Sequencing Amplicon (16s / 18s / wê)

Amplicon (16s / 18s / wê) Sequencing bi Illumina re rêbazek analîzkirina cûrbecûr analîzkirina profîlên mîkrobîkî li gorî rêzikên xwe û dûvre di nav her nimûneyan û di navbera nimûneyan de. BmkCloud Amlicon (ngs) Pipeline dihêle analîzên 16s, 18s, genên fonksiyonên wê û pirjimar. Ew bi xwendina xwendinê dest pê dike, civîna kalîteyê û nirxandina kalîteyê, li pey hevgirtina xwendinên wekhev ji bo hilberîna yekîneyên baca baca xebitandinê (OTUS) di şeş beşên analîzên cûda de têne bikar anîn. Annotation Taxonomî agahdarî li ser hebûna têkildar û berhevoka her nimûneyê peyda dike, dema ku ciyawaziya alpha û beta analîz dike ku li ser ciyawaziya mîkrobîkî di hundurê û di navbera nimûneyan, bi rêzdarî de balê dikişîne. Analîzên cihêreng di navbera koman de OTUS bibînin ku ji bo ceribandinên parametrîkî û hem jî ne parametrîkî cûda cûda ye, di heman demê de analîzkirina têkildarî van cûdahiyan bi faktorên jîngehê ve girêdayî ye. Di paşiya paşîn de, giyayê genê ya fonksiyonel li ser bingeha Marker Generansê tê texmîn kirin, di her nimûneyê de fonksiyon û ekolojiyê peyda dike ..