşveçûna genimên rastîn ên referansê dide. Wekî din, ew bingeha serlêdanên wekî xweşbîniya hişk, endezyariya genetîkî, û pêşkeftina mîkrobîkî, pêk tîne
Taybetmendiyên karûbar
● Bi du vebijarkên gengaz ên ku ji girêdayîgirtina li ser asta xwestina bi tevahî ya bi tevahî hilbijêrin.
● Vebijarka Genome: Sequencing kurt-xwendin bi Illumina Novaseq PE150.
● 0 Gap Genome.
Sektura dirêj-xwendin li ser nanopore Promethion 48 an Pacbio Revio ji bo Meclîsa Genome.
Sektura xwendinê ya kurt li ser Illumina Novaseq ji bo erêkirina Genome û sererastkirina çewtiyê (nanopore) an pêşnumayek genomê çêbikin.
Karûbarên karûbar
●Zero-Gap Genome garantî kir: Ev ji ber entegrebûna sequencinglonê sequencing bi rêzika xwendinê ya dirêj (nanopore an pacbio).
●Workflow Workflow Bioinformatic:Ev di nav de Meclîsa Genome û pêşbîniya gelek elementên genomîk, annotasyona genimê ya fonksiyonel, û visualisations genome wek komploya circos.
●Pisporiya berfireh: Bi zêdetirî 20,000 Genomên mîkrobîkî civiyabûn, BMKGene bi dehsala tecrûbeyê, tîmek analîzên pir jêhatî, naverok, û piştgiriyek paşîn a piştî firotanê ya hêja,
●Piştgiriya piştî firotanê:Baweriya me ji serdema karûbarê 3-mehî ya 3-mehî derbas dibe. Di vê demê de, em follow-up-up proje pêşkêş dikin, arîkariya pirsgirêkan, û Q & A danişîn ji bo çareserkirina her pirsnameyên têkildar.
●Stratejiyên Sequencing Pirjimar:Ji bo armancên lêkolîn û daxwazên cuda yên bi temamiya genome.
Taybetmendiyên karûbar
| Xizmetkar | Stratejiya Sequencing |
| Pêşnûme Genome | Illumina PE150 100x |
| 0 GAP GENOME | Nanopore 100x + Illumina pe150 100x Or Pacbio Hifi 30x + Illumina PE150 100x (optional) |
Pêdiviyên nimûneyê:
| Tevlihevî (ng / μl) | Mîqdara giştî (μg) | Qumar (μL) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illosina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakterî: ≥3.5x1010 hûner
Karê karûbarê diherike
Delivery Sample
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzikname
Analîziya daneyê
Karûbarên piştî firotanê
Analîzên jêrîn pêk tîne:
Control Kontrola Kontrola Daneyên Sequencing
● Meclîsa Genome
● Analîzên Genome Component: Pêşbîniya CD û hêmanên pirjimar
● Annotation Fonksiyonel Bi Databasên Giştî yên Pirjimar (Go, Kegg, ETC) û Databasên pêşkeftî (karta, VFDB, hwd)
● Dîmenkirina Genome
Em genoma di forma fasta ya bi hêsanî de û pelê salixdana genomê (GFF) peyda dikin.
Annotation Gene - Go
Annotation Gene - Cazy Carbohydrates
Visualization Gence - Plot Circos
Pêşkeftinên ku ji hêla karûbarên Meclîsê yên Bmkgene ve hatî saz kirin bi navgîniya komeleyek curated ya weşangeriyan vegerin.
Dai, W. et al. (2023) 'Discovery of Bacteroides Uniformis F18-22 Wekî bakteriyekî safî û nûjen û nûjen ji bo dermankirina kolîtiya ulcerative ji kolona tenduristiya tendurist',Kovara Navneteweyî ya Zanistên Molekulî, 24 (19), p. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
KANG, Q. ET AL. (2021) 'Proteus Multidrug-berxwedêr Isolates Isolates Blaoxa-1 û Blandm-1 ji çolê li Chinaînê: Rîskek tenduristiya giştî',Zozanê entegre, 16 (6), PP. 798-809. DOI: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, tt et al. (2017) Sekna Genoma ya Dawî ya Endophyte bacillus flexus KLBMP 4941Journal of Bioteknolojî, 260, rûpel 38-41. DOI: 10.1016 / J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Bûyera berxwedanê ya pir-dubare ya Klebsiella navbeynkariya berfireh a genên antîimicrobial',Di mîkrobiolojiyê de, 12, p. 754931. DOI: 10.3389 / fmicb.2021.754931 / Bibtex.
