ವಿಕಸನೀಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
ಟಕಗಿ ಮತ್ತು ಇತರರು.,ಸಸ್ಯ ಜರ್ನಲ್, 2013
●ಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:ತಳಿಗಳ ವಿಕಸನೀಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುವ ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಅಂದಾಜನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಒಮ್ಮುಖ ವಿಕಸನ ಮತ್ತು ಸಮಾನಾಂತರ ವಿಕಸನದ ಕನಿಷ್ಠ ಪ್ರಭಾವದೊಂದಿಗೆ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವಿನ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ
●ಐಚ್ಛಿಕ ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ ಮತ್ತು ವೇಗದ ಅಂದಾಜು.
●ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಪರಿಣತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಕಟಣೆ ದಾಖಲೆಗಳು: BMKGene 15 ವರ್ಷಗಳಿಂದ ಜನಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ವಿಕಸನೀಯ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ ಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ ಬೃಹತ್ ಅನುಭವವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದೆ, ಸಾವಿರಾರು ಜಾತಿಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್, ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲರ್ ಪ್ಲಾಂಟ್ಸ್, ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾದ 1000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಉನ್ನತ ಮಟ್ಟದ ಯೋಜನೆಗಳಿಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದೆ.
● ಹೆಚ್ಚು ನುರಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ತಂಡ ಮತ್ತು ಕಿರು ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಚಕ್ರ: ಸುಧಾರಿತ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಉತ್ತಮ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ, BMKGene ನ ತಂಡವು ತ್ವರಿತವಾದ ತಿರುವು ಸಮಯದೊಂದಿಗೆ ಸಮಗ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
● ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ:ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3-ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಫಾಲೋ-ಅಪ್, ಟ್ರಬಲ್‌ಶೂಟಿಂಗ್ ನೆರವು ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು ಮತ್ತು ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಅನುಕ್ರಮದ ವಿಧ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಪ್ರಮಾಣ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು |
| ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ | ≥ 30 ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು, ಪ್ರತಿ ಉಪಗುಂಪಿನಿಂದ ≥ 10 ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು
| 10x | ಏಕಾಗ್ರತೆ: ≥ 1 ng/ µL ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ≥ 30g ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ |
| ನಿರ್ದಿಷ್ಟ-ಲೋಕಸ್ ಆಂಪ್ಲಿಫೈಡ್ ಫ್ರಾಗ್ಮೆಂಟ್ (SLAF) | ಟ್ಯಾಗ್ ಆಳ: 10x ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ: <400 Mb: WGS ಅನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ <1Gb: 100K ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು 1 ಜಿಬಿ >2Gb: 300K ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು ಗರಿಷ್ಠ 500k ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು | ಏಕಾಗ್ರತೆ ≥ 5 ng/µL ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ ≥ 80 ng ನ್ಯಾನೊಡ್ರಾಪ್ OD260/280=1.6-2.5 ಅಗರೋಸ್ ಜೆಲ್: ಇಲ್ಲ ಅಥವಾ ಸೀಮಿತ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ
|
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಸೇವೆಯು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ (ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ, ಪಿಸಿಎ, ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಶ್ರೇಣೀಕರಣ ಚಾರ್ಟ್), ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಆಯ್ಕೆ (ಲಿಂಕ್ಜ್ ಅಸಮತೋಲನ, ಅನುಕೂಲಕರ ಸೈಟ್‌ಗಳ ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್-ಆಯ್ಕೆ). ಸೇವೆಯು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ, ಜೀನ್ ಹರಿವು).
*ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವ ಡೆಮೊ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು BMKGENE ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಕಟವಾದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಿಂದ ಬಂದವು
1.ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ, ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಪಿಸಿಎ ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.
ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರೊಂದಿಗಿನ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವೆ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಮತ್ತು ವಿಕಸನೀಯ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.
ಉಪ-ಜನಸಂಖ್ಯೆಗಳ ನಡುವಿನ ನಿಕಟತೆಯನ್ನು ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಪಿಸಿಎ ಹೊಂದಿದೆ.
