히트 맵
Heatmap 도구는 매트릭스 데이터 파일을 입력으로 받아들이고 사용자가 데이터를 필터링, 정규화 및 클러스터 할 수 있습니다. 열 맵의 1 차 사용 사례는 상이한 샘플들 사이의 유전자 발현 수준의 클러스터 분석이다.
유전자 주석
유전자 주석 도구는 다양한 데이터베이스에 대한 입력 FASTA 파일의 서열 정렬을 기반으로 유전자 주석을 수행합니다.
기본 로컬 정렬 검색 도구 (BLAST)
BLAST 도구는 NCBI Blast의 BMKCloud 통합 버전이며 BMKCloud 계정에 업로드 된 데이터를 사용하여 동일한 기능을 수행하는 데 사용할 수 있습니다.
CDS_UTR 예측
CDS_UTR 예측 도구는 알려진 단백질 데이터베이스 및 ORF 예측 결과에 대한 블래스트 결과에 기초하여 주어진 전사 서열에서 코딩 영역 (CD) 및 비 코딩 영역 (UTR)을 예측하도록 설계되었습니다.
맨해튼 음모
맨해튼 플롯 도구는 높은 샘플 실험을 표시 할 수 있으며 GWAS (Genome-Wide Association Studies)에서 일반적으로 사용됩니다.
회로 다이어그램
Circos 다이어그램 도구는 게놈 특징이 게놈 전체에 분포되는 방법에 대한 효율적인 시각화를 제공합니다. 일반적인 특징에는 정량적 유전자좌, SNP, 인델, 구조 및 카피 수 변형이 포함됩니다.
유전자 온톨로지 (GO) 농축
GO 농축 도구는 기능적 강화 분석을 제공합니다. 이 도구의 주요 소프트웨어는 차등 발현 분석, GO 강화 분석 및 결과의 시각화를 포함하는 Topgo-Bioconductor 패키지입니다.
가중 유전자 공동 발현 네트워크 분석 (WGCNA)
WGCNA는 유전자 공동 발현 모듈을 발견하는 데 널리 사용되는 데이터 마이닝 방법입니다. 마이크로 어레이 및 NGS 유전자 발현 데이터를 포함한 다양한 발현 데이터 세트에 적용 할 수있다.
intercroscan
IntercroScan 도구는 CONPRO 단백질 서열 분석 및 분류를 제공합니다.
Kegg 강화로 가십시오
GO KEGG 강화 도구는 제공된 유전자 세트 및 상응하는 주석을 기반으로 GO 농축 히스토그램, KEGG 강화 히스토그램 및 KEGG 강화 경로를 생성하는 설계입니다.