-
BMKMANU S3000_ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ
ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನಶಾಸ್ತ್ರವು ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ನಾವೀನ್ಯತೆಯ ಮುಂಚೂಣಿಯಲ್ಲಿದೆ, ಸಂಶೋಧಕರು ತಮ್ಮ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಸಂದರ್ಭವನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುವಾಗ ಅಂಗಾಂಶಗಳೊಳಗಿನ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲು ಅಧಿಕಾರವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ವಿವಿಧ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ಗಳ ನಡುವೆ, BMKGene BMKManu S3000 ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಚಿಪ್ ಅನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದೆ, 3.5µm ನ ವರ್ಧಿತ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್, ಉಪಕೋಶ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ತಲುಪುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬಹು-ಹಂತದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್‌ಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. S3000 ಚಿಪ್, ಸರಿಸುಮಾರು 4 ಮಿಲಿಯನ್ ಸ್ಪಾಟ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದ್ದು, ಪ್ರಾದೇಶಿಕವಾಗಿ ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಕ್ಯಾಪ್ಚರ್ ಪ್ರೋಬ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಲೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಮಣಿಗಳಿಂದ ಲೇಯರ್ಡ್ ಮೈಕ್ರೊವೆಲ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಬಾರ್‌ಕೋಡ್‌ಗಳಿಂದ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿರುವ cDNA ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು S3000 ಚಿಪ್‌ನಿಂದ ತಯಾರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ Illumina NovaSeq ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾದೇಶಿಕವಾಗಿ ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು UMI ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯು ರಚಿಸಲಾದ ಡೇಟಾದ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ. BMKManu S3000 ಚಿಪ್‌ಗಳು ಬಹು-ಹಂತದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್‌ಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತಿದ್ದು, ವಿವಿಧ ಅಂಗಾಂಶಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ಅಪೇಕ್ಷಿತ ಮಟ್ಟದ ವಿವರಗಳಿಗೆ ಉತ್ತಮವಾಗಿ ಟ್ಯೂನ್ ಮಾಡಬಹುದಾಗಿದೆ. ಈ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯು ಚಿಪ್ ಅನ್ನು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೊಮಿಕ್ಸ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿ ಇರಿಸುತ್ತದೆ, ಕನಿಷ್ಠ ಶಬ್ದದೊಂದಿಗೆ ನಿಖರವಾದ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಖಾತ್ರಿಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. BMKManu S3000 ನೊಂದಿಗೆ ಸೆಲ್ ಸೆಗ್ಮೆಂಟೇಶನ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದ ಬಳಕೆಯು ಜೀವಕೋಶಗಳ ಗಡಿಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಡೇಟಾವನ್ನು ಡಿಲಿಮಿಟೇಶನ್ ಮಾಡಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ನೇರ ಜೈವಿಕ ಅರ್ಥವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, S3000 ನ ಸುಧಾರಿತ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಪ್ರತಿ ಕೋಶಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು UMI ಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು ಕೋಶಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್‌ಗಳ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
-
ಏಕ-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಏಕ-ಕೋಶ ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಕಸ್ಟಮ್ ಲೈಬ್ರರಿ ನಿರ್ಮಾಣ ತಂತ್ರಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ, ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಸೇರಿಕೊಂಡು, ಜೀವಕೋಶದ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಕ್ರಾಂತಿಗೊಳಿಸಿದೆ. ಈ ಪ್ರಗತಿಯು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀವಕೋಶದ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಆಳವಾದ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರವಾದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ, ಎಲ್ಲಾ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಮೇಲೆ ಸರಾಸರಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಮಿತಿಗಳನ್ನು ಮೀರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಈ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯೊಳಗೆ ನಿಜವಾದ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಕಾಪಾಡುತ್ತದೆ. ಏಕ-ಕೋಶ RNA ಅನುಕ್ರಮವು (scRNA-seq) ನಿರಾಕರಿಸಲಾಗದ ಪ್ರಯೋಜನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, ಕೆಲವು ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಇದು ಸವಾಲುಗಳನ್ನು ಎದುರಿಸುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಏಕ-ಕೋಶದ ಅಮಾನತುಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯ ರಚನೆಯು ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ತಾಜಾ ಮಾದರಿಗಳ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ. BMKGene ನಲ್ಲಿ, ಅತ್ಯಾಧುನಿಕ 10X ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಕ್ರೋಮಿಯಂ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಿಂಗಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (snRNA-seq) ನೀಡುವ ಮೂಲಕ ನಾವು ಈ ಅಡಚಣೆಯನ್ನು ಪರಿಹರಿಸುತ್ತೇವೆ. ಈ ವಿಧಾನವು ಏಕ-ಕೋಶ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅನುಕೂಲವಾಗುವ ಮಾದರಿಗಳ ವರ್ಣಪಟಲವನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ.
