전장 mRNA 시퀀싱 나노 포어
특징
● 폴리 -A mRNA의 포획 다음 cDNA 합성 및 라이브러리 제조
● 전장 전 사체의 시퀀싱
● 기준 게놈에 대한 정렬에 따른 생물 정보학 분석
● 생물 정보 분석은 유전자 및 이소 형 수준에서의 발현뿐만 아니라 LNCRNA, 유전자 융합, 폴리 아데 닐화 및 유전자 구조의 분석을 포함한다.
서비스 장점
●이소 형 수준에서 발현의 정량화: 전체 유전자 발현을 분석 할 때 마스크 될 수있는 변화를 공개하고 상세하고 정확한 발현 분석 활성화
●감소 된 데이터 요구 :차세대 시퀀싱 (NGS)과 비교하여, 나노 포어 시퀀싱은 데이터 요구 사항이 낮아서 더 작은 데이터와 동등한 수준의 유전자 발현 정량화 포화를 가능하게한다.
●발현 정량화의 높은 정확도: 유전자와 이소 형 수준 모두에서
●추가 전 사체 정보의 식별: 대안적인 폴리아 데 닐화, 융합 유전자 및 LCNRNA 및 이들의 표적 유전자
●광범위한 전문 지식: 우리 팀은 850 개가 넘는 나노 포어 전장 전사 프로젝트를 완료하고 8,000 개가 넘는 샘플을 처리 한 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다.
●판매 후 지원: 우리의 약속은 3 개월간의 사후 서비스 기간으로 프로젝트 완료를 넘어 확장됩니다. 이 기간 동안 우리는 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q & A 세션을 제공하여 결과와 관련된 쿼리를 해결합니다.
샘플 요구 사항 및 전달
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터가 권장됩니다 | 품질 관리 |
| 폴리가 풍부합니다 | 일루미나 PE150 | 6/12GB | 평균 품질 점수 : Q10 |
샘플 요구 사항 :
뉴클레오티드 :
| conc. (ng/μl) | 양 (μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 겔에 표시된 단백질 또는 DNA 오염이 제한적이거나 없음. | 식물의 경우 : RIN≥7.0; 동물의 경우 : RIN≥7.5; 5.0+28s/18s+1.0; 기준선 높이가 제한적이거나 없음 |
● 식물 :
뿌리, 줄기 또는 꽃잎 : 450 mg
잎 또는 씨앗 : 300 mg
과일 : 1.2 g
● 동물 :
심장 또는 장 : 300 mg
내장 또는 뇌 : 240 mg
근육 : 450 mg
뼈, 모발 또는 피부 : 1g
● 절지 동물 :
곤충 : 6g
갑각류 : 300 mg
● 전혈: 1 튜브
● 세포: 106 세포
권장 샘플 전달
용기 : 2ml 원심 분리기 (주석 호일 권장되지 않음)
샘플 라벨링 : 그룹+복제 EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
선적:
1. 드라이 아이스 : 샘플은 가방에 포장되어 드라이 아이스에 묻어 야합니다.
2. RNASTable 튜브 : RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브 (예 : RNastable®)에서 건조시키고 실온으로 선적 될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
뉴클레오티드 :
샘플 전달
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 판매 서비스
서비스 작업 흐름
조직:
실험 설계
샘플 전달
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 판매 서비스
● 원시 데이터 처리
● 성적 증명서 식별
● 대체 스 플라이 싱
● 유전자 수준 및 이소 형 수준에서의 발현 정량
● 차등 발현 분석
● 기능 주석 및 강화 (degs and dets)
대체 스 플라이 싱 분석
대체 폴리아 데 닐화 분석 (APA)
lncrna 예측
새로운 유전자의 주석
Dets의 클러스터링
degs의 단백질-단백질 네트워크
선별 된 간행물 모음을 통해 BMKGENE의 나노 포어 전장 mRNA 시퀀싱 서비스에 의해 촉진 된 발전을 탐구하십시오.
Gong, B. et al. (2023) '신경 교종에서 종양 유전자로서 분비 키나제 fam20c의 후성 유전 학적 및 전사 활성화', Journal of Genetics and Genomics, 50 (6), pp. 422-433. doi : 10.1016/j.jgg.2023.01.008.
He, Z. et al. (2023) '림프구의 전장 전 사체 시퀀싱 IFN-γ에 반응하는 IFN-γ에 반응한다. flounder (Paralichthys olivaceus)에서 Th1-skewed 면역 반응을 나타낸다' ', Fish & Shelpish Immunology, 134, p. 108636. doi : 10.1016/j.fsi.2023.108636.
Ma, Y. et al. (2023) 'Nemopilema nomurai venom 식별을위한 Pacbio 및 Ont RNA 시퀀싱 방법의 비교 분석', Genomics, 115 (6), p. 110709. doi : 10.1016/j.ygeno.2023.110709.
Yu, D. et al. (2023) 'Nano-Seq 분석은 HUMSC에서 유래 한 엑소 좀과 미세 소포 사이의 다른 기능적 경향을 보여준다', 줄기 세포 연구 및 치료, 14 (1), pp. 1-13을 보여준다. doi : 10.1186/s13287-023-03491-5/테이블/6.
