mRNA-seq(NGS) – 새로운 시작

mRNA 서열분석은 특정 조건 하에서 세포 내 모든 mRNA 전사체의 프로파일링을 가능하게 하며 다양한 연구 분야에서 널리 사용되는 기술입니다. BMKCloud De novo mRNA-seq 파이프라인은 참조 게놈을 사용할 수 없을 때 폴리 A가 풍부한 시퀀싱 라이브러리를 분석하도록 설계되었습니다. 파이프라인은 품질 관리로 시작하여 다음으로 이어집니다.드 노보전사체 어셈블리 및 unigene 세트 선택. 단일 유전자 구조 분석은 코딩 서열(CDS)과 단순 서열 반복(SSR)을 예측합니다. 그 후, 차등 발현 분석은 테스트된 조건 중에서 차별적으로 발현된 유전자(DEG)를 찾은 다음 기능적 주석 및 DEG의 농축을 통해 생물학적 통찰력을 추출합니다.