ಜನಸಂಖ್ಯಾ ರಚನೆಯು ಆಲೀಲ್ ಆವರ್ತನಗಳ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ತಳೀಯವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಉಪ-ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
ಚೆನ್, ಇತ್ಯಾದಿ. ಅಲ್.,PNAS, 2020
2.ಸೆಲೆಕ್ಟಿವ್ ಸ್ವೀಪ್
ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್ ಒಂದು ಅನುಕೂಲಕರವಾದ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಲಿಂಕ್ ಮಾಡಲಾದ ತಟಸ್ಥ ಸೈಟ್‌ಗಳ ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅನ್‌ಲಿಂಕ್ ಮಾಡದ ಸೈಟ್‌ಗಳು ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತವೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಪ್ರಾದೇಶಿಕವು ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತದೆ.
ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಮೇಲೆ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಡಿಟೆಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹಂತದಲ್ಲಿ (10 Kb) ಸ್ಲೈಡಿಂಗ್ ವಿಂಡೋ (100 Kb) ಒಳಗೆ ಎಲ್ಲಾ SNP ಗಳ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಅನುವಂಶಿಕ ಸೂಚ್ಯಂಕ（π，Fst, Tajima's D) ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಸಂಸ್ಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವೈವಿಧ್ಯ (π)
ತಾಜಿಮಾ ಅವರ ಡಿ
ಸ್ಥಿರೀಕರಣ ಸೂಚ್ಯಂಕ(Fst)
ವು, ಇತ್ಯಾದಿ. ಅಲ್.,ಆಣ್ವಿಕ ಸಸ್ಯ, 2018
3.ಜೀನ್ ಫ್ಲೋ
ವು, ಇತ್ಯಾದಿ. ಅಲ್.,ಆಣ್ವಿಕ ಸಸ್ಯ, 2018
4. ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಇತಿಹಾಸ
ಜಾಂಗ್, ಇತ್ಯಾದಿ. ಅಲ್.,ಪ್ರಕೃತಿ ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸ, 2021
5. ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ
ಜಾಂಗ್, ಇತ್ಯಾದಿ. ಅಲ್.,ಪ್ರಕೃತಿ ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸ, 2021
ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹಣೆಯ ಮೂಲಕ BMKGene ನ ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ:
ಹಸನ್ಯಾರ್, ಎಕೆ ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಆಪಿಸ್ ಸೆರಾನಾ ಸೆರಾನಾ ಲಾರ್ವಾದಲ್ಲಿ ಸ್ಯಾಕ್‌ಬ್ರೂಡ್ ವೈರಸ್ ರೆಸಿಸ್ಟೆನ್ಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿತವಾಗಿರುವ ಎಸ್‌ಎನ್‌ಪಿ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಜೀನ್‌ಗಳ ಡಿಸ್ಕವರಿ ಹೋಲ್-ಜೀನೋಮ್ ರಿಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್',ಇಂಟರ್ನ್ಯಾಷನಲ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸೈನ್ಸಸ್, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
ಚೈ, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಕಾಡು, ತಳೀಯವಾಗಿ ಶುದ್ಧವಾದ ಚೀನೀ ದೈತ್ಯ ಸಲಾಮಾಂಡರ್‌ನ ಅನ್ವೇಷಣೆಯು ಹೊಸ ಸಂರಕ್ಷಣಾ ಅವಕಾಶಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ',ಪ್ರಾಣಿಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಂಶೋಧನೆ, 2022, ಸಂಪುಟ. 43, ಸಂಚಿಕೆ 3, ಪುಟಗಳು: 469-480, 43(3), ಪುಟಗಳು 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
ಹಾನ್, ಎಂ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಫಿಲೋಜಿಯೋಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ಯಾಟರ್ನ್ ಮತ್ತು ಪಾಪ್ಯುಲೇಶನ್ ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ಇತಿಹಾಸಸಸ್ಯ ವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಗಡಿಗಳು, 13, ಪು. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
ವಾಂಗ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಲೆವೆಲ್ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಲಾಂಗನ್ ಪ್ರವೇಶಗಳ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್‌ನಿಂದ ಲಾಂಗನ್ ವಿಕಸನಕ್ಕೆ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಒಳನೋಟಗಳು',ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
