앰플리콘 시퀀싱(16S/18S/ITS)

Illumina를 사용한 Amplicon(16S/18S/ITS) 시퀀싱은 서열에 따라 미생물 프로필을 식별한 다음 각 샘플 내에서 그리고 샘플 간에 커뮤니티 풍부함과 다양성을 해독하려고 시도하여 미생물 다양성을 분석하는 방법입니다. BMKCloud Amplicon(NGS) 파이프라인을 사용하면 16S, 18S, ITS 및 여러 기능 유전자를 분석할 수 있습니다. 읽기 트리밍, 페어드 엔드 읽기 어셈블리 및 품질 평가로 시작한 다음 유사한 읽기를 클러스터링하여 6개의 다른 분석 섹션에 사용되는 OTU(운영 분류 단위)를 생성합니다. 분류학적 주석은 각 샘플의 상대적 풍부함과 구성에 대한 정보를 제공하는 반면, 알파 및 베타 다양성 분석은 각각 샘플 내 및 샘플 간의 미생물 다양성에 중점을 둡니다. 그룹 간의 차이 분석은 매개변수 및 비모수적 테스트를 모두 사용하여 서로 다른 OTU를 찾는 반면, 상관 분석은 이러한 차이를 환경 요인과 연관시킵니다. 마지막으로, 기능적 유전자 풍부도는 마커 유전자 풍부도를 기반으로 예측되어 각 샘플의 기능 및 생태에 대한 통찰력을 제공합니다.