ಪೆಸಿಫಿಕ್ ಬಯೋಸೈನ್ಸ್ (ಪಿಎಸಿಬಿಐಒ) ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಇನ್ಪುಟ್ ಆಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಂಡು, ಈ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ (ಜೋಡಣೆ ಇಲ್ಲದೆ). ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ವಿರುದ್ಧ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ, ತಿಳಿದಿರುವ ಜೀನ್ಗಳು, ಪ್ರತಿಗಳು, ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದುವಂತೆ ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಮುಂತಾದ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ರಚನೆಗಳ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಬಹುದು. ಎನ್ಜಿಎಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗಿನ ಜಂಟಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಶಕ್ತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಕೆಳಮಟ್ಟದ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.