16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-NGS
ಸೇವೆಯ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್.
● 16S, 18S ಮತ್ತು ITS ನ ಕಿರು ಪ್ರದೇಶಗಳ ವರ್ಧನೆ, ಇತರ ವರ್ಧನೆಯ ಗುರಿಗಳ ನಡುವೆ.
● ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್‌ನ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಆಯ್ಕೆಗಳು.
● ಬಹು ವರ್ಧನೆಯ ಗುರಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಿಂದಿನ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ಅನುಭವ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
●ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ:ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ತ್ವರಿತ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ.
●ಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್: ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಹೇರಳವಾಗಿರುವ ಘಟಕಗಳಲ್ಲಿ.
●ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ: ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಮುದಾಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು.
●ಸಮಗ್ರ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಇತ್ತೀಚಿನ QIIME2 ಪ್ಯಾಕೇಜ್ (ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನಕ್ಕೆ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಒಳನೋಟ) ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಟಿಪ್ಪಣಿ, OTU/ASV ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ.
●ವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: ವಾರ್ಷಿಕವಾಗಿ 150 ಸಾವಿರ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ ಯೋಜನೆಗಳೊಂದಿಗೆ, BMKGENE ಒಂದು ದಶಕದ ಅನುಭವ, ಹೆಚ್ಚು ನುರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂಡ, ಸಮಗ್ರ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಡೇಟಾವನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ |
| ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE250 | 50/100/300K ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು (ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಓದಿ) |
ಸೇವೆಯ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಏಕಾಗ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ (ng) | ಪರಿಮಾಣ (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● ಮಣ್ಣು/ಕೆಸರು: 1-2ಗ್ರಾಂ
● ಕರುಳಿನ ವಿಷಯ-ಪ್ರಾಣಿ: 0.5-2g
● ಕರುಳಿನ ವಿಷಯಗಳು-ಕೀಟ: 0.1-0.25g
● ಸಸ್ಯ ಮೇಲ್ಮೈ (ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಕೆಸರು): 0.1-0.5 ಗ್ರಾಂ
● ಹುದುಗುವಿಕೆ ಸಾರು ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಕೆಸರು): 0.1-0.5g
● ಮಲ (ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಾಣಿಗಳು): 0.5-2 ಗ್ರಾಂ
● ಮಲ (ಮೌಸ್): 3-5 ಧಾನ್ಯಗಳು
● ಪಲ್ಮನರಿ ಅಲ್ವಿಯೋಲಾರ್ ಲ್ಯಾವೆಜ್ ದ್ರವ: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಯೋನಿ ಸ್ವ್ಯಾಬ್: 5-6 ಸ್ವ್ಯಾಬ್‌ಗಳು
● ಚರ್ಮ/ಜನನಾಂಗದ ಸ್ವ್ಯಾಬ್/ಲಾಲಾರಸ/ಮೌಖಿಕ ಮೃದು ಅಂಗಾಂಶ/ಫಾರ್ಂಜಿಯಲ್ ಸ್ವ್ಯಾಬ್/ಗುದನಾಳದ ಸ್ವ್ಯಾಬ್: 2-3 ಸ್ವ್ಯಾಬ್‌ಗಳು
● ಮೇಲ್ಮೈ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ವಾಟರ್‌ಬಾಡಿ/ಏರ್/ಬಯೋಫಿಲ್ಮ್: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಎಂಡೋಫೈಟ್‌ಗಳು: 1-2 ಗ್ರಾಂ
● ಡೆಂಟಲ್ ಪ್ಲೇಕ್: 0.5-1g
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
- ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
- OTU ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ / ಡಿ-ಶಬ್ದ (ASV)
- OTU ಟಿಪ್ಪಣಿ
- ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಶಾನನ್, ಸಿಂಪ್ಸನ್ ಮತ್ತು ACE ಸೇರಿದಂತೆ ಬಹು ಸೂಚಿಕೆಗಳು.
- ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಅಂತರ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
- ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಔಟ್ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ನಡುವೆ
- 16S ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
ವರ್ಗೀಕರಣದ ವಿತರಣೆಯ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್
ವರ್ಗೀಕರಣದ ಸಮೃದ್ಧಿ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಶಾಖ ನಕ್ಷೆ
ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಅಪರೂಪದ ಕರ್ವ್
ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: NMDS
ಇಂಟರ್‌ಗ್ರೂಪ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: LEFSE ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಅನ್ವೇಷಣೆ
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಜೊತೆಗಿನ BMKGene ನ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹಣೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಡಾಂಗ್, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಅಸೆಂಬ್ಲಿ, ಕೋರ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ, ಮತ್ತು ಫಂಕ್ಷನ್ ಆಫ್ ದಿ ರೈಜೋಸ್ಫಿಯರ್ ಮಣ್ಣು ಮತ್ತು ತೊಗಟೆ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ ಇನ್ ಯುಕೋಮಿಯಾ ಉಲ್ಮೋಯಿಡ್ಸ್', ಫ್ರಾಂಟಿಯರ್ಸ್ ಇನ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯಾಲಜಿ, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FMICB.2022.855317/FMICB.
ಲಿ, ವೈ ಮತ್ತು ಇತರರು. (2023) 'ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಗಾರ್ಡ್ನೆರೆಲ್ಲಾ ವಜಿನಾಲಿಸ್-ಪ್ರೇರಿತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಯೋನಿನೋಸಿಸ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ ಸಿಂಥೆಟಿಕ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಕನ್ಸೋರ್ಟಿಯಾ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಪ್ಲಾಂಟೇಶನ್', ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್, 11(1), ಪುಟಗಳು. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. ಮತ್ತು Liu, H. (2022) 'ನೆಲ-ಆಧಾರಿತ ಮುಚ್ಚಿದ ಜೈವಿಕ ಪುನರುತ್ಪಾದಕ ಜೀವ ಬೆಂಬಲ ಪ್ರಯೋಗದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಗಾಳಿಯ ಧೂಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು "ಲೂನಾರ್ ಪ್ಯಾಲೇಸ್ 365"', ಎನ್ವಿರಾನ್ಮೆಂಟಲ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ಸ್, 17(1), pp. 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
ಯಿನ್, ಎಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. (2022) 'ಸಾರಜನಕ ರೂಪಾಂತರಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್‌ಗಳ ಫೀಡ್‌ಸ್ಟಾಕ್-ಅವಲಂಬಿತ ಸಮೃದ್ಧಿಯು ಮಿಶ್ರಗೊಬ್ಬರದಲ್ಲಿ ಸಾರಜನಕದ ನಷ್ಟವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ', ಬಯೋರೆಸೋರ್ಸ್ ಟೆಕ್ನಾಲಜಿ, 361, ಪು. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
