DNA/RNA 시퀀싱 - 나노 포어 시퀀서
서비스 세부 사항 기능
| 플랫폼 | 라이브러리 크기 | 이론적 데이터 수율 (셀당) | 단일 기본 정확도 | 응용 프로그램 |
| 나노 포어 | 8kb, 10kb, 20kb, ultralong, cdna-pcr | 70-90GB/셀 | 85-92% | SV Calling, de Novo, 전장 시퀀싱, ISO-Seq, 유전자 주석, DNA 메틸화 검출 |
서비스 장점
● Pacbio 시퀀싱 플랫폼에 대한 5 년 이상의 다양한 종을 가진 수천 개의 폐쇄 된 프로젝트가 있습니다.
● BMKGENE은 듀얼 플랫폼 RNA/DNA 인증을 가진 옥스포드 나노 포어의 공식 파트너입니다.
● 완전한 장비와 충분한 시퀀싱 처리량이있는 시퀀서의 주류 모델이 있습니다.
● 나노 포어 플랫폼을 기반으로 10 개가 넘는 동물 및 공장 Denovo 연구가 국제적으로 유명한 저널에 발표되었습니다.
샘플 요구 사항
| 샘플 유형 | 양 | 농축 (Qubit ®) | 용량 | 청정 | 기타 |
| 게놈 DNA | 데이터 요구 사항에 따라 다릅니다 | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230 ≥1.5 ； 260 nm에서 투명한 피크, 오염 없음 | 농도는 Qubit 및 Qubit/Nanopore ≤ 2로 측정해야합니다. |
| 총 RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ； 오염 없음 | 린 값 ≥7.5 |
서비스 워크 플로
샘플 준비
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
프로젝트 제공
DNA 샘플의 데이터 품질 평가
표 1. 깨끗한 데이터에 대한 통계.
| BMKID | rawseqnum | Rawsumbase | CleanSeqnum | Cleansumbase | cleann50len | cleann90len | 청정 메아리 | Cleanmaxlen | 정화 마감 |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
RNA 샘플의 데이터 품질 평가
표 1. 깨끗한 데이터에 대한 통계.
| 파일 이름 | ClientId | readnum | 바 세문 | N50 | 길이 | 최대 길이 | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
그림 1. 길이 분포를 읽으십시오
그림 2. 깨끗한 데이터의 품질 점수 분포
그림 3. 깨끗한 데이터의 길이 및 품질 점수 분포
