Pacbio 전체 길이 전사체

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing(Isoseq)은 전사체 동형체의 정확한 식별을 가능하게 하고 대체 폴리아데닐화 및 스플라이싱에 대한 정보를 제공하며 보다 정확한 유전자 발현 분석을 가능하게 합니다. BMKCloud PacBio 전장 전사체 파이프라인은 CCS(Circular Consensus Sequencing) 모드로 시퀀싱된 cDNA 라이브러리를 분석하고 FLNC(Full-Length Non-Chimeric) 서열을 식별한 다음 비중복 전사체로 클러스터링하도록 설계되었습니다. 후속 BUSCO 분석은 전사체 어셈블리의 완전성을 평가합니다. 조립된 전사체로부터 대체 스플라이싱, 단순 서열 반복(SSR), lncRNA 및 해당 표적 유전자 예측, 신규 유전자 예측, 유전자군 분석, 전사 인자 분석 및 전사물의 기능적 주석 등 다양한 분석이 수행됩니다.