mRNA-seq (NGS) - ಡಿ ನೋವೋ

mRNA ಅನುಕ್ರಮವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ mRNA ಪ್ರತಿಗಳ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವಾಗಿದೆ. BMKCloud De novo mRNA-seq ಪೈಪ್‌ಲೈನ್ ಅನ್ನು ಯಾವುದೇ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಲಭ್ಯವಿಲ್ಲದಿದ್ದಾಗ ಪಾಲಿ-ಎ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಅನುಕ್ರಮ ಲೈಬ್ರರಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪೈಪ್ಲೈನ್ ​​ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣದೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ, ಅದರ ನಂತರಡಿ ನೋವೊಪ್ರತಿಲೇಖನ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಯುನಿಜೀನ್ ಸೆಟ್ ಆಯ್ಕೆ. ಯುನಿಜೀನ್ ರಚನೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಕೋಡಿಂಗ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ (CDS) ಮತ್ತು ಸರಳ ಅನುಕ್ರಮ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು (SSR) ಊಹಿಸುತ್ತದೆ. ತರುವಾಯ, ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಶನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪರೀಕ್ಷಿತ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು (DEG ಗಳು) ಕಂಡುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯಲು DEG ಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ.