ಸಸ್ಯ/ಪ್ರಾಣಿ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ
ಸೇವೆಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿಕೆಯು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಅಥವಾ PCR-ಮುಕ್ತವಾಗಿರಬಹುದು
● 4 ಅನುಕ್ರಮ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ: Illumina NovaSeq, MGI T7, Nanopore Promethion P48, ಅಥವಾ PacBio Revio.
● ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ರೂಪಾಂತರಗಳ ಪತ್ತೆಗೆ ಕೇಂದ್ರೀಕೃತವಾಗಿದೆ: SNP, InDel, SV ಮತ್ತು CNV
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಕಟಣೆ ದಾಖಲೆಗಳು: 1000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಸಂಚಿತ ಅನುಭವವು 5000 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಚಿತ ಪ್ರಭಾವದ ಅಂಶದೊಂದಿಗೆ 1000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಕಟಿತ ಪ್ರಕರಣಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದೆ.
●ಸಮಗ್ರ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಬದಲಾವಣೆಯ ಕರೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಸೇರಿದಂತೆ.
● ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ:ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3-ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಫಾಲೋ-ಅಪ್, ಟ್ರಬಲ್‌ಶೂಟಿಂಗ್ ನೆರವು ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
●ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ: ಗುರುತಿಸಲಾದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ನಾವು ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ, ಬಹು ಸಂಶೋಧನಾ ಯೋಜನೆಗಳ ಕುರಿತು ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗುರುತಿಸಬೇಕಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳು | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಿದ ಆಳ |
| SNP ಮತ್ತು InDel | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ PE150 ಅಥವಾ MGI T7 | 10x |
| SV ಮತ್ತು CNV (ಕಡಿಮೆ ನಿಖರ) | 30x | |
| SV ಮತ್ತು CNV (ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರ) | ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪ್ರಾಮ್ P48 | 20x |
| SNPs, Indels, SV ಮತ್ತು CNV | PacBio Revio | 10x |
ಮಾದರಿ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು
| ಅಂಗಾಂಶ ಅಥವಾ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ/ಎಂಜಿಐ | ನ್ಯಾನೋಪೋರ್ | PacBio
| ||
| ಪ್ರಾಣಿ ಒಳಾಂಗಗಳು | 0.5-1 ಗ್ರಾಂ | ≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 3.5 ಗ್ರಾಂ
| ||
| ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಸ್ನಾಯು | ≥ 5 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 5 ಗ್ರಾಂ
| |||
| ಸಸ್ತನಿ ರಕ್ತ | 1.5 ಮಿ.ಲೀ | ≥ 0.5 ಮಿ.ಲೀ
| ≥ 5 ಮಿಲಿ
| ||
| ಕೋಳಿ/ಮೀನಿನ ರಕ್ತ | ≥ 0.1 ಮಿಲಿ
| ≥ 0.5 ಮಿ.ಲೀ
| |||
| ಸಸ್ಯ - ತಾಜಾ ಎಲೆ | 1-2 ಗ್ರಾಂ | ≥ 2 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 5 ಗ್ರಾಂ
| ||
| ಸುಸಂಸ್ಕೃತ ಕೋಶಗಳು |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| ಕೀಟ ಮೃದು ಅಂಗಾಂಶ/ವೈಯಕ್ತಿಕ | 0.5-1 ಗ್ರಾಂ | ≥ 1 ಗ್ರಾಂ
| ≥ 3 ಗ್ರಾಂ
| ||
| ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ DNA
| ಏಕಾಗ್ರತೆ: ≥ 1 ng/ µL ಮೊತ್ತ: ≥ 30 ng ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ
| ಏಕಾಗ್ರತೆ ಮೊತ್ತ
OD260/280
OD260/230
ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ
| ≥ 40 ng/ µL 4 µg/ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್/ಮಾದರಿ
1.7-2.2
≥1.5 | ಏಕಾಗ್ರತೆ ಮೊತ್ತ
OD260/280
OD260/230
ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ | ≥ 50 ng/ µL 10 μg/ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್/ಮಾದರಿ
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| PCR-ಮುಕ್ತ ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿ: ಏಕಾಗ್ರತೆ≥ 40 ng/ µL ಮೊತ್ತ≥ 500 ng | |||||
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಡಿಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಡೇಟಾ ವಿತರಣೆ
ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
- ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
- ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಜೋಡಣೆಯ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು
- ಭಿನ್ನ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ: SNP, InDel, SV ಮತ್ತು CNV
- ರೂಪಾಂತರಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಉಲ್ಲೇಖದ ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಜೋಡಣೆಯ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು - ಅನುಕ್ರಮ ಆಳ ವಿತರಣೆ
ಬಹು ಮಾದರಿಗಳ ನಡುವೆ SNP ಕರೆ
InDel ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ - CDS ಪ್ರದೇಶ ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ InDel ಉದ್ದದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು
ಜೀನೋಮ್‌ನಾದ್ಯಂತ ವಿಭಿನ್ನ ವಿತರಣೆ - ಸರ್ಕೋಸ್ ಕಥಾವಸ್ತು
ಗುರುತಿಸಲಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೀನ್‌ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ - ಜೀನ್ ಆಂಟಾಲಜಿ
ಚೈ, Q. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಹತ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಆಂಥೋಸಯಾನಿನ್ ಶೇಖರಣೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಗ್ಲುಟಾಥಿಯೋನ್ ಎಸ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಫರೇಸ್ GhTT19 ಹೂವಿನ ದಳಗಳ ವರ್ಣದ್ರವ್ಯವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ', ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್, 21(2), ಪು. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
ಚೆಂಗ್, ಎಚ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಲೆವೆಲ್ ವೈಲ್ಡ್ ಹೆವಿಯಾ ಬ್ರೆಸಿಲಿಯೆನ್ಸಿಸ್ ಜಿನೋಮ್ ರಬ್ಬರ್ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಜೀನೋಮಿಕ್-ಅಸಿಸ್ಟೆಡ್ ಬ್ರೀಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಬೆಲೆಬಾಳುವ ಸ್ಥಳಗಳಿಗೆ ಹೊಸ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ', ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್, 21(5), ಪುಟಗಳು. 1058-1072. doi: 10.1111/PBI.14018.
ಲಿ, ಎ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2021) 'ಜೀನೋಮ್ ಆಫ್ ದಿ ಎಸ್ಟುವಾರಿನ್ ಸಿಂಪಿ ಹವಾಮಾನ ಪ್ರಭಾವ ಮತ್ತು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಟಿಯ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ', ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿ 2021 4:1, 4(1), ಪುಟಗಳು. 1–12. doi: 10.1038/s42003-021-02823-6.
ಝೆಂಗ್, ಟಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಜೀನೋಮ್ ಮತ್ತು ಮೆತಿಲೀಕರಣ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಕಾಲಾನಂತರದಲ್ಲಿ ಚೀನೀ ಸ್ಥಳೀಯ ಕೋಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಜಾತಿಗಳ ಸಂರಕ್ಷಣೆಗೆ ಒಳನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ', ಕಮ್ಯುನಿಕೇಶನ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿ, 5(1), ಪುಟಗಳು. 1–12. doi: 10.1038/s42003-022-03907-7.
