ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ mRNA ಅನುಕ್ರಮ -PacBio
ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಪಾಲಿ-A mRNA ಯಿಂದ cDNA ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ನಂತರ ಗ್ರಂಥಾಲಯದ ತಯಾರಿಕೆ
● CCS ಮೋಡ್‌ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ಹೈಫೈ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ರಚಿಸುವುದು
● ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮ
● ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಉಲ್ಲೇಖದ ಜಿನೋಮ್ ಅಗತ್ಯವಿಲ್ಲ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು
● ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ lncRNA, ಜೀನ್ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳು, ಪಾಲಿ-ಅಡೆನೈಲೇಶನ್ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
●ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆ: HiFi ನಿಖರತೆಯೊಂದಿಗೆ ಓದುತ್ತದೆ >99.9% (Q30), NGS ಗೆ ಹೋಲಿಸಬಹುದು
● ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರತಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮವು ಐಸೊಫಾರ್ಮ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: 1100 PacBio ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಿದ ಮತ್ತು 2300 ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸುವ ದಾಖಲೆಯೊಂದಿಗೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿ ಯೋಜನೆಗೆ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
●ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ: ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3-ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಫಾಲೋ-ಅಪ್, ಟ್ರಬಲ್‌ಶೂಟಿಂಗ್ ನೆರವು ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಮಾದರಿ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಡೇಟಾವನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| PolyA ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ mRNA CCS ಲೈಬ್ರರಿ | PacBio ಸೀಕ್ವೆಲ್ II PacBio Revio | 20/40 ಜಿಬಿ 5/10 M CCS | Q30≥85% |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ಗಳು:
● ಸಸ್ಯಗಳು:
ಬೇರು, ಕಾಂಡ ಅಥವಾ ದಳ: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಎಲೆ ಅಥವಾ ಬೀಜ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಹಣ್ಣು: 1.2 ಗ್ರಾಂ
● ಪ್ರಾಣಿ:
ಹೃದಯ ಅಥವಾ ಕರುಳು: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಒಳಾಂಗಗಳು ಅಥವಾ ಮೆದುಳು: 240 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಸ್ನಾಯು: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಮೂಳೆಗಳು, ಕೂದಲು ಅಥವಾ ಚರ್ಮ: 1 ಗ್ರಾಂ
● ಆರ್ತ್ರೋಪಾಡ್ಸ್:
ಕೀಟಗಳು: 6 ಗ್ರಾಂ
ಕ್ರಸ್ಟಸಿಯಾ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
● ಸಂಪೂರ್ಣ ರಕ್ತ: 1 ಟ್ಯೂಬ್
● ಕೋಶಗಳು: 106 ಜೀವಕೋಶಗಳು
| Conc.(ng/μl) | ಮೊತ್ತ (μg) | ಶುದ್ಧತೆ | ಸಮಗ್ರತೆ |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್‌ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್‌ಎ ಮಾಲಿನ್ಯವನ್ನು ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ: RIN≥7.5; ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ: RIN≥8.0; 5.0≥ 28S/18S≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಬೇಸ್‌ಲೈನ್ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೈನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಅನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಗುಂಪು+ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಉದಾ A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ಸಾಗಣೆ:
1. ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
2. ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೇಬಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳು: ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಥಿರೀಕರಣ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಒಣಗಿಸಬಹುದು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೇಬಲ್®) ಮತ್ತು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
● ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಡೆನಿಲೇಷನ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ (APA)
● ಫ್ಯೂಷನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಬೆಂಚ್ಮಾರ್ಕಿಂಗ್ ಯುನಿವರ್ಸಲ್ ಸಿಂಗಲ್-ಕಾಪಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ (BUSCO) ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಕಾದಂಬರಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಕೋಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಭವಿಷ್ಯ (CDS) ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
● lncRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: lncRNA ಮತ್ತು ಗುರಿಗಳ ಭವಿಷ್ಯ
● ಮೈಕ್ರೋ ಸ್ಯಾಟಲೈಟ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ (SSR)
BUSCO ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರ್ಯಾಯ ಪಾಲಿಡೆನಿಲೇಷನ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ (APA)
ಕಾದಂಬರಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಈ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಪೂರ್ಣ ಪ್ರಕಟಣೆಯಲ್ಲಿ BMKGene ನ ನ್ಯಾನೊಪೋರ್ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ mRNA ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಮಾ, ವೈ ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'Nemopilema Nomurai ವಿಷ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ PacBio ಮತ್ತು ONT RNA ಅನುಕ್ರಮ ವಿಧಾನಗಳ ತುಲನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ', ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 115(6), ಪು. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
ಚಾವೊ, Q. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2019) 'ದ ಡೆವಲಪ್‌ಮೆಂಟಲ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಆಫ್ ದಿ ಪಾಪ್ಯುಲಸ್ ಸ್ಟೆಮ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್', ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್, 17(1), ಪುಟಗಳು. 206–219. doi: 10.1111/PBI.12958.
ಡೆಂಗ್, ಎಚ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಆಕ್ಟಿನಿಡಿಯಾ ಲ್ಯಾಟಿಫೋಲಿಯಾ (ಆಸ್ಕಾರ್ಬೇಟ್-ರಿಚ್ ಫ್ರೂಟ್ ಕ್ರಾಪ್) ಮತ್ತು ಅಸೋಸಿಯೇಟೆಡ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಮೆಕ್ಯಾನಿಸಂಸ್ ಆಫ್ ಫ್ರೂಟ್ ಡೆವಲಪ್‌ಮೆಂಟ್ ಮತ್ತು ಪಕ್ವತೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಆಸ್ಕೋರ್ಬಿಕ್ ಆಮ್ಲದ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ಡೈನಾಮಿಕ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳು', ಇಂಟರ್ನ್ಯಾಷನಲ್ ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸೈನ್ಸಸ್, 23(10), ಪು. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
ಹುವಾ, X. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಪ್ಯಾರಿಸ್ ಪಾಲಿಫಿಲ್ಲಾದಲ್ಲಿ ಬಯೋಆಕ್ಟಿವ್ ಪಾಲಿಫಿಲಿನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಮಾರ್ಗದ ಜೀನ್‌ಗಳ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ ಭವಿಷ್ಯ', ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿ 2022 5:1, 5(1), ಪುಟಗಳು. 1–10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
ಲಿಯು, ಎಂ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಸಂಯೋಜಿತ PacBio Iso-Seq ಮತ್ತು Illumina RNA-Seq ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ Tuta absoluta (Meyrick) ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಮತ್ತು Cytochrome P450 ಜೀನ್‌ಗಳು', ಕೀಟಗಳು, 14(4), ಪು. 363. doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
ವಾಂಗ್, ಲಿಜುನ್ ಮತ್ತು ಇತರರು. (2019) 'ರಿಕಿನಸ್ ಕಮ್ಯುನಿಸ್‌ನಲ್ಲಿ ರಿಕಿನೋಲಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಉತ್ತಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಗಾಗಿ ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ ಏಕ-ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್ ನೈಜ-ಸಮಯದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯ ಸಮೀಕ್ಷೆ', BMC ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 20(1), ಪುಟಗಳು. 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9.
