ಟಿ 2 ಟಿ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ, ಗ್ಯಾಪ್ ಫ್ರೀ ಜೀನೋಮ್
1stಎರಡು ಅಕ್ಕಿ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು1
ಶೀರ್ಷಿಕೆ: ಕ್ಸಿಯಾನ್/ಇಂಡಿಕಾ ಅಕ್ಕಿಗೆ ಎರಡು ಅಂತರ-ಮುಕ್ತ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನವು ಸಸ್ಯ ಸೆಂಟ್ರೊಮೀರ್ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪದ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ
Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
ಪೋಸ್ಟ್ ಮಾಡಿದ ಸಮಯ: ಜನವರಿ 01, 2021.
ಸಂಸ್ಥೆ: ಹುವಾಜಾಂಗ್ ಕೃಷಿ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ, ಚೀನಾ
ವಸ್ತುಗಳು
ಒ. ಸಟಿವಾ ಕ್ಸಿಯಾನ್/ಇಂಡಿಕಾಅಕ್ಕಿ ಪ್ರಭೇದಗಳ 'hen ೆನ್‌ಶಾನ್ 97 (ZS97)' ಮತ್ತು 'ಮಿಂಗ್‌ಹುಯಿ 63 (MH63)
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ
Ngs ಓದು
ಡೇಟಾ:
ZS97: 8.34 GB ~ 23x） HIFI READS + 48.39 GB (~ 131x) Clr ಓದು
MH63: 37.88 GB (~ 103x) HIFI READS + 48.97 GB (~ 132x) Clr ಓದು
ಚಿತ್ರ 1 ಅಕ್ಕಿಯ ಎರಡು ಅಂತರ-ಮುಕ್ತ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು (MH63 ಮತ್ತು ZS97)
2ndಬಾಳೆ ಜೀನೋಮ್2
ಶೀರ್ಷಿಕೆ: ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಬಳಸಿ ಬಾಳೆಹಣ್ಣಿನ ಗ್ಯಾಪ್ಲೆಸ್ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳು
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
ಪೋಸ್ಟ್ ಮಾಡಿದ ಸಮಯ: ಏಪ್ರಿಲ್ 17, 2021.
ಸಂಸ್ಥೆ: ಯೂನಿವರ್ಸಿಟಿ ಪ್ಯಾರಿಸ್-ಸ್ಯಾಕ್ಲೇ, ಫ್ರಾನ್ಸ್
ವಸ್ತುಗಳು
ಎರಡು ಬಾರಿಹುಳಅ ೦ ಗಡಿದುಷ್ಕರ್ಮಿ(ಒಂದು ಬಗೆಯ dhಷಧ)
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ ಮತ್ತು ಡೇಟಾ:
HISEQ2500 PE250 ಮೋಡ್+ ಗುಲಾಮ/ ಪ್ರಮೀತಿಯನ್ (93GB, ~ 200x)+ ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ನಕ್ಷೆ (DLE-1+ BSPQ1)
ಕೋಷ್ಟಕ 1 ಮೂಸಾ ಅಕ್ಯುಮಿನಾಟಾ (ಡಿಹೆಚ್-ಪಹಾಂಗ್) ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗಳ ಹೋಲಿಕೆ
ಚಿತ್ರ 2 ಮೂಸಾ ಜಿನೊಮ್ಸ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ ಹೋಲಿಕೆ
3rdಫೆಯೋಡಾಕ್ಟೈಲಮ್ ಟ್ರೈಕಾರ್ನುಟಮ್ ಜೀನೋಮ್3
ಶೀರ್ಷಿಕೆ: ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿP
ಹೆಯೋಡಾಕ್ಟಿಲಮ್ ಟ್ರೈಕಾರ್ನಟಮ್
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
ಪೋಸ್ಟ್ ಮಾಡಿದ ಸಮಯ: ಮೇ 04, 2021
ಸಂಸ್ಥೆ: ವೆಸ್ಟರ್ನ್ ಯೂನಿವರ್ಸಿಟಿ, ಕೆನಡಾ
ವಸ್ತುಗಳು
ಫೆಯೋಡಾಕ್ಟಿಲಮ್ ಟ್ರೈಕಾರ್ನಟಮ್(ಪಾಚಿಗಳ ಸಂಸ್ಕೃತಿ ಸಂಗ್ರಹ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಟೊಜೋವಾ ಸಿಸಿಎಪಿ 1055/1)
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ ಮತ್ತು ಡೇಟಾ:
1 ಆಕ್ಸ್‌ಫರ್ಡ್ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಮಿನಿಯನ್ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ + ಎ 2 × 75 ಜೋಡಿ-ಎಂಡ್ ಮಿಡ್- output ಟ್‌ಪುಟ್ ನೆಕ್ಸ್ಟ್‌ಸೆಕ್ 550 ರನ್
ಚಿತ್ರ 3 ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಾಗಿ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
4thಮಾನವ ಸಿಎಚ್‌ಎಂ 13 ಜೀನೋಮ್4
ಶೀರ್ಷಿಕೆ: ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಅನುಕ್ರಮ
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
ಪೋಸ್ಟ್ ಮಾಡಿದ ಸಮಯ: ಮೇ 27, 2021
ಸಂಸ್ಥೆ: ನ್ಯಾಷನಲ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ ಆಫ್ ಹೆಲ್ತ್ (ಎನ್ಐಹೆಚ್), ಯುಎಸ್ಎ
ವಸ್ತುಗಳು: ಸೆಲ್ ಲೈನ್ ಸಿಎಚ್‌ಎಂ 13
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ ಮತ್ತು ಡೇಟಾ:
. ಮತ್ತು ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್-ಸೆಕ್
GRCH38 ಮತ್ತು T2T-CHM13 ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಗಳ ಕೋಷ್ಟಕ 2 ಹೋಲಿಕೆ
ಉಲ್ಲೇಖ
1.ಸರ್ಗೆ ನೂರ್ಕ್ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಅನುಕ್ರಮ. BIORXIV 2021.05.26.445798; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2. ಕ್ಯಾರೋಲಿನ್ ಬೆಲ್ಸರ್ ಮತ್ತು ಇತರರು. ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಬಾಳೆಹಣ್ಣಿನ ಅಂತರವಿಲ್ಲದ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್‌ಗಳು. BIORXIV 2021.04.16.440017; doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3. ಡೇನಿಯಲ್ ಜೆ. ಗಿಗುರೆ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಫಿಯೋಡಾಕ್ಟೈಲಮ್ ಟ್ರೈಕಾರ್ನಟಮ್ನ ಟೆಲೋಮಿಯರ್-ಟು-ಟೆಲೋಮಿಯರ್ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ. BIORXIV 2021.05.04.442596; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.ಜಿಯಾ-ಮಿಂಗ್ ಸಾಂಗ್ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಕ್ಸಿಯಾನ್/ಇಂಡಿಕಾ ಅಕ್ಕಿಗೆ ಎರಡು ಅಂತರ-ಮುಕ್ತ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನವು ಸಸ್ಯ ಸೆಂಟ್ರೊಮೀರ್ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪದ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ. BIORXIV 2020.12.24.424073; doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಜನವರಿ -06-2022