16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Taybetmendiyên Xizmetê
● Platforma rêzgirtinê: PacBio Revio
● Moda rêzgirtinê: CCS (HiFi dixwîne)
● Berê amadekirina pirtûkxaneya zengilê ya HiFi SMRT, li pey hev girêdana amplikonan zêdekirina herêma armanc
Avantajên Service
●Çareserkirina taksonomîkî ya bilind: Than rêzika kurt-amplicon,di asta cureyê de rêjeyên dabeşkirina OTU bilindtir dike.
●Banga bingehîn a pir rast: Rêzkirina moda PacBio CCS (HiFi dixwîne).
●Bê îzolasyon: Nasnameya bilez a pêkhatina mîkrobial di nimûneyên hawîrdorê de.
●Bi berfirehî tê sepandin: Lêkolînên civaka mîkrobial ên cihêreng.
●Analîzek biyoinformatîk a berfireh: Pakêta QIIME2 ya herî dawî (têgihiştina mîqdar a li ser ekolojiya mîkrobial) bi analîzên cihêreng ên di warê databas, annotasyon, OTU/ASV de.
●Pisporê Berfireh: Bi hezaran projeyên rêzgirtina ampliconê ku salane têne kirin, BMKGENE zêdetirî deh salan ezmûnek, tîmek analîzê ya pir jêhatî, naverokek berfireh, û piştevaniya post-firotanê ya hêja tîne.
Specifications Service
| Pirtûkxane | Stratejiya Sequencing | Daneyên pêşniyar kirin |
| Amplicon | PacBio Revio | 10/30/50 K tag (CCS) |
Sample Requirements
| Konsantrekirin (ng/µL) | Hejmara tevahî (μg) | Volume (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Pêşniyara Sample Delivery
Nimûneyan di nîtrojena şil de 3-4 demjimêran bicemidînin û di nîtrojena şil de an -80 derece ji bo veqetandina demdirêj hilînin. Veguheztina nimûneyê bi qeşa hişk hewce ye.
Xizmeta Kar Herikîna
Sample delivery
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Di nav de analîzên jêrîn hene:
●Kontrola kalîteya daneya xam
● Komkirina OTU/Dengê jêbirin (ASV)
● OTU annotation
●Analîzasyona cihêrengiya Alpha: gelek index, di nav de Shannon, Simpson û ACE.
●Analîzkirina cihêrengiya betayê
●Analîzasyona navbera koman
●Analîzasyona pêwendiyê: di navbera faktorên jîngehê û pêkhatin û cihêrengiya OUT de
● 16S pêşbîniya genê fonksiyonel
Histograma belavkirina taksonomî
Dabeşkirina civakê dara fîlogenetîkî
Analîza cihêrengiya alfa: ACE
naverok
Analîza cihêrengiya beta: PCoA
Analîza navkomî: ANOVA
Pêşketinên ku ji hêla karûbarên rêzgirtina amplikonê ya BMKGene bi PacBio re bi navgîniya berhevokek belavokan ve hatî hêsan kirin vekolin.
Gao, X. and Wang, H. (2023) 'Analîzkirina Berawirdî ya Profîl û Fonksiyonên Bakteriya Rumenê di dema Adapkirina bi Fenolojiya Cûda (Regreen vs. Grassy) di Pezê Merino Alpine de bi Du Qonaxên Mezinbûnê li Meadowek Alpine', Fermentation, 9 ( 1), rûp. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) 'Girtina maddeya tarî ya mîkrobîkî ya li axên çolê bi karanîna metagenomîk-based kulturomics û analîzên rezîliya bilind', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), rûp. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'Bandora xwêyên asîda rûnê li ser taybetmendiyên fermentasyonê, cihêrengiya bakteriyan û aramiya aerobî ya sîlaya tevlihev a ku bi alfalfa, stûyê birinc û ceh hatiye amadekirin', Journal of the Science of Food and Agriculture, 102 (4), rûpel 1475- 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) 'Têkiliya di navbera Biyomarkerên Stresa Oksîdatîf û Microbiota Gut de Di Bandorên Antîoksîdan ên Derketiyên ji Sonchus brachyotus DC de. di Stresa oksîdatîf a Rovî ya ku ji hêla Oxazolone ve hatî çêkirin de li Zebrafishê Mezin ', Antioxidants 2023, Vol. 12, Rûpel 192, 12(1), r. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