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್‌ಗಳ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಯನ್ನು ನವೀನ 10X ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಕ್ರೋಮಿಯಂ ಚಿಪ್ ಮೂಲಕ ಸಾಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಬಲ್ ಕ್ರಾಸಿಂಗ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಎಂಟು-ಚಾನೆಲ್ ಮೈಕ್ರೋಫ್ಲೂಯಿಡಿಕ್ಸ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಈ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯೊಳಗೆ, ಬಾರ್‌ಕೋಡ್‌ಗಳು, ಪ್ರೈಮರ್‌ಗಳು, ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಜೆಲ್ ಮಣಿಗಳು ನ್ಯಾನೊಲಿಟರ್ ಗಾತ್ರದ ತೈಲ ಹನಿಗಳಲ್ಲಿ ಸುತ್ತುವರಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಇದು ಜೆಲ್ ಬೀಡ್-ಇನ್-ಎಮಲ್ಷನ್ (GEM) ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. GEM ರಚನೆಯ ನಂತರ, ಸೆಲ್ ಲೈಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಬಿಡುಗಡೆಯು ಪ್ರತಿ GEM ನಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ತರುವಾಯ, mRNA ಅಣುಗಳು cDNA ಗಳಾಗಿ ರಿವರ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಷನ್‌ಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ, 10X ಬಾರ್‌ಕೋಡ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ವಿಶಿಷ್ಟ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್‌ಗಳನ್ನು (UMIs) ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತವೆ. ಈ cDNA ಗಳನ್ನು ನಂತರ ಸ್ಟ್ಯಾಂಡರ್ಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಲೈಬ್ರರಿ ನಿರ್ಮಾಣಕ್ಕೆ ಒಳಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಏಕ-ಕೋಶ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳ ದೃಢವಾದ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರ ಅನ್ವೇಷಣೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆ: 10× ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಕ್ರೋಮಿಯಂ ಮತ್ತು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್
-
10x ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಸಿಯಮ್ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ
ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನವು ಅತ್ಯಾಧುನಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವಾಗಿದ್ದು, ಸಂಶೋಧಕರು ತಮ್ಮ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಸಂದರ್ಭವನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುವಾಗ ಅಂಗಾಂಶಗಳೊಳಗಿನ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್‌ನಲ್ಲಿನ ಒಂದು ಪ್ರಬಲ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಜೊತೆಗೆ 10x ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಸಿಯಮ್ ಆಗಿದೆ. 10X Visium ನ ತತ್ವವು ಅಂಗಾಂಶ ವಿಭಾಗಗಳನ್ನು ಇರಿಸಲಾಗಿರುವ ಗೊತ್ತುಪಡಿಸಿದ ಕ್ಯಾಪ್ಚರ್ ಪ್ರದೇಶದೊಂದಿಗೆ ವಿಶೇಷ ಚಿಪ್‌ನಲ್ಲಿದೆ. ಈ ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವ ಪ್ರದೇಶವು ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದ ತಾಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಅಂಗಾಂಶದೊಳಗೆ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಸ್ಥಳಕ್ಕೆ ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ. ಅಂಗಾಂಶದಿಂದ ಸೆರೆಹಿಡಿಯಲಾದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುಗಳನ್ನು ನಂತರ ರಿವರ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಅನನ್ಯ ಆಣ್ವಿಕ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಳೊಂದಿಗೆ (UMIs) ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದ ಸ್ಪಾಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು UMI ಗಳು ನಿಖರವಾದ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಏಕ-ಕೋಶ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಪರಿಮಾಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರಾದೇಶಿಕವಾಗಿ ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು UMI ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯು ರಚಿಸಲಾದ ಡೇಟಾದ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ, ಸಂಶೋಧಕರು ಜೀವಕೋಶಗಳ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಸಂಘಟನೆ ಮತ್ತು ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ ಸಂಕೀರ್ಣ ಆಣ್ವಿಕ ಸಂವಹನಗಳ ಆಳವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು, ಆಂಕೊಲಾಜಿ, ನರವಿಜ್ಞಾನ, ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, ರೋಗನಿರೋಧಕ ಶಾಸ್ತ್ರ ಸೇರಿದಂತೆ ಅನೇಕ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡಬಹುದು. , ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು.
ವೇದಿಕೆ: 10X ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಸಿಯಮ್ ಮತ್ತು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್
