16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Taybetmendiyên Xizmetê
● Platforma rêzgirtinê: Illumina NovaSeq.
● Zêdekirina herêmên kurt ên 16S, 18S û ITS, di nav armancên din ên zêdekirinê de.
● Hilbijartinên maqûl ên amplicon.
● Tecrûbeya projeya berê ya bi armancên zêdekirina pirjimar.
Avantajên Service
●Bê îzolasyon:Nasnameya bilez a pêkhateya mîkrobial di nimûneyên hawîrdorê de.
●Resolution Bilind: Di nimûneyên hawirdorê de pêkhateyên kêm-pirr.
●Bi berfirehî sepandin: Lêkolînên civaka mîkrobial ên cihêreng.
●Analîza Bioinformatîk a Berfireh: Pakêta QIIME2 ya herî dawî (têgihiştina mîqdar a li ser ekolojiya mîkrobial) bi analîzên cihêreng ên di warê databas, annotasyon, OTU/ASV de.
●Pisporê Berfireh: Bi 150 hezar projeyên rêzgirtina amplicon ku salane têne kirin, BMKGENE zêdetirî deh salan ezmûnek, tîmek analîzek pir jêhatî, naverokek berfireh, û piştevaniya piştî firotanê ya hêja tîne.
Specifications Service
| Pirtûkxane | Stratejiya Sequencing | Daneyên pêşniyar kirin |
| Amplicon | Illumina PE250 | 50/100/300K tag (Cotên Xwendin) |
Pêdiviyên Xizmetê
| Konsantrekirin (ng/µL) | Hejmara tevahî (ng) | Volume (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Erd/xur: 1-2g
● Naveroka rûvî-heywan: 0,5-2g
● Naveroka rovî-kêzik: 0,1-0,25g
● Rûbera nebatê (nişîna dewlemendkirî): 0,1-0,5g
● Nebata zengînkirî ya şorba fermentasyonê): 0,1-0,5g
● Feq (ajalên mezin): 0,5-2g
● Feq (mişk): 3-5 dexl
● Şîva lavajê ya alveolî ya pişikê: kaxeza parzûnê
● Swaba vajînal: 5-6 tam
● Şûwa çerm/jenîtal/salava/ tevna nermê ya dev/şûpa farîngeal/şûwa rektal: 2-3 şûşe
● Mîkroorganîzmayên rûvî: kaxeza parzûnê
● Bedena avê/hewa/biyofilm: kaxeza parzûnê
● Endofît: 1-2g
● Plaka diranan: 0,5-1g
Xizmeta Kar Herikîna
Sample delivery
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Di nav de analîzên jêrîn hene:
- Kontrolkirina kalîteya daneya xav
- Komkirina OTU /Dengê jêbirin (ASV)
- annotation OTU
- Analîza cihêrengiya Alpha: gelek index, di nav de Shannon, Simpson û ACE.
- Analîza cihêrengiya betayê
- Analîza nav-kom
- Analîza pêwendiyê: di navbera faktorên jîngehê û pêkhatin û cihêrengiya OUT de
- Pêşbîniya genê fonksiyonel a 16S
Histograma belavkirina taksonomî
Nexşeya germê ya komkirina pirbûna taksonomî
Analîza cihêrengiya alfa: kêşa kêmbûnê
analîza cihêrengiya beta: NMDS
Analîza navkomî: Vedîtina biyomarkera LEFSE
Pêşketinên ku ji hêla karûbarên rêzgirtina amplikonê ya BMKGene bi Illumina-ê re bi navgîniya berhevokek weşanan ve hatî hêsan kirin bigerin.
Dong, C. et al. (2022) 'Assembly, Core Microbiota, and Function of the Rhizosphere Soil and Bark Microbiota in Eucommia ulmoides', Frontiers in Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.8553317F
Li, Y. et al. (2023) 'Veguheztina konsorsiyûmê ya bakterî ya sentetîk ji bo dermankirina vagînoza bakterî ya ku di mişkan de ji hêla Gardnerella vaginalis ve hatî çêkirin', Microbiome, 11 (1), rûpel 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. and Liu, H. (2022) 'Mîkrobiomên toza hewayê ku di dema ceribandina piştgirîya jiyanê ya biyojeneratorî ya girtî ya li ser erdê "Lunar Palace 365" de hatine berhev kirin', Microbiomes Jîngeh, 17(1), pp. 1–20. doi: 10.1186 / S40793-022-00399-0 / WÊNE / 8.
Yin, S. et al. (2022) 'Zêdebûna genên fonksiyonel ên girêdayî veguheztina nîtrojenê ku di berhevkirinê de windabûna nîtrojenê kontrol dike', Teknolojiya Bioresource, 361, r. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
