원핵 생물 RNA 시퀀싱
특징
● RNA 샘플 처리에는 RRNA 고갈과 방향성 RNA 라이브러리 제조가 포함되었습니다.
● 기준 게놈에 대한 정렬에 따른 생물 정보학 분석
● 분석에는 유전자 발현 및 DEGS뿐만 아니라 전사 구조 및 SRNA 분석이 포함됩니다.
서비스 장점
●엄격한 품질 관리: 우리는 샘플 및 라이브러리 준비에서 시퀀싱 및 생물 정보학에 이르기까지 모든 단계에서 핵심 제어 지점을 구현합니다. 이 세심한 모니터링은 지속적으로 고품질 결과를 제공합니다.
●가닥-특이 적 시퀀싱 데이터: RNA 라이브러리 제조가 방향성이므로, 안티 스센스 전 사체를 식별 할 수있게되면.
●원핵 생물 전 사체에 맞게 조정 된 완전한 분석: 생물 정보 파이프 라인에는 유전자 발현의 분석뿐만 아니라 오페론, UTR 및 프로모터의 식별을 포함한 전 사체 구조의 분석도 포함됩니다. 또한 SRNA의 분석, 즉 2 차 구조 및 표적의 주석 및 예측이 포함됩니다.
●판매 후 지원: 우리의 약속은 3 개월간의 사후 서비스 기간으로 프로젝트 완료를 넘어 확장됩니다. 이 기간 동안 우리는 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q & A 세션을 제공하여 결과와 관련된 쿼리를 해결합니다.
샘플 요구 사항 및 전달
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터가 권장됩니다 | 품질 관리 |
| rRNA는 방향성 라이브러리를 고갈시켰다 | 일루미나 PE150 | 1-2 GB | Q30 ≥85% |
샘플 요구 사항 :
| conc. (ng/μl) | 양 (μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280 = 1.8-2.0 OD260/230 = 1.0-2.5 겔에 표시된 단백질 또는 DNA 오염이 제한적이거나 없음. | RINMARE6.5 |
권장 샘플 전달
용기 : 2ml 원심 분리기 (주석 호일 권장되지 않음)
샘플 라벨링 : 그룹+복제 EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
선적:
1. 드라이 아이스 : 샘플은 가방에 포장되어 드라이 아이스에 묻어 야합니다.
2. RNASTable 튜브 : RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브 (예 : RNastable®)에서 건조시키고 실온으로 선적 될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
샘플 전달
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 판매 서비스
생물 정보 분석 워크 플로
다음 분석을 포함합니다.
● 원시 데이터 품질 관리
● 기준 게놈에 정렬
● 라이브러리 품질 평가 : RNA 조각화 무작위성, 크기 및 시퀀싱 채도 삽입
● 예측 된 코딩 유전자의 기능적 주석
● 표현 분석 : 상관 및 주요 구성 요소 분석 (PCA)
● 차등 유전자 발현 (degs)
● DEGS의 기능성 주석 및 농축
● SRNA 분석 : 예측, 주석, 대상 및 2 차 구조 예측
● 성적 증명서 구조 분석 : 오페론, 시작 및 종료 위치, 번역되지 않은 영역 (UTS), 프로모터 및 SNP/indel 분석
시퀀싱 포화
코딩 유전자의 기능적 주석
샘플 간의 상관 관계
미분 발현 유전자 (DEGS) 분석
기능적 농축 분석
SRNA 주석
이 특집 간행물에서 BMKGENE의 나노 포어 전장 mRNA 시퀀싱 서비스에 의해 촉진 된 발전을 탐구하십시오.
Guan, CP et al. (2018) '소피아 alopecuroides의 총 알칼로이드에 반응하는 바이오 필름 형성 포도상 구균 epidermidis의 글로벌 전 사체 변화',폴란드 미생물학 저널, 67 (2), p. 223. doi : 10.21307/PJM-2018-024.
