ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (WGBS)
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜಿನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (WGBS) ಡಿಎನ್ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣದ ಆಳವಾದ ಪರಿಶೋಧನೆಗಾಗಿ ಚಿನ್ನದ-ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಸೈಟೋಸಿನ್‌ನಲ್ಲಿ ಐದನೇ ಸ್ಥಾನ (5-mC), ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಪ್ರಮುಖ ನಿಯಂತ್ರಕ. ಡಬ್ಲ್ಯುಜಿಬಿಎಸ್‌ನ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ತತ್ವವು ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಮೆಥೈಲೇಟೆಡ್ ಸೈಟೋಸಿನ್‌ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಗದೆ ಬಿಡುವಾಗ ಯುರಾಸಿಲ್‌ಗೆ (ಸಿ ಯಿಂದ ಯು) ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ತಂತ್ರವು ಸಿಂಗಲ್-ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ನೀಡುತ್ತದೆ, ಸಂಶೋಧಕರು ಮೀಥೈಲೋಮ್ ಅನ್ನು ಸಮಗ್ರವಾಗಿ ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಅಸಹಜ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್. WGBS ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ, ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸಾಟಿಯಿಲ್ಲದ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು, ಇದು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
ಸೇವೆಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
● ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಪರಿವರ್ತನೆ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡಲು ಲ್ಯಾಂಬ್ಡಾ ಡಿಎನ್ಎ ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
● Illumina NovaSeq ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
●ಡಿಎನ್ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಗಾಗಿ ಗೋಲ್ಡ್ ಸ್ಟ್ಯಾಂಡರ್ಡ್: ಈ ಪ್ರೌಢ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪರಿವರ್ತನೆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ಉತ್ತಮ ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
●ವೈಡ್ ಕವರೇಜ್ ಮತ್ತು ಸಿಂಗಲ್-ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್:ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸೈಟ್‌ಗಳ ಪತ್ತೆ.
●ಸಂಪೂರ್ಣ ವೇದಿಕೆ:ಮಾದರಿ ಸಂಸ್ಕರಣೆ, ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ, ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಒಂದು-ನಿಲುಗಡೆ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಸೇವೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸಿ.
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: WGBS ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್‌ಗಳು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಶ್ರೇಣಿಯ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡಿದ್ದು, BMKGENE ಒಂದು ದಶಕದ ಅನುಭವ, ಹೆಚ್ಚು ನುರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂಡ, ಸಮಗ್ರ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
●ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸೇರುವ ಸಾಧ್ಯತೆ: RNA-seq ನಂತಹ ಇತರ ಓಮಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ WGBS ನ ಸಮಗ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಮಾದರಿ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ ಔಟ್‌ಪುಟ್ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 | 30x ಆಳ | Q30 ≥ 85% ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಪರಿವರ್ತನೆ > 99% |
ಮಾದರಿ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು
| ಏಕಾಗ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ (µg) | ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು | |
| ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್ಎ | ≥ 5 | ≥ 400 ng | ಸೀಮಿತ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ |
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಡಿಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಡೇಟಾ ವಿತರಣೆ
ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಕಚ್ಚಾ ಅನುಕ್ರಮ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ;
● ಉಲ್ಲೇಖ ಜಿನೋಮ್‌ಗೆ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್;
● 5mC ಮಿಥೈಲೇಟೆಡ್ ಬೇಸ್‌ಗಳ ಪತ್ತೆ;
● ಮೆತಿಲೀಕರಣ ವಿತರಣೆ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ;
● ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಮಿಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (DMRs);
● DMR ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ.
5mC ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪತ್ತೆ: ಮೀಥೈಲೇಟೆಡ್ ಸೈಟ್‌ಗಳ ವಿಧಗಳು
ಮೆತಿಲೀಕರಣ ನಕ್ಷೆ. 5mC ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಜೀನೋಮ್-ವ್ಯಾಪಕ ವಿತರಣೆ
ಹೆಚ್ಚು ಮಿಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮಿಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು: ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್ಗಳು
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮೆಥೈಲೇಟೆಡ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು: ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನ್‌ಗಳ ಟಿಪ್ಪಣಿ (ಜೀನ್ ಒಂಟಾಲಜಿ)
BMKGene ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಕ್ಯುರೇಟೆಡ್ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಫ್ಯಾನ್, ವೈ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2020) 'ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕುರಿಗಳ ಅಸ್ಥಿಪಂಜರದ ಸ್ನಾಯುವಿನ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ',BMC ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 21(1), ಪುಟಗಳು. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
ಝಾವೋ, X. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ವಿನೈಲ್ ಕ್ಲೋರೈಡ್‌ಗೆ ಒಡ್ಡಿಕೊಂಡ ಕೆಲಸಗಾರರಲ್ಲಿ ಕಾದಂಬರಿ ಡಿಯೋಕ್ಸಿರೈಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣದ ಅಡಚಣೆಗಳು',ಟಾಕ್ಸಿಕಾಲಜಿ ಮತ್ತು ಕೈಗಾರಿಕಾ ಆರೋಗ್ಯ, 38(7), ಪುಟಗಳು. 377–388. ದೂ: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2020) 'ಜೀನೋಮ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣ, ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳ ಮಟ್ಟಗಳು, ಎಮ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು ಮತ್ತು ಟೊಮೆಟೊ ಹಣ್ಣನ್ನು ಮಾಗಿದ ಮೆಟಾಬಾಲೈಟ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧಗಳು',ದಿ ಪ್ಲಾಂಟ್ ಜರ್ನಲ್, 103(3), ಪುಟಗಳು. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
