일루미나 사전 제작 된 라이브러리
특징
●플랫폼 :Illumina Novaseq 6000 및 Novaseq X Plus
●시퀀싱 모드 :PE150 및 PE250
●시퀀싱 전 라이브러리의 품질 관리
●데이터 QC 시퀀싱 및 전달 :demultiplexing 및 필터링 Q30 읽기 후 QC 보고서 및 원시 데이터를 FastQ 형식으로 제공
서비스 장점
●시퀀싱 서비스의 다양성 :고객은 차선, 유량 셀 또는 필요한 데이터 양 (부분 레인 시퀀싱)에 의해 시퀀싱하도록 선택할 수 있습니다.
●Illumina 시퀀싱 플랫폼에 대한 광범위한 경험 :다양한 종을 가진 수천 개의 폐쇄 된 프로젝트가 있습니다.
●시퀀싱 QC 보고서 제공 :품질 메트릭, 데이터 정확도 및 시퀀싱 프로젝트의 전반적인 성능으로.
●성숙한 시퀀싱 프로세스 :짧은 전환 시간으로.
●엄격한 품질 관리: 우리는 지속적으로 고품질 결과를 제공하기 위해 엄격한 QC 요구 사항을 구현합니다.
샘플 플랫폼
| 플랫폼 | 유량 셀 | 시퀀싱 모드 | 단위 | 예상 출력 |
| Novaseq x | 10B (8 레인) | PE150 | 단일 레인 부분 차선 | 375GB / 레인 |
| 25B (8 차선) | PE150 | 단일 레인 부분 차선 | 1000GB/레인 | |
| Novaseq 6000 | SP 유량 셀 (2 차선) | PE250 | 유량 셀 단일 레인 부분 차선 | 325-400m 읽기 / 차선 |
| S4 유량 셀 (4 차선) | PE150 | 유량 셀 단일 레인 부분 차선 | ~ 800GB / 레인 |
샘플 요구 사항
| 데이터 금액 (x) | 농도 (qpcr/nm) | 용량 | |
| 부분 레인 시퀀싱
| x ≤ 10GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 gb <x ≤ 50GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 gb <x ≤ 100GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| x> 100GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| 차선 시퀀싱 | 차선 당 | ≥ 1.5 nm / 라이브러리 풀 | ≥ 25 μl / 라이브러리 풀 |
농도 및 총량 외에도 적합한 피크 패턴도 필요합니다.
참고 : 낮은 다양성 라이브러리의 차선 시퀀싱에는 Phix Spike-In이 강력한 기본 통화를 보장해야합니다.
사전 풀 라이브러리를 샘플로 제출하는 것이 좋습니다. 라이브러리 풀링을 수행하기 위해 bmkgene이 필요한 경우
부분 차선 시퀀싱에 대한 라이브러리 요구 사항.
라이브러리 크기 (피크 맵)
메인 피크는 300-450 bp이어야합니다.
라이브러리에는 단일 메인 피크, 어댑터 오염 없음 및 프라이머 이량 체가 있어야합니다.
샘플이 시작 자재 요구 사항을 충족하지 않으면 저희에게 연락하십시오.
서비스 워크 플로
도서관 품질 관리
시퀀싱
데이터 품질 관리
프로젝트 제공
도서관 QC 보고서
라이브러리의 품질에 대한 보고서는 시퀀싱, 라이브러리 금액 평가 및 단편화 전에 제공됩니다.
시퀀싱 QC 보고서
표 1. 시퀀싱 데이터에 대한 통계.
| 샘플 ID | BMKID | RAW 읽기 | 원시 데이터 (BP) | 깨끗한 읽기 (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
그림 1. 각 샘플의 읽기에 따른 품질 분포
그림 2. 기본 내용 분포
그림 3. 시퀀싱 데이터에서 읽기 내용의 분포
