-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ -NGS
ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್‌ಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಒಟ್ಟು ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಇದು ಕೃಷಿಯೋಗ್ಯ ಮತ್ತು ಕೃಷಿ ಮಾಡಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. NGS ಜೊತೆಗಿನ ಶಾಟ್‌ಗನ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್‌ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿರುವ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಜಾತಿಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆ, ಸಮೃದ್ಧ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹರಳಿನ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳ ಹೊರತಾಗಿ, ಶಾಟ್‌ಗನ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ, ಎನ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದ ಜೀನ್‌ಗಳ ಪರಿಶೋಧನೆ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಪ್ರಭಾವಶಾಲಿ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಜಾಲಗಳ ಸ್ಥಾಪನೆಯು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಪರಿಸರ ಹಿನ್ನೆಲೆಯ ನಡುವಿನ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಸಮಗ್ರ ತಿಳುವಳಿಕೆಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ, ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಸಮುದಾಯಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಜಟಿಲತೆಗಳನ್ನು ಬಿಚ್ಚಿಡಲು ಪ್ರಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿ ನಿಂತಿದೆ, ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದ ನಡುವಿನ ಬಹುಮುಖಿ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಬೆಳಗಿಸುತ್ತದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ಗಳು: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್‌ಬಿಎಸ್‌ಇಕ್ಯೂ-ಟಿ7
-
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ಟಿಜಿಎಸ್
ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್‌ಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಇದು ಕೃಷಿಯೋಗ್ಯ ಮತ್ತು ಕೃಷಿ ಮಾಡಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್‌ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿರುವ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಎನ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಪ್ರಭಾವಿ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಇದು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಶಾಟ್‌ಗನ್ ವಿಧಾನಗಳು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ ದೀರ್ಘ-ಓದುವ ಅನುಕ್ರಮದ ಆಗಮನವು ಕ್ಷೇತ್ರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಿದೆ. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಡೌನ್‌ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಬಯೋಇನ್‌ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ, ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಮೆಟಾಜೆನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ, ಹೆಚ್ಚು ನಿರಂತರ ಜೋಡಣೆಗಳನ್ನು ಖಾತ್ರಿಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್-ಆಧಾರಿತ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಸಂಕೀರ್ಣ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಿಂದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಮತ್ತು ಮುಚ್ಚಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಉತ್ಪಾದಿಸಿದೆ ಎಂದು ವರದಿಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ (ಮಾಸ್, ಇಎಲ್, ಮತ್ತು ಇತರರು, ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್, 2020). ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ರೀಡ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುವುದು ದೋಷ ತಿದ್ದುಪಡಿಗಾಗಿ ಕಾರ್ಯತಂತ್ರದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ನ್ಯಾನೊಪೋರ್‌ನ ಅಂತರ್ಗತ ಕಡಿಮೆ ನಿಖರತೆಯನ್ನು ತಗ್ಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಿನರ್ಜಿಸ್ಟಿಕ್ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಪ್ರತಿ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಭಾವ್ಯ ಮಿತಿಗಳನ್ನು ನಿವಾರಿಸಲು ಮತ್ತು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ನಿಖರತೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ದೃಢವಾದ ಪರಿಹಾರವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್: ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ರೊಮೆಥಿಯಾನ್ 48, ಇಲ್ಯುಮಿಯಾ ಮತ್ತು ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ
-
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (WGBS)
