ಹೈ-ಸಿ ಆಧಾರಿತ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ
ಹೈ-ಸಿ ಎನ್ನುವುದು ಪ್ರಾಕ್ಸಿಮಿಟಿ-ಆಧಾರಿತ ಸಂವಹನಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೂಪುಟ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಒಂದು ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಈ ಸಂವಹನಗಳ ತೀವ್ರತೆಯು ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಮೇಲಿನ ದೈಹಿಕ ಅಂತರದೊಂದಿಗೆ ನಕಾರಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಡ್ರಾಫ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್, ಆದೇಶ ಮತ್ತು ದೃಷ್ಟಿಕೋನಗಳಿಗೆ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ನೀಡಲು ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಖ್ಯೆಯ ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಮೇಲೆ ಲಂಗರು ಹಾಕಲು ಹೈ-ಸಿ ಡೇಟಾವನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ಜನಸಂಖ್ಯೆ ಆಧಾರಿತ ಆನುವಂಶಿಕ ನಕ್ಷೆಯ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಹೈ-ಸಿ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
PE 1550 ರೊಂದಿಗೆ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೊವಾಸೆಕ್‌ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮ.
● ಸೇವೆಗೆ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಬದಲು, ಫಾರ್ಮಾಲ್ಡಿಹೈಡ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಅಡ್ಡ-ಸಂಪರ್ಕಿಸಲು ಮತ್ತು ಡಿಎನ್‌ಎ-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲು ಅಂಗಾಂಶ ಮಾದರಿಗಳು ಬೇಕಾಗುತ್ತವೆ.
Hi ಎಚ್‌ಐ-ಸಿ ಪ್ರಯೋಗವು ಬಯೋಟಿನ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಜಿಗುಟಾದ ತುದಿಗಳ ನಿರ್ಬಂಧ ಮತ್ತು ಅಂತಿಮ ದುರಸ್ತಿಗೆ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುವಾಗ ಮೊಂಡಾದ ತುದಿಗಳ ಸುತ್ತೋಲನ. ನಂತರ ಡಿಎನ್‌ಎಯನ್ನು ಸ್ಟ್ರೆಪ್ಟಾವಿಡಿನ್ ಮಣಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಕೆಳಕ್ಕೆ ಎಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರದ ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿಕೆಗಾಗಿ ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ಅನುಕೂಲಗಳು
ಹೈ-ಸಿ ಅವಲೋಕನ
(ಲೈಬರ್ಮನ್-ಐಡೆನ್ ಇ ಮತ್ತು ಇತರರು,ವಿಜ್ಞಾನ, 2009)
●ಆನುವಂಶಿಕ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಡೇಟಾದ ಅಗತ್ಯವನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವುದು:ಎಚ್‌ಐ-ಸಿ ಕಾಂಟಿಗ್ ಆಂಕರಿಂಗ್‌ಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಅಗತ್ಯ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಬದಲಿಸುತ್ತದೆ.
●ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾರ್ಕರ್ ಸಾಂದ್ರತೆ:90%ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾಂಟಿಗ್ ಆಂಕರಿಂಗ್ ಅನುಪಾತಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ.
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಕಟಣೆ ದಾಖಲೆಗಳು:1000 ವಿವಿಧ ಜಾತಿಗಳು ಮತ್ತು ವಿವಿಧ ಪೇಟೆಂಟ್‌ಗಳಿಂದ 2000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಹೈ-ಸಿ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯೊಂದಿಗೆ ಬಿಎಂಕೆಜೆನ್ ಅಪಾರ ಅನುಭವವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. 2000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಕಟಿತ ಪ್ರಕರಣಗಳು 2000 ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಚಿತ ಪ್ರಭಾವದ ಅಂಶವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.
●ಹೆಚ್ಚು ನುರಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ತಂಡ:ಹೈ-ಸಿ ಪ್ರಯೋಗಗಳು ಮತ್ತು ದತ್ತಾಂಶ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಆಂತರಿಕ ಪೇಟೆಂಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್ ಹಕ್ಕುಸ್ವಾಮ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ, ಸ್ವಯಂ-ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ ದೃಶ್ಯೀಕರಣ ದತ್ತಾಂಶ ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್ ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಬ್ಲಾಕ್ ಅನ್ನು ಚಲಿಸುವ, ಹಿಮ್ಮುಖಗೊಳಿಸುವುದು, ಹಿಂತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವುದು ಮತ್ತು ಪುನಃ ಮಾಡಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.
●ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ:ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆ ಪೂರ್ಣಗೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಫಾಲೋ-ಅಪ್, ನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
●ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ: ಗುರುತಿಸಲಾದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳೊಂದಿಗೆ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಪುಷ್ಟೀಕರಣದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ನಾವು ಅನೇಕ ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ, ಬಹು ಸಂಶೋಧನಾ ಯೋಜನೆಗಳ ಕುರಿತು ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿಕೆ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಿದ ಡೇಟಾ .ಟ್‌ಪುಟ್ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| ಹೈ-ಸಿ ಲೈಬ್ರರಿ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೊವಾಸೆಕ್ ಪಿಇ 150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಅಂಗಾಂಶ | ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಮೊತ್ತ |
| ಪ್ರಾಣಿ ಒಳಾಂಗ | ≥ 2 ಗ್ರಾಂ |
| ಪ್ರಾಣಿ ಸ್ನಾಯು | |
| ಸಸ್ತನಿ ರಕ್ತ | ≥ 2 ಮಿಲಿ |
| ಕೋಳಿ/ಮೀನು ರಕ್ತ | |
| ಸಸ್ಯ- ತಾಜಾ ಎಲೆ | ≥ 3 ಗ್ರಾಂ |
| ಸುಸಂಸ್ಕೃತ ಕೋಶಗಳು | ≥ 1x107 |
| ಕೀಟ | ≥ 2 ಗ್ರಾಂ |
ಸೇವೆಯ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ದತ್ತಾಂಶಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
1) ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಕ್ಯೂಸಿ
2) ಹೈ-ಸಿ ಲೈಬ್ರರಿ ಕ್ಯೂಸಿ: ಮಾನ್ಯ ಹೈ-ಸಿ ಸಂವಹನಗಳ ಅಂದಾಜು
3) ಹೈ-ಸಿ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ: ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್, ನಂತರ ಪ್ರತಿ ಗುಂಪಿನೊಳಗೆ ಕಾಂಟಿಗ್ ಆದೇಶಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಕಾಂಟಿಗ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ನಿಯೋಜಿಸುವುದು
4) ಹೈ-ಸಿ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
ಹೈ-ಸಿ ಲೈಬ್ರರಿ ಕ್ಯೂಸಿ-ಹೈ-ಸಿ ಮಾನ್ಯ ಸಂವಹನ ಜೋಡಿಗಳ ಅಂದಾಜು
ಹೈ-ಸಿ ಜೋಡಣೆ-ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು
ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ನಂತರದ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ-ತೊಟ್ಟಿಗಳ ನಡುವೆ ಸಿಗ್ನಲ್ ತೀವ್ರತೆಯ ಶಾಖಮಾಪ್
ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ BMKGENE ನ HI-C ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಸೇವೆಗಳು ಸುಗಮಗೊಳಿಸಿದ ಪ್ರಗತಿಯನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಟಿಯಾನ್, ಟಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು. . doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
ವಾಂಗ್, ZL ಮತ್ತು ಇತರರು. . 524140. Doi: 10.3389/fgene.2020.00279/bibtex.
ಜಾಂಗ್, ಎಫ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. . doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ಜಾಂಗ್, ಎಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಇತರರು. . doi: 10.1016/j.cell.2020.09.043
