16S/18S/ITS AMPLICON 시퀀싱 -NG
서비스 기능
● 시퀀싱 플랫폼 : Illumina Novaseq.
● 다른 증폭 목표 중에서도 16S, 18S 및 ITS의 짧은 영역의 증폭.
● 앰플 리콘의 유연한 선택.
● 여러 증폭 목표를 가진 이전 프로젝트 경험.
서비스 장점
●격리가 없음 :환경 샘플에서 미생물 조성의 빠른 식별.
●고해상도: 환경 샘플의 저급 성분.
●널리 적용 가능: 다양한 미생물 공동체 연구.
●포괄적 인 생물 정보 분석: 데이터베이스, 주석, OTU/ASV 측면에서 다양한 분석을 갖춘 최신 Qiime2 패키지 (미생물 생태에 대한 정량적 통찰력).
●광범위한 전문 지식: BMKGENE은 매년 1,50,000 개의 앰플 리콘 시퀀싱 프로젝트를 통해 10 년 이상의 경험, 고도로 숙련 된 분석 팀, 포괄적 인 콘텐츠 및 우수한 판매 후 지원을 제공합니다.
서비스 사양
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터가 권장됩니다 |
| 앰플 리콘 | 일루미나 PE250 | 50/100/300k 태그 (쌍 읽기) |
서비스 요구 사항
| 농도 (NG/µL) | 총 금액 (ng) | 볼륨 (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● 토양/슬러지 : 1-2G
● 장 함량-동물 : 0.5-2g
● 장 내용물-삽입 : 0.1-0.25g
● 식물 표면 (농축 퇴적물) : 0.1-0.5g
● 발효 국물 강화 퇴적물) : 0.1-0.5g
● 대변 (큰 동물) : 0.5-2g
● 대변 (마우스) : 3-5grains
● 폐 폐포 세척 액체 : 여과지
● 질 면봉 : 5-6 면봉
● 피부/생식기 면봉/타액/구강 연조직/인두 면봉/직장 면봉 : 2-3 면봉
● 표면 미생물 : 여과지
● 수역/공기/바이오 필름 : 여과지
● 엔도 피트 : 1-2G
● 치과 플라크 : 0.5-1g
서비스 작업 흐름
샘플 전달
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
애프터 판매 서비스
다음 분석을 포함합니다.
- 원시 데이터 품질 관리
- OTU 클러스터링 /de-noise (ASV)
- OTU 주석
- 알파 다양성 분석 : Shannon, Simpson 및 Ace를 포함한 여러 인덱스.
- 베타 다양성 분석
- 그룹 간 분석
- 상관 관계 분석 : 환경 요인과 구성 및 다양성 사이
- 16S 기능성 유전자 예측
분류 학적 분포의 히스토그램
분류 학적 풍부 클러스터링 히트 맵
알파 다양성 분석 : 희귀 곡선
베타 다양성 분석 : NMD
그룹 간 분석 : Lefse Biomarker 발견
선별 된 출판물 모음을 통해 Illumina와 BMKGENE의 Amplicon 시퀀싱 서비스에 의해 촉진 된 발전을 탐구하십시오.
Dong, C. et al. (2022) '조립, 핵심 미생물 총 및 Eucommia ulmoides의 rhizosphere 토양 및 껍질 미생물 총, 미생물학의 프론티어, 13. doi : 10.3389/fmicb.2022.855317/full.
Li, Y. et al. (2023) '마우스에서 Gardnerella vaginalis- 유도 된 세균성 질증의 치료를위한 합성 박테리아 컨소시엄 이식', Microbiome, 11 (1), pp. 1-14. doi : 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. and Liu, H. (2022) '지상 기반 폐쇄 된 생물 유전자 생물 지원 실험“Lunar Palace 365”', Environmental Microbiomes, 17 (1), pp. 1–20. doi : 10.1186/s40793-022-00399-0/그림/8.
Yin, S. et al. (2022) '퇴비에서 질소 형질 전환과 관련된 기능성 유전자의 공급 원료 의존적 풍부도', Bioresource Technology, 361, p. 127678. doi : 10.1016/j.biortech.2022.127678.
