비참조 기반 mRNA 시퀀싱-NGS
특징
● 라이브러리 준비 전 폴리 mRNA 캡처
● 참조 게놈과 무관: 전사체의 새로운 조립을 기반으로 여러 데이터베이스(NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)로 주석이 달린 고유 유전자 목록을 생성합니다.
● 유전자 발현 및 전사체 구조에 대한 종합적인 생물정보학적 분석
서비스 장점
●광범위한 전문성: BMKGENE에서 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 샘플 유형에 걸쳐 600,000개 이상의 샘플을 처리한 실적을 바탕으로 우리 팀은 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다. 우리는 다양한 연구 분야에서 100,000개 이상의 mRNA-Seq 프로젝트를 성공적으로 완료했습니다.
●엄격한 품질 관리: 샘플 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱 및 생물정보학까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 제어 지점을 구현합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 고품질 결과를 제공할 수 있습니다.
● 포괄적인 주석: 우리는 여러 데이터베이스를 사용하여 차등 발현 유전자(DEG)에 기능적으로 주석을 달고 해당 농축 분석을 수행하여 전사체 반응의 기본이 되는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 제공합니다.
●판매 후 지원: 우리의 약속은 프로젝트 완료 이후에도 3개월의 판매 후 서비스 기간으로 확장됩니다. 이 기간 동안 우리는 결과와 관련된 모든 질문을 해결하기 위해 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q&A 세션을 제공합니다.
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장되는 데이터 | 품질 관리 |
| 폴리A 농축 | 일루미나 PE150 DNBSEQ-T7 | 6~10GB | Q30≥85% |
샘플 요구사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한되거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일 : 1.2g
● 동물:
심장 또는 내장: 300mg
내장 또는 뇌: 240 mg
근육: 450mg
뼈, 머리카락, 피부: 1g
● 절지동물:
곤충 : 6g
갑각류: 300mg
● 전혈: 튜브 1개
● 셀: 106 세포
권장 샘플 배송
용기: 2 ml 원심분리 튜브 (Tin Foil은 권장하지 않음)
샘플 라벨링: 그룹+복제(예: A1, A2, A3); B1, B2, B3.
선적:
1. 드라이아이스: 샘플을 가방에 포장하고 드라이아이스에 묻어야 합니다.
2. RNAstable 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조되고 실온에서 배송될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
전사체 조립 및 고유 유전자 선택
Unigene 주석
생물학적 복제물의 샘플 상관 관계 및 평가
차별적으로 발현되는 유전자(DEG)
DEG의 기능적 주석
DEG의 기능 강화
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 BMKGene의 진핵생물 NGS mRNA 시퀀싱 서비스를 통해 촉진된 발전을 살펴보세요.
Shen, F. et al. (2020) '아무르 메기(Silurus asotus)의 생식선에서 새로운 전사체 조립 및 성 편향 유전자 발현', Genomics, 112(3), pp. 2603-2614. 도이: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) '양파(Allium cepa L.)의 구근 부종 및 발달 중 자당 대사에 대한 전사체 분석', Frontiers in Plant Science, 7(9월), p. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'Sarcocheilichthys sinensis의 전사체에 대한 새로운 조립, 특성화 및 주석', PLoS ONE, 12(2). 도이: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
Zou, L. et al. (2021) 'De novo 전사체 분석은 염분 스트레스 하에서 Podocarpus Macrophyllus의 내염성에 대한 통찰력을 제공합니다', BMC Plant Biology, 21(1), pp. 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
