ಉಲ್ಲೇಖಿತವಲ್ಲದ mRNA ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿಕೆಯ ಮೊದಲು ಪಾಲಿ ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಕ್ಯಾಪ್ಚರ್
● ಯಾವುದೇ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ನಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರ: ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳ ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಆಧರಿಸಿ, ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಯುನಿಜೆನ್‌ಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ರಚಿಸುವುದು (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)
● ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ರಚನೆಯ ಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: BMKGENE ನಲ್ಲಿ 600,000 ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸುವ ದಾಖಲೆಯೊಂದಿಗೆ, ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳು, ಅಂಗಾಂಶಗಳು ಮತ್ತು ದೇಹದ ದ್ರವಗಳಂತಹ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿ ಯೋಜನೆಗೆ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ. ನಾವು ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ 100,000 mRNA-Seq ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಮುಚ್ಚಿದ್ದೇವೆ.
●ಕಠಿಣ ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ: ಮಾದರಿ ಮತ್ತು ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿಕೆಯಿಂದ ಹಿಡಿದು ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್‌ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್‌ವರೆಗೆ ನಾವು ಎಲ್ಲಾ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಕೋರ್ ಕಂಟ್ರೋಲ್ ಪಾಯಿಂಟ್‌ಗಳನ್ನು ಅಳವಡಿಸುತ್ತೇವೆ. ಈ ನಿಖರವಾದ ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆಯು ಸ್ಥಿರವಾದ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಖಾತ್ರಿಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
● ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ: ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಸ್ಡ್ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು (DEGs) ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ನಾವು ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತೇವೆ, ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
●ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ: ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3-ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಫಾಲೋ-ಅಪ್, ಟ್ರಬಲ್‌ಶೂಟಿಂಗ್ ನೆರವು ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಮಾದರಿ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಡೇಟಾವನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| ಪಾಲಿ ಎ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 ಜಿಬಿ | Q30≥85% |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳು:
| Conc.(ng/μl) | ಮೊತ್ತ (μg) | ಶುದ್ಧತೆ | ಸಮಗ್ರತೆ |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್‌ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್‌ಎ ಮಾಲಿನ್ಯವನ್ನು ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ: RIN≥4.0; ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಬೇಸ್‌ಲೈನ್ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
● ಸಸ್ಯಗಳು:
ಬೇರು, ಕಾಂಡ ಅಥವಾ ದಳ: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಎಲೆ ಅಥವಾ ಬೀಜ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಹಣ್ಣು: 1.2 ಗ್ರಾಂ
● ಪ್ರಾಣಿ:
ಹೃದಯ ಅಥವಾ ಕರುಳು: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಒಳಾಂಗಗಳು ಅಥವಾ ಮೆದುಳು: 240 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಸ್ನಾಯು: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಮೂಳೆಗಳು, ಕೂದಲು ಅಥವಾ ಚರ್ಮ: 1 ಗ್ರಾಂ
● ಆರ್ತ್ರೋಪಾಡ್ಸ್:
ಕೀಟಗಳು: 6 ಗ್ರಾಂ
ಕ್ರಸ್ಟಸಿಯಾ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
● ಸಂಪೂರ್ಣ ರಕ್ತ: 1 ಟ್ಯೂಬ್
● ಕೋಶಗಳು: 106 ಜೀವಕೋಶಗಳು
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೈನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಅನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಗುಂಪು+ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಉದಾ A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ಸಾಗಣೆ:
1. ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
2. ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೇಬಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳು: ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಥಿರೀಕರಣ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಒಣಗಿಸಬಹುದು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೇಬಲ್®) ಮತ್ತು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಯುನಿಜೀನ್ ಆಯ್ಕೆ
ಯುನಿಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಜೈವಿಕ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳ ಮಾದರಿ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಮತ್ತು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳು (DEGs)
DEG ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
DEG ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ
BMKGene ನ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ NGS mRNA ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹಣೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಶೆನ್, ಎಫ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2020) 'ಡಿ ನೊವೊ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಅಮುರ್ ಕ್ಯಾಟ್‌ಫಿಶ್‌ನ ಗೊನಾಡ್ಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಲೈಂಗಿಕ-ಪಕ್ಷಪಾತದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ (ಸಿಲುರಸ್ ಅಸೋಟಸ್)', ಜಿನೋಮಿಕ್ಸ್, 112(3), ಪುಟಗಳು. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
ಜಾಂಗ್, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2016) 'ಬಲ್ಬ್ ಊತ ಮತ್ತು ಈರುಳ್ಳಿಯಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸುಕ್ರೋಸ್ ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಆಲಿಯಮ್ ಸೆಪಾ ಎಲ್.)', ಫ್ರಾಂಟಿಯರ್ಸ್ ಇನ್ ಪ್ಲಾಂಟ್ ಸೈನ್ಸ್, 7(ಸೆಪ್ಟೆಂಬರ್), ಪು. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
ಝು, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2017) 'ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ, ಕ್ಯಾರೆಕ್ಟರೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ಆನೋಟೇಶನ್ ಫಾರ್ ದಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಆಫ್ ಸಾರ್ಕೊಚೆಲಿಚ್ಥಿಸ್ ಸಿನೆನ್ಸಿಸ್', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
ಝೌ, ಎಲ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2021) 'ಡಿ ನೊವೊ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಲವಣಾಂಶದ ಒತ್ತಡದಲ್ಲಿ ಪೊಡೊಕಾರ್ಪಸ್ ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫಿಲಸ್‌ನ ಉಪ್ಪು ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ', BMC ಸಸ್ಯ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, 21(1), ಪುಟಗಳು. 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
