16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-PacBio
ಸೇವೆಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ: PacBio Revio
● ಅನುಕ್ರಮ ಮೋಡ್: CCS (HiFi ಓದುತ್ತದೆ)
● ಹೈಫೈ SMRT ಬೆಲ್ ಲೈಬ್ರರಿ ತಯಾರಿಕೆಯ ಮೊದಲು ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್‌ಗಳ ಟಂಡೆಮ್ ಲಿಂಕ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಗುರಿ ಪ್ರದೇಶದ ವರ್ಧನೆ
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
●ಹೆಚ್ಚಿನ ವರ್ಗೀಕರಣದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್: ಟಿಹ್ಯಾನ್ ಶಾರ್ಟ್-ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್,ಜಾತಿಯ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ OTU ವರ್ಗೀಕರಣ ದರಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
●ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಬೇಸ್ ಕರೆ: PacBio CCS ಮೋಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (HiFi ಓದುತ್ತದೆ).
●ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ: ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ತ್ವರಿತ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ.
●ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ: ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಮುದಾಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು.
●ಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಇತ್ತೀಚಿನ QIIME2 ಪ್ಯಾಕೇಜ್ (ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನಕ್ಕೆ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಒಳನೋಟ) ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಟಿಪ್ಪಣಿ, OTU/ASV ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ.
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: ವಾರ್ಷಿಕವಾಗಿ ನಡೆಸಲಾಗುವ ಸಾವಿರಾರು ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ ಯೋಜನೆಗಳೊಂದಿಗೆ, BMKGENE ಒಂದು ದಶಕದ ಅನುಭವ, ಹೆಚ್ಚು ನುರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂಡ, ಸಮಗ್ರ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಡೇಟಾವನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ |
| ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ | PacBio Revio | 10/30/50 K ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು (CCS) |
ಮಾದರಿ ಅಗತ್ಯತೆಗಳು
| ಏಕಾಗ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ (µg) | ಪರಿಮಾಣ (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
3-4 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಫ್ರೀಜ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ದ್ರವ ಸಾರಜನಕ ಅಥವಾ -80 ಡಿಗ್ರಿಯಲ್ಲಿ ದೀರ್ಘಕಾಲ ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. ಡ್ರೈ-ಐಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಮಾದರಿ ಶಿಪ್ಪಿಂಗ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
●ರಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
●OTU ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್/ಡಿ-ಶಬ್ದ(ASV)
●OTU ಟಿಪ್ಪಣಿ
●ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಶಾನನ್, ಸಿಂಪ್ಸನ್ ಮತ್ತು ACE ಸೇರಿದಂತೆ ಬಹು ಸೂಚಿಕೆಗಳು.
●ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
●ಅಂತರ್ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
●ಸಹಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪರಿಸರದ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಔಟ್ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ನಡುವೆ
●16S ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
ವರ್ಗೀಕರಣದ ವಿತರಣೆಯ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್
ಸಮುದಾಯ ವಿತರಣೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರ
ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಎಸಿಇ
ಸೂಚ್ಯಂಕ
ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪಿಸಿಒಎ
ಇಂಟರ್‌ಗ್ರೂಪ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ANOVA
PacBio ನೊಂದಿಗೆ BMKGene ನ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹಣೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
Gao, X. ಮತ್ತು Wang, H. (2023) 'ಆಲ್ಪೈನ್ ಹುಲ್ಲುಗಾವಲಿನಲ್ಲಿ ಎರಡು ಬೆಳೆಯುವ ಹಂತಗಳೊಂದಿಗೆ ಆಲ್ಪೈನ್ ಮೆರಿನೊ ಶೀಪ್‌ನಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನ ಫಿನಾಲಜಿಗೆ (ರಿಗ್ರೀನ್ ವರ್ಸಸ್. ಗ್ರಾಸಿ) ಅಡಾಪ್ಶನ್ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ರುಮೆನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯಗಳ ತುಲನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ', ಹುದುಗುವಿಕೆ, 9( 1), ಪು. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
ಲಿ, ಎಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಕಲ್ಚುರೋಮಿಕ್ಸ್-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಹೈ-ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮರುಭೂಮಿ ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಡಾರ್ಕ್ ಮ್ಯಾಟರ್ ಅನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವುದು', npj ಬಯೋಫಿಲ್ಮ್ಸ್ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ಸ್ 2023 9:1, 9(1), ಪುಟಗಳು. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
ಮು, ಎಲ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಹುದುಗುವಿಕೆ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೇಲೆ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲ ಲವಣಗಳ ಪರಿಣಾಮಗಳು, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಅಲ್ಫಾಲ್ಫಾ, ಅಕ್ಕಿ ಹುಲ್ಲು ಮತ್ತು ಗೋಧಿ ಹೊಟ್ಟುಗಳೊಂದಿಗೆ ತಯಾರಿಸಿದ ಮಿಶ್ರ ಸೈಲೇಜ್‌ನ ಏರೋಬಿಕ್ ಸ್ಥಿರತೆ', ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ದಿ ಸೈನ್ಸ್ ಆಫ್ ಫುಡ್ ಅಂಡ್ ಅಗ್ರಿಕಲ್ಚರ್, 102(4), ಪುಟಗಳು. 1475– 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
ಯಾಂಗ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಆಕ್ಸಿಡೇಟಿವ್ ಸ್ಟ್ರೆಸ್ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಗಟ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯು ಸೋಂಚಸ್ ಬ್ರಾಚಿಯೋಟಸ್ ಡಿಸಿಯಿಂದ ಸಾರಗಳ ಉತ್ಕರ್ಷಣ ನಿರೋಧಕ ಪರಿಣಾಮಗಳಲ್ಲಿ. ವಯಸ್ಕ ಜೀಬ್ರಾಫಿಶ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಕ್ಸಜೋಲೋನ್-ಪ್ರೇರಿತ ಕರುಳಿನ ಆಕ್ಸಿಡೇಟಿವ್ ಸ್ಟ್ರೆಸ್, ಆಂಟಿಆಕ್ಸಿಡೆಂಟ್‌ಗಳು 2023, ಸಂಪುಟ. 12, ಪುಟ 192, 12(1), ಪು. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
