진핵생물 mRNA 서열분석-NGS
특징
● 라이브러리 준비 전 폴리 mRNA 캡처
● 가닥별 서열 분석 데이터를 얻을 수 있는 선택적 방향성 mRNA 라이브러리 준비
● 유전자 발현 및 전사체 구조의 생물정보학적 분석
장점
●광범위한 전문성: 우리 팀은 BMKgene에서 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 샘플 유형에 걸쳐 600,000개 이상의 샘플을 처리했습니다. 우리는 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공하고 다양한 연구 분야에서 100,000개 이상의 mRNA-Seq 프로젝트를 성공적으로 완료했습니다.
●엄격한 품질 관리: 샘플 및 라이브러리 준비부터 시퀀싱, 생물정보학까지 전 단계에 걸쳐 핵심 제어 포인트를 구현합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 지속적으로 고품질 결과를 제공하고 프로젝트가 신뢰할 수 있게 진행되도록 보장합니다.
●포괄적인 주석: 우리는 여러 데이터베이스를 사용하여 차등 발현 유전자(DEG)에 기능적으로 주석을 달고 해당 농축 분석을 수행합니다. 이 포괄적인 접근 방식은 전사체 반응의 기본이 되는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 제공하여 프로젝트 결과에 대한 완전한 정보를 얻을 수 있도록 보장합니다.
●판매 후 지원: 당사의 약속은 프로젝트 완료 이후 3개월의 판매 후 서비스 기간까지 연장됩니다. 이 기간 동안 우리는 결과와 관련된 모든 질문을 해결하기 위해 프로젝트 후속 조치, 문제 해결 지원 및 Q&A 세션을 제공합니다.
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장되는 데이터 | 품질 관리 |
| 폴리A 농축 | 일루미나 PE150 DNBSEQ-T7 | 6~10GB | Q30≥85% |
샘플 요구사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 | |
| 표준 라이브러리 | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한되거나 없음 |
| 방향성 라이브러리 | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한되거나 없음 |
● 식물:
뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg
잎 또는 씨앗: 300mg
과일 : 1.2g
●동물:
심장 또는 내장: 300mg
내장 또는 뇌: 240 mg
근육: 450mg
뼈, 머리카락, 피부: 1g
● 절지동물:
곤충 : 6g
갑각류: 300mg
● 전혈: 튜브 1개
● 셀: 106 세포
권장 샘플 배송
용기: 2 ml 원심분리 튜브 (Tin Foil은 권장하지 않음)
샘플 라벨링: 그룹+복제(예: A1, A2, A3); B1, B2, B3... ...
선적:
1. 드라이아이스: 샘플을 가방에 포장하고 드라이아이스에 묻어야 합니다.
2. RNA 테이블 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조되고 실온에서 배송될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
진핵생물 mRNA 서열분석 분석 워크플로우
생물정보학
Ø원시 데이터 품질 관리
Ø참조 게놈 정렬
Ø성적 증명서 구조 분석
Ø발현 정량화
Ø미분 표현 분석
Ø함수 주석 및 강화
참조 게놈 정렬
데이터 포화
생물학적 복제물의 샘플 상관 관계 및 평가
차별적으로 발현되는 유전자(DEG)
DEG의 기능적 주석
DEG의 기능 강화
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 BMKGene의 진핵생물 NGS mRNA 시퀀싱 서비스를 통해 촉진된 발전을 살펴보세요.
Huang, L. et al. (2023) '트리클로산과 트리클로카반은 후각 인식을 제한하고 후각 신호 전달을 방해하며 후각 정보 처리를 방해하여 금붕어의 후각 능력을 약화시킵니다', Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJet al. (2023) 'Aspergillus fumigatus는 인간 p11을 납치하여 곰팡이 함유 포식체를 비분해 경로로 리디렉션합니다', Cell Host & Microbe, 31(3), pp. 373-388.e10. 도이: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) '마대나무(Dendrocalamus latiflorus Munro)의 싹 발달에 관여하는 TCP 전사 인자', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'Chrysanthemum lavandulifolium 게놈과 다양한 두상 유형의 기초가 되는 분자 메커니즘', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujieet al. (2023) '상승적 ROS 증가 및 자가포식 차단을 통해 대장암에 대한 초음파 역학 치료를 강화하기 위한 캐스케이드 나노반응기', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
