기준 게놈을 갖는 mRNA-seq (NGS)
RNA-Seq는 생애 및 농작물 과학 전반의 표준 도구로 게놈과 프로테옴 사이의 간격을 연결합니다. 그것의 강점은 새로운 전 사체를 발견하고 한 가지 분석에서 그들의 발현을 정량화하는 데 있습니다. 그것은 비교 전사 연구에 널리 사용되며, 돌연변이 체를 야생형과 비교하거나 특정 조건 하에서 유전자 발현을 나타내는 등 다양한 특성 또는 표현형과 관련된 유전자에 빛을 발산하는 데 널리 사용됩니다. BMKCLOUD mRNA (참조) 앱은 발현 정량화, 미분 발현 분석 (DEG) 및 서열 구조 분석을 mRNA-seq (NGS) 생물 정보학 파이프 라인에 통합하고 유사한 소프트웨어의 강점을 합병하여 편의성과 사용자 친화적 성을 보장합니다. 사용자는 RNA-Seq 데이터를 클라우드에 업로드 할 수 있으며, 여기서 앱은 포괄적 인 원 스톱 생물 정보 분석 솔루션을 제공합니다. 또한 고객 경험을 우선시하여 사용자의 특정 요구에 맞는 맞춤형 운영을 제공합니다. 사용자는 매개 변수를 설정하고 자체적으로 파이프 라인 미션을 제출하고, 대화식 보고서를 확인하고, 데이터/다이어그램보기 및 다음과 같은 전체 데이터 마이닝을 할 수 있습니다 : 대상 유전자 선택, 기능 클러스터링, 다이어그램 등.
플랫폼:일루미나, MGI
전략:RNA-seq
공들여 나열한 것: 패리, 깨끗한 데이터.
도서관 유형 :Fr-unstranded, FR-Firststrand 또는 FR-Secondstrand
길이 읽기 :150 bp
파일 유형 :*.fastq, *.fq, *.fastq.gz 또는 *.fq.gz. 시스템은 할 것입니다파일 이름에 따라 .fastq 파일을 자동으로 페어링하고예를 들어 *_1.fastq *._ 2.fastq와 쌍을 이룹니다.
샘플 수 :숫자에 제한이 없습니다샘플이지만 분석 시간은샘플이 자랍니다.
권장 데이터 금액 :샘플 당 6g