16S/18S/ITS 앰플리콘 시퀀싱-PacBio
서비스 특징
● 시퀀싱 플랫폼: PacBio Revio
● 시퀀싱 모드: CCS(HiFi 읽기)
● HiFi SMRT 벨 라이브러리 준비 전 대상 영역 증폭 후 앰플리콘 직렬 연결
서비스 장점
●더 높은 분류학적 해상도: T한 짧은 앰플리콘 시퀀싱,종 수준에서 더 높은 OTU 분류율을 가능하게 합니다.
●매우 정확한 베이스 콜링: PacBio CCS 모드 시퀀싱(HiFi 읽기).
●격리가 필요 없음: 환경 시료 내 미생물 조성을 신속하게 식별합니다.
●널리 적용 가능: 다양한 미생물 군집 연구.
●종합적인 생물정보학 분석: 데이터베이스, 주석, OTU/ASV 측면에서 다양한 분석을 제공하는 최신 QIIME2 패키지(미생물 생태학에 대한 정량적 통찰력)입니다.
●광범위한 전문성: 매년 수천 건의 앰플리콘 시퀀싱 프로젝트를 수행하는 BMKGENE은 10년 이상의 경험, 고도로 숙련된 분석 팀, 포괄적인 콘텐츠 및 탁월한 판매 후 지원을 제공합니다.
서비스 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장되는 데이터 |
| 앰플리콘 | 팩바이오 레비오 | 10/30/50K 태그(CCS) |
샘플 요구 사항
| 농도(ng/μL) | 총량(μg) | 볼륨(μL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
권장 샘플 배송
샘플을 액체질소에서 3~4시간 동안 동결시킨 후 액체질소 또는 장기 보관을 위해 영하 80도에 보관하세요. 드라이아이스를 이용한 샘플 배송이 필요합니다.
서비스 작업 흐름
샘플 배송
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
다음 분석이 포함됩니다.
●원시 데이터 품질관리
●OTU 클러스터링/잡음 제거(ASV)
●OTU 주석
●알파 다양성 분석: Shannon, Simpson 및 ACE를 포함한 여러 지수.
●베타 다양성 분석
●그룹간 분석
●상관분석 : 환경요인과 OUT 구성 및 다양성 간의 상관관계 분석
●16S 기능성 유전자 예측
분류학적 분포의 히스토그램
군집 분포 계통수
알파 다양성 분석: ACE
색인
베타 다양성 분석: PCoA
그룹 간 분석: ANOVA
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 PacBio를 통해 BMKGene의 앰플리콘 시퀀싱 서비스를 통해 촉진된 발전을 살펴보세요.
Gao, X. 및 Wang, H. (2023) '고산 초원에서 두 가지 성장 단계를 갖는 알파인 메리노 양의 다양한 현상학(Regreen 대 Grassy)에 적응하는 동안 반추위 박테리아 프로필 및 기능의 비교 분석', 발효, 9( 1), p. 16. 도이: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) '배양학 기반 메타유전체학 및 고해상도 분석을 사용하여 사막 토양에서 미생물 암흑물질 포착', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1–14. 도이: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) '알팔파, 볏짚 및 밀기울로 제조된 혼합 사일리지의 발효 특성, 박테리아 다양성 및 호기성 안정성에 대한 지방산 염의 영향', Journal of the Science of Food and Agriculture, 102(4), pp. 1475– 1487. 도이: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) 'Sonchus brachyotus DC 추출물의 항산화 효과에서 산화 스트레스 바이오마커와 장내 미생물총 사이의 상호 작용. 성인 Zebrafish의 옥사졸론 유발 장 산화 스트레스', 항산화제 2023, Vol. 12, 페이지 192, 12(1), p. 192. 도이: 10.3390/ANTIOX12010192.