ಸಂಪೂರ್ಣ ಜಿನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (WGBS) ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣದ ಆಳವಾದ ಪರಿಶೋಧನೆಗಾಗಿ ಚಿನ್ನದ-ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಸೈಟೋಸಿನ್‌ನಲ್ಲಿ ಐದನೇ ಸ್ಥಾನ (5-mC), ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಪ್ರಮುಖ ನಿಯಂತ್ರಕ. ಡಬ್ಲ್ಯುಜಿಬಿಎಸ್‌ನ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ತತ್ವವು ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಮೆಥೈಲೇಟೆಡ್ ಸೈಟೋಸಿನ್‌ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಗದೆ ಬಿಡುವಾಗ ಯುರಾಸಿಲ್‌ಗೆ (ಸಿ ಯಿಂದ ಯು) ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ತಂತ್ರವು ಸಿಂಗಲ್-ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ನೀಡುತ್ತದೆ, ಸಂಶೋಧಕರು ಮೀಥೈಲೋಮ್ ಅನ್ನು ಸಮಗ್ರವಾಗಿ ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಅಸಹಜ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್. WGBS ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ, ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸಾಟಿಯಿಲ್ಲದ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು, ಇದು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
-
ಹೈ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ATAC-seq) ಜೊತೆಗೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಪೋಸೇಸ್-ಆಕ್ಸೆಸ್ಬಲ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್‌ಗಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ATAC-seq ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರವೇಶದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ. ಇದರ ಬಳಕೆಯು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಮೇಲೆ ಜಾಗತಿಕ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಸಂಕೀರ್ಣ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಆಳವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಧಾನವು ಹೈಪರ್ಆಕ್ಟಿವ್ Tn5 ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಪೋಸೇಸ್ ಅನ್ನು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ತುಣುಕು ಮತ್ತು ಟ್ಯಾಗ್ ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮ ಅಡಾಪ್ಟರ್‌ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಬಳಸುತ್ತದೆ. ನಂತರದ PCR ವರ್ಧನೆಯು ಒಂದು ಅನುಕ್ರಮ ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ರಚನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳ-ಸಮಯದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಸಮಗ್ರ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ATAC-seq ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದಾದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಸಮಗ್ರ ನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಕೇವಲ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶದ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳು ಅಥವಾ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹಿಸ್ಟೋನ್-ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸುವ ವಿಧಾನಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. ಈ ತೆರೆದ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವುದರ ಮೂಲಕ, ATAC-seq ಸಕ್ರಿಯ ನಿಯಂತ್ರಕ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್‌ಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಾಧ್ಯತೆಯಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ, ಜೀನೋಮ್‌ನಾದ್ಯಂತ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಡೈನಾಮಿಕ್ ಮಾಡ್ಯುಲೇಶನ್‌ಗೆ ಮೌಲ್ಯಯುತ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
-
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-PacBio
16S ಮತ್ತು 18S rRNA ಜೀನ್‌ಗಳು, ಇಂಟರ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರೈಬ್ಡ್ ಸ್ಪೇಸರ್ (ITS) ಪ್ರದೇಶದ ಜೊತೆಗೆ, ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಮತ್ತು ಹೈಪರ್-ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯಿಂದಾಗಿ ಪ್ರಮುಖ ಆಣ್ವಿಕ ಫಿಂಗರ್‌ಪ್ರಿಂಟಿಂಗ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸಲು ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವರ್ಧನೆ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮವು ವಿವಿಧ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಾದ್ಯಂತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ ವಿಧಾನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ 16S ಮತ್ತು ITS1 ನ V3-V4 ನಂತಹ ಸಣ್ಣ ಹೈಪರ್ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುತ್ತದೆ, 16S, 18S ಮತ್ತು ITS ನ ಪೂರ್ಣ ಉದ್ದವನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಉನ್ನತ ವರ್ಗೀಕರಣದ ಟಿಪ್ಪಣಿಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು ಎಂದು ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಸಮಗ್ರ ವಿಧಾನವು ನಿಖರವಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಿದ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಶೇಕಡಾವಾರು ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಜಾತಿಗಳ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗೆ ವಿಸ್ತರಿಸುವ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಸಾಧಿಸುತ್ತದೆ. PacBio ನ ಏಕ-ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ ರಿಯಲ್-ಟೈಮ್ (SMRT) ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ದೀರ್ಘ ಓದುವಿಕೆಗಳನ್ನು (HiFi) ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಎದ್ದು ಕಾಣುತ್ತದೆ, ಇದು ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್‌ನ ನಿಖರತೆಗೆ ಪ್ರತಿಸ್ಪರ್ಧಿಯಾಗಿದೆ. ಈ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಸಾಟಿಯಿಲ್ಲದ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ - ಆನುವಂಶಿಕ ಭೂದೃಶ್ಯದ ವಿಹಂಗಮ ನೋಟ. ವಿಸ್ತೃತ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಅಥವಾ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಸಮುದಾಯಗಳಲ್ಲಿ ಜಾತಿಯ ಟಿಪ್ಪಣಿಯಲ್ಲಿನ ನಿರ್ಣಯವನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ, ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಜಟಿಲತೆಗಳ ಆಳವಾದ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
-
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದೊಂದಿಗೆ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ 16S, 18S, ಮತ್ತು ITS ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಿಕೊಂಡು, ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳಲ್ಲಿ ಫೈಲೋಜೆನಿ, ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ ಮತ್ತು ಜಾತಿಗಳ ಸಮೃದ್ಧಿಯನ್ನು ಬಿಚ್ಚಿಡಲು ಪ್ರಬಲ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಈ ವಿಧಾನವು ಹೌಸ್‌ಕೀಪಿಂಗ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳ ಹೈಪರ್ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಮೂಲಕ ಆಣ್ವಿಕ ಫಿಂಗರ್‌ಪ್ರಿಂಟ್ ಎಂದು ಮೂಲತಃ ಪರಿಚಯಿಸಲಾಯಿತುವೋಸೆಸ್ ಮತ್ತು ಇತರರು1977 ರಲ್ಲಿ, ಈ ತಂತ್ರವು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಕ್ರಾಂತಿಗೊಳಿಸಿತು. 16S (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ), 18S (ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು), ಮತ್ತು ಆಂತರಿಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಸ್ಪೇಸರ್ (ITS, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು) ಅನುಕ್ರಮದ ಮೂಲಕ, ಸಂಶೋಧಕರು ಹೇರಳವಾಗಿರುವ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರವಲ್ಲದೆ ಅಪರೂಪದ ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸಲಾಗದವುಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು. ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ, ಮಾನವನ ಬಾಯಿ, ಕರುಳುಗಳು, ಮಲ ಮತ್ತು ಅದರಾಚೆಯೂ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ವಿವೇಚಿಸುವಲ್ಲಿ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಸಾಧನವಾಗಿದೆ.
-
ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಫಂಗಲ್ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಮರು ಅನುಕ್ರಮ
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಮುನ್ನಡೆಸಲು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಫಂಗಲ್ ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮ ಯೋಜನೆಗಳು ಪ್ರಮುಖವಾಗಿವೆ. ಇದು ಹುದುಗುವಿಕೆ ಇಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್, ಕೈಗಾರಿಕಾ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ದ್ವಿತೀಯಕ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳ ಅನ್ವೇಷಣೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮರು-ಅನುಕ್ರಮವು ಪರಿಸರದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು, ತಳಿಗಳನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿಸಲು ಮತ್ತು ವೈದ್ಯಕೀಯ, ಕೃಷಿ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಪರಿಣಾಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಆನುವಂಶಿಕ ವಿಕಾಸದ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆ.
-
PacBio-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದ 16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ (16S/18S/ITS) ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಬಿಯಲ್ ಡೈವರ್ಸಿಟಿ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ಶ್ರೀಮಂತ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರವಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಯೋಜನಾ ವರದಿಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ. ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಲು ಮೂಲಭೂತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವರದಿ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಉದ್ದೇಶದ ಪ್ರಕಾರ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಮೃದುವಾಗಿ ಹೊಂದಿಸಬಹುದು. ವಿಂಡೋಸ್ ಆಪರೇಟಿಂಗ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಸರಳ ಮತ್ತು ವೇಗವಾಗಿದೆ.
