감소 된 바이 설 파이트 시퀀싱 (RRBS)
감소 된 표현 바이 설 파이트 시퀀싱 (RRBS)은 DNA 메틸화 연구에서 전체 게놈 바이 설 파이트 시퀀싱 (WGB)에 대한 비용 효율적이고 효율적인 대안으로 부상되었다. WGBS는 단일 기본 해상도에서 전체 게놈을 검사하여 포괄적 인 통찰력을 제공하지만 높은 비용은 제한 요인이 될 수 있습니다. RRBS는 게놈의 대표적인 부분을 선택적으로 분석하여 전략적으로 이러한 도전을 완화시킨다. 이 방법론은 MSPI 절단에 의한 CPG 섬이 풍부한 영역의 농축에 의존하고 200-500/600 bps 단편의 크기 선택에 의존합니다. 결과적으로, CPG 섬에 근접한 지역 만 시퀀싱되는 반면, 먼 CPG 섬을 가진 지역은 분석에서 제외됩니다. 바이 설 파이트 시퀀싱과 결합 된이 과정은 DNA 메틸화의 고해상도 검출을 허용하고, 시퀀싱 접근법 인 PE150은 구체적으로 중간이 아닌 삽입물의 끝에 초점을 맞추고 메틸화 프로필의 효율을 증가시킨다. RRBS는 비용 효율적인 DNA 메틸화 연구를 가능하게하고 후성 유전 적 메커니즘에 대한 지식을 발전시키는 귀중한 도구입니다.
서비스 기능
● 참조 게놈이 필요합니다.
● Lambda DNA는 바이 설 파이트 전환 효율을 모니터링하는 데 사용됩니다.
● MSPI 소화 효율도 모니터링됩니다.
● 식물 샘플의 이중 효소 소화.
● Illumina Novaseq에서 시퀀싱.
서비스 장점
●WGB에 대한 비용 효율적이고 효율적인 대안: 분석 활성화는 더 낮은 비용으로 샘플 요구 사항을 낮추십시오.
●완전한 플랫폼 :샘플 처리, 라이브러리 구성 및 시퀀싱에서 생물 정보학 분석에 대한 원 스톱 탁월한 서비스를 제공하십시오.
●광범위한 전문 지식: RRBS 시퀀싱 프로젝트가 다양한 종에 걸쳐 성공적으로 완료되면서 BMKGENE은 10 년 이상의 경험, 고도로 숙련 된 분석 팀, 포괄적 인 콘텐츠 및 우수한 사후 지원 지원을 제공합니다.
서비스 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장 데이터 출력 | 품질 관리 |
| MSPI 소화 및 바이 설 파이트 처리 라이브러리 | 일루미나 PE150 | 8GB | Q30 ≥ 85% 바이 설 파이트 전환> 99% MSPI 절단 효율> 95% |
샘플 요구 사항
| 농도 (NG/µL) | 총량 (µg) |
| |
| 게놈 DNA | ≥ 30 | ≥ 1 | 제한된 저하 또는 오염 |
서비스 작업 흐름
샘플 전달
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 판매 서비스
다음 분석을 포함합니다.
● 원시 시퀀싱 품질 관리;
● 기준 게놈에 대한 매핑;
● 5MC 메틸화 염기 및 모티프 식별의 검출;
● 메틸화 분포 및 샘플 비교의 분석;
● 차등 메틸화 영역 (DMR)의 분석;
● DMRS와 관련된 유전자의 기능성 주석.
품질 관리 : 소화 효율 (게놈 매핑)
품질 관리 : 바이 설 파이트 전환 (메틸화 정보 추출)
메틸화 맵 : 5MC 메틸화 게놈 전체 분포
샘플 비교 : 주요 구성 요소 분석
차등 적으로 메틸화 된 영역 (DMRS) 분석 : 히트 맵
선별 된 간행물 모음을 통해 BMKGENE의 전체 게놈 비 설파이트 시퀀싱 서비스에 의해 촉진 된 연구 진보를 탐색하십시오.
Li, Z. et al. (2022) 'CRISPR 활성화 및 파라 크린 인자에 의해 Leydig- 유사 세포로 고 충실도 재 프로그래밍',PNAS NEXUS, 1 (4). doi : 10.1093/pnasnexus/pgac179.
Tian, H. et al. (2023) '중국 단일 접합 쌍둥이에서 신체 조성의 게놈 전체 DNA 메틸화 분석',유럽 임상 연구 저널, 53 (11), p. E14055. doi : 10.1111/eci.14055.
Wu, Y. et al. (2022) ''DNA 메틸화 및 허리-힙 비율 : 중국 monozygotic 쌍둥이에서의에게 유전자 전체 연관 연구 ',내분비학 연구 저널, 45 (12), pp. 2365–2376. doi : 10.1007/s40618-022-01878-4.
