전체 게놈 이중 자료 시퀀싱 (WGBS)
전체 게놈 바이 설 파이트 시퀀싱 (WGBS)은 DNA 메틸화의 심층적 인 탐사, 특히 유전자 발현 및 세포 활성의 중추적 인 조절제 인 시토신 (5-mC)의 5 번째 위치를위한 금 표준 방법론으로서 나타난다. WGB의 기본 원리는 바이 설 파이트 처리를 포함하여, 메틸화 된 시토신을 변하지 않고 메틸화 된 시토신의 우라실 (C에서 U)으로의 전환을 유도한다. 이 기술은 단일 기본 해상도를 제공하여 연구자들이 메틸 로마를 종합적으로 조사하고 특히 암, 특히 암과 관련된 비정상적인 메틸화 패턴을 발견 할 수 있습니다. WGB를 사용함으로써 과학자들은 게놈 전체의 메틸화 환경에 대한 비교할 수없는 통찰력을 얻을 수 있으며, 다양한 생물학적 과정과 질병에 걸쳐있는 후성 유전 학적 메커니즘에 대한 미묘한 이해를 제공 할 수 있습니다.
서비스 기능
● 참조 게놈이 필요합니다.
● Bisulfite 전환 효율을 모니터링하기 위해 Lambda DNA가 첨가됩니다.
● Illumina Novaseq에서 시퀀싱.
서비스 장점
●DNA 메틸화 연구를위한 금 표준:이 성숙한 메틸화 전환 처리 기술은 정확도가 높고 재현성이 우수합니다.
●광범위한 범위 및 단일 기본 해상도 :게놈 전체 수준에서 메틸화 부위의 검출.
●완전한 플랫폼 :샘플 처리, 라이브러리 구성, 시퀀싱, 생물 정보학 분석에서 원 스톱 탁월한 서비스를 제공하십시오.
●광범위한 전문 지식: WGBS 시퀀싱 프로젝트가 다양한 종에 걸쳐 성공적으로 완료되면서 BMKGENE은 10 년 이상의 경험, 고도로 숙련 된 분석 팀, 포괄적 인 콘텐츠 및 우수한 사후 지원 지원을 제공합니다.
●전 사체학 분석과 결합 할 가능성: RNA-Seq와 같은 다른 OMICS 데이터와 WGB의 통합 분석을 허용합니다.
샘플 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장 데이터 출력 | 품질 관리 |
| 바이 설파이트 처리 | 일루미나 PE150 | 30x 깊이 | Q30 ≥ 85% 바이 설 파이트 전환> 99% |
샘플 요구 사항
| 농도 (NG/µL) | 총량 (µg) | 추가 요구 사항 | |
| 게놈 DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | 제한된 저하 또는 오염 |
서비스 작업 흐름
샘플 전달
DNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
데이터 전달
다음 분석을 포함합니다.
● 원시 시퀀싱 품질 관리;
● 기준 게놈에 대한 매핑;
● 5MC 메틸화 염기의 검출;
● 메틸화 분포 및 주석 분석;
● 차등 메틸화 영역 (DMR)의 분석;
● DMRS와 관련된 유전자의 기능성 주석.
5MC 메틸화 검출 : 메틸화 부위의 유형
메틸화 맵. 5MC 메틸화 게놈 전체 분포
고도로 메틸화 된 영역의 주석
차등 적으로 메틸화 된 영역 : 관련 유전자
차별적으로 메틸화 된 영역 : 관련 유전자의 주석 (유전자 온톨로지)
선별 된 간행물 모음을 통해 BMKGENE의 전체 게놈 비 설파이트 시퀀싱 서비스에 의해 촉진 된 연구 진보를 탐색하십시오.
팬, Y. et al. (2020) '전체 게놈 바이 설 파이트 시퀀싱을 사용한 양 해골 근육 발달 동안 DNA 메틸화 프로파일의 분석',BMC 유전체학, 21 (1), pp. 1–15. doi : 10.1186/s12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) '비닐 클로라이드에 노출 된 노동자의 새로운 데 옥시 리보 핵산 메틸화 섭동',독성학 및 산업 건강, 38 (7), pp. 377–388. doi : 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) '숙성 토마토 과일에서 게놈 메틸화, 비 코딩 RNA 수준, mRNA 및 대사 산물 사이의 관계',Plant Journal, 103 (3), pp. 980–994. doi : 10.1111/tpj.14778.