-
PacBio-ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ (ಉಲ್ಲೇಖ-ಅಲ್ಲದ)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಇನ್‌ಪುಟ್ ಆಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವುದರಿಂದ, ಈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು (ಜೋಡಣೆ ಇಲ್ಲದೆ) ಗುರುತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖದ ಜಿನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ, ತಿಳಿದಿರುವ ಜೀನ್‌ಗಳು, ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳು, ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಆಪ್ಟಿಮೈಸ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ mRNA ರಚನೆಗಳ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು. NGS ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರವಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡೌನ್‌ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಶನ್ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
-
ಕಡಿಮೆಯಾದ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (RRBS)
ಕಡಿಮೆಯಾದ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (RRBS) DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಯಲ್ಲಿ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (WGBS) ಗೆ ವೆಚ್ಚ-ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ ಹೊರಹೊಮ್ಮಿದೆ. ಒಂದೇ ಬೇಸ್ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸುವ ಮೂಲಕ WGBS ಸಮಗ್ರ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಅದರ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೆಚ್ಚವು ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸುವ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. ಜೀನೋಮ್‌ನ ಪ್ರಾತಿನಿಧಿಕ ಭಾಗವನ್ನು ಆಯ್ದವಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವ ಮೂಲಕ RRBS ಈ ಸವಾಲನ್ನು ಕಾರ್ಯತಂತ್ರವಾಗಿ ತಗ್ಗಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಧಾನವು 200-500/600 bps ತುಣುಕುಗಳ ಗಾತ್ರದ ಆಯ್ಕೆಯ ನಂತರ MspI ಸೀಳಿನಿಂದ CpG ದ್ವೀಪ-ಸಮೃದ್ಧ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣದ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿದೆ. ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, CpG ದ್ವೀಪಗಳಿಗೆ ಸಮೀಪವಿರುವ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ದೂರದ CpG ದ್ವೀಪಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವವರನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಹೊರಗಿಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಬೈಸಲ್ಫೈಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಡಿಎನ್‌ಎ ಮೆತಿಲೀಕರಣದ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಪತ್ತೆಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮ ವಿಧಾನ, PE150, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಮಧ್ಯಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಒಳಸೇರಿಸುವಿಕೆಯ ತುದಿಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್‌ನ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. RRBS ಒಂದು ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಸಾಧನವಾಗಿದ್ದು ಅದು ವೆಚ್ಚ-ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ DNA ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಜ್ಞಾನವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ.
-
ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶಗಳೊಳಗಿನ ಎಲ್ಲಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಗಳ ಸಮಗ್ರ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್‌ಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಈ ಅತ್ಯಾಧುನಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಪ್ರಬಲವಾದ ಸಾಧನವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳು, ಜೀನ್ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅನಾವರಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂಲಭೂತ ಸಂಶೋಧನೆ, ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಡಯಾಗ್ನೋಸ್ಟಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಡ್ರಗ್ ಡೆವಲಪ್‌ಮೆಂಟ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಂಡಿದೆ, ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವು ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ರೆಗ್ಯುಲೇಷನ್‌ನ ಜಟಿಲತೆಗಳ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ನಮ್ಮ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿ ಸಂಸ್ಕರಣೆಯು ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಡಿಪ್ಲೀಷನ್ ಮತ್ತು ಡೈರೆಕ್ಷನಲ್ ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್
-
ಮೆಟಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಹತೋಟಿಯಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಂಡು, BMKGENE ನ ಮೆಟಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಯು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಡೈನಾಮಿಕ್ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಅನಾವರಣಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ರೋಕ್ಯಾರಿಯೋಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ವೈರಸ್‌ಗಳು, ಮಣ್ಣು, ನೀರು, ಸಮುದ್ರ, ಮಲ ಮತ್ತು ಕರುಳಿನಂತಹ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಿಸುತ್ತದೆ. ಸಂಕೀರ್ಣ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಮುದಾಯಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲು ನಮ್ಮ ಸಮಗ್ರ ಸೇವೆಯು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಹೊರತಾಗಿ, ನಮ್ಮ ಮೆಟಾಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಯು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪುಷ್ಟೀಕರಣದ ಅನ್ವೇಷಣೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಪಾತ್ರಗಳ ಮೇಲೆ ಬೆಳಕು ಚೆಲ್ಲುತ್ತದೆ. ಈ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪರಿಸರದ ಗೂಡುಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ, ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್‌ನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳನ್ನು ನೀವು ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡುವಾಗ ಜೈವಿಕ ಒಳನೋಟಗಳ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿ.
-
ಡಿ ನೋವೋ ಫಂಗಲ್ ಜಿನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
BMKGENE ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಬಹುಮುಖ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸಂಶೋಧನೆ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು ಮತ್ತು ಅಪೇಕ್ಷಿತ ಜೀನೋಮ್ ಸಂಪೂರ್ಣತೆಯನ್ನು ಪೂರೈಸುತ್ತದೆ. ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ಓದುವ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವುದರಿಂದ ಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಅಥವಾ ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಿಯೊವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕಿರು-ಓದುವಿಕೆ ಮತ್ತು ದೀರ್ಘ-ಓದುವ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಉದ್ದವಾದ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜೀನೋಮ್‌ಗಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಹೈ-ಸಿ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವುದು ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ, ಸಂಪೂರ್ಣ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.
