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BMKMANU S3000_공간전사체
공간 전사체학은 과학적 혁신의 최전선에 서서 연구자들이 공간적 맥락을 보존하면서 조직 내의 복잡한 유전자 발현 패턴을 조사할 수 있도록 지원합니다. 다양한 플랫폼 속에서 BMKGene은 3.5μm의 향상된 해상도를 자랑하고 세포 이하 범위에 도달하며 다단계 해상도 설정이 가능한 BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip을 개발했습니다. 약 400만 개의 스팟을 갖춘 S3000 칩은 공간 바코드 캡처 프로브가 로드된 비드가 층층이 쌓인 마이크로웰을 사용합니다. 공간 바코드가 풍부한 cDNA 라이브러리는 S3000 칩에서 준비되고 이후 Illumina NovaSeq 플랫폼에서 시퀀싱됩니다. 공간적으로 바코드가 표시된 샘플과 UMI의 조합은 생성된 데이터의 정확성과 특이성을 보장합니다. BMKManu S3000 칩은 매우 다재다능하여 다양한 조직과 원하는 세부 수준에 맞게 미세 조정할 수 있는 다단계 해상도 설정을 제공합니다. 이러한 적응성은 칩을 다양한 공간 전사체 연구를 위한 탁월한 선택으로 자리매김하여 최소한의 소음으로 정확한 공간 클러스터링을 보장합니다. BMKManu S3000의 세포 분할 기술을 사용하면 전사 데이터를 세포 경계까지 구분할 수 있어 직접적인 생물학적 의미를 갖는 분석이 가능합니다. 또한, S3000의 향상된 해상도로 인해 세포당 더 많은 수의 유전자와 UMI가 검출되어 공간 전사 패턴과 세포 클러스터링을 훨씬 더 정확하게 분석할 수 있습니다.
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단일핵 RNA 서열 분석
높은 처리량의 시퀀싱과 결합된 단일 세포 포획 및 맞춤형 라이브러리 구축 기술의 개발은 세포 수준에서 유전자 발현 연구에 혁명을 일으켰습니다. 이러한 획기적인 발전을 통해 복잡한 세포 집단에 대한 보다 심층적이고 포괄적인 분석이 가능해졌으며, 모든 세포에 대한 유전자 발현 평균화와 관련된 한계를 극복하고 이러한 집단 내의 진정한 이질성을 보존할 수 있었습니다. 단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)은 부인할 수 없는 장점을 가지고 있지만, 단일 세포 현탁액 생성이 어렵고 신선한 샘플이 필요한 특정 조직에서는 어려움에 직면합니다. BMKGene에서는 최첨단 10X Genomics Chromium 기술을 사용하여 단일 핵 RNA 시퀀싱(snRNA-seq)을 제공함으로써 이러한 장애물을 해결합니다. 이 접근법은 단일 세포 수준에서 전사체 분석이 가능한 샘플의 스펙트럼을 넓힙니다.
핵 분리는 이중 교차 기능이 있는 8채널 미세유체 시스템을 특징으로 하는 혁신적인 10X Genomics Chromium 칩을 통해 수행됩니다. 이 시스템 내에서 바코드, 프라이머, 효소 및 단일 핵을 포함하는 젤 비드는 나노리터 크기의 오일 방울에 캡슐화되어 GEM(Gel Bead-in-Emulsion)을 형성합니다. GEM 형성 후 각 GEM 내에서 세포 용해 및 바코드 방출이 발생합니다. 이어서, mRNA 분자는 10X 바코드와 UMI(고유 분자 식별자)를 통합하여 cDNA로 역전사됩니다. 그런 다음 이러한 cDNA는 표준 시퀀싱 라이브러리 구성을 거쳐 단일 세포 수준에서 유전자 발현 프로파일에 대한 강력하고 포괄적인 탐색을 촉진합니다.
플랫폼: 10× Genomics Chromium 및 Illumina NovaSeq 플랫폼
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10x Genomics Visium 공간 전사체
공간 전사체학(Spatial Transcriptomics)은 연구자들이 조직의 공간적 맥락을 보존하면서 조직 내 유전자 발현 패턴을 조사할 수 있는 최첨단 기술입니다. 이 영역의 강력한 플랫폼 중 하나는 Illumina 시퀀싱과 결합된 10x Genomics Visium입니다. 10X Visium의 원리는 조직 절편이 배치되는 지정된 캡처 영역이 있는 특수 칩에 있습니다. 이 캡처 영역에는 바코드 지점이 포함되어 있으며 각 지점은 조직 내의 고유한 공간 위치에 해당합니다. 조직에서 포획된 RNA 분자는 역전사 과정에서 고유한 분자 식별자(UMI)로 라벨링됩니다. 이러한 바코드 지점과 UMI는 단일 세포 분해능에서 유전자 발현의 정확한 공간 매핑 및 정량화를 가능하게 합니다. 공간적으로 바코드가 표시된 샘플과 UMI의 조합은 생성된 데이터의 정확성과 특이성을 보장합니다. 이 Spatial Transcriptomics 기술을 사용함으로써 연구자들은 세포의 공간적 구성과 조직 내에서 발생하는 복잡한 분자 상호 작용에 대한 더 깊은 이해를 얻을 수 있으며 종양학, 신경과학, 발달 생물학, 면역학을 포함한 여러 분야의 생물학적 과정의 기본 메커니즘에 대한 귀중한 통찰력을 제공할 수 있습니다. , 식물 연구.
플랫폼: 10X Genomics Visium 및 Illumina NovaSeq
