진핵 생물 mRNA 분석 (참조 기반 및 de novo 옵션 이용 가능)
이 파이프 라인은 NGS RNA-Seq 데이터를 입력으로 사용하고 다음을 포함하되 이에 국한되지 않는 여러 다운 스트림 분석에서 결과를 생성합니다.드 노보전사 부위 주석, 가변 스 플라이 싱 분석, 차등 발현 분석, 기능 주석 및 농축 분석.
긴 비 코딩 RNA 분석
긴 비 코딩 RNA (LNCRNA)는 길이가 200 NT보다 긴 비 코딩 전 사체이며 크로마틴 조직 및 조절에서 역할을하는 것으로 알려져 있습니다. 고 처리량 시퀀싱 기술과 생물 정보학은 우리의 이해를 이해하여 LNCRNA 시퀀스와 포지셔닝 정보를 강화하여 결정적인 규제 기능을 갖는 LNCRNA를 식별했습니다. 이 파이프 라인은 진핵 생물 mRNA 분석 파이프 라인에 언급 된 분석 외에 LNCRNA 분석을 제공합니다.
16S/18S/ITS 앰플 리콘 시퀀싱
미생물 다양성 프로젝트 분석에서 수년간의 경험에 기초하여 앰플 리콘 시퀀싱 미생물 다양성 분석 파이프 라인은 개발되었다. 파이프 라인에는 현재 미생물 연구 및 개인화 된 분석의 주류 분석 내용을 다루는 표준화 된 기본 분석이 포함되어 있습니다. 분석 보고서는 다양한 개인 분석을 수행 할 수있는 옵션으로 풍부하고 포괄적입니다. 또한 추가 사용자 정의 및 제어를 위해 샘플 및 그룹을 즉시 수정할 수 있습니다.
샷건 메타 게놈 분석
Shotgun Metagenomic Analysis 파이프 라인은 환경 샘플에서 추출한 혼합 게놈 재료의 NGS 데이터를 사용합니다. 포함 된 분석은 종 다양성 및 풍부함, 집단 구조, 계통 발생 학적 관계, 기능성 유전자 및 환경 적 요인과의 상관 네트워크에 대한 자세한 정보를 제공합니다.
NGS-WGS 변형 분석
NGS-WGS 변형 분석은 데이터 품질 관리, 서열 정렬, 주석 및 유전자 돌연변이 분석을 수행하는 통합 변형 검출 파이프 라인입니다. 파이프 라인은 SNP 및 Indel Detection의 GATK 모범 사례를 따르고 구조 변형 호출에 Manta를 사용합니다.
게놈 와이드 협회 연구 (GWAS)
GWAS 파이프 라인은 이전에 생성 된 VCF 파일과 개인의 코호트에 대한 해당 표현형 데이터를 입력하는 다운 스트림 분석입니다. 특정 통계적 방법론을 사용하여 GWA는 표현형 차이와 상관 관계가있는 게놈 전체 뉴클레오티드 변이를 발견하는 것을 목표로합니다. 그것은 식물과 동물의 복잡한 인간 질병과 복잡한 특성과 관련된 기능성 유전자를 탐색하는 데 중요한 역할을합니다.
벌크 분리 분석 (BSA)
BSA 분석은 분리 된 인구로부터 극도의 표현형 특성을 가진 개인을 모으는 것을 포함합니다. 풀링 된 샘플 사이의 차등 유전자좌를 비교함으로써,이 접근법은 표적 유전자와 관련된 밀접하게 연결된 분자 마커를 빠르게 식별한다. 식물과 동물의 유전자 매핑에 널리 사용되는이 제품은 마커 보조 육종을위한 귀중한 도구입니다.
진화 유전학 분석
진화 유전학 분석 워크 플로우는 유전자 진화 프로젝트에서 BMKGENE의 광범위한 경험을 활용하고 계통 발생 트리 구성, 연계 불균형 분석, 유전자 다양성 평가, 선택적 스윕 식별, 친족 분석, 주요 구성 요소 분석 및 집단 구조 특성화를 포함합니다.
