-
BMKMANU S3000_ប្រតិចារឹកលំហ
Spatial transcriptomics ឈរនៅជួរមុខនៃការច្នៃប្រឌិតបែបវិទ្យាសាស្ត្រ ដែលផ្តល់សិទ្ធិអំណាចដល់ក្រុមអ្នកស្រាវជ្រាវក្នុងការស្វែងយល់ពីគំរូនៃការបញ្ចេញហ្សែនដ៏ស្មុគស្មាញនៅក្នុងជាលិកា ខណៈពេលដែលរក្សាបរិបទទំហំរបស់វា។ ក្នុងចំណោមវេទិកាផ្សេងៗ BMKGene បានបង្កើតបន្ទះឈីប BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip ដែលមានគុណភាពបង្ហាញប្រសើរឡើង 3.5µm ឈានដល់ជួរកោសិការង និងបើកដំណើរការការកំណត់គុណភាពបង្ហាញច្រើនកម្រិត។ បន្ទះឈីប S3000 ដែលមានចំនួនប្រមាណ 4 លានកន្លែង ប្រើប្រាស់មីក្រូវ៉េវដែលមានស្រទាប់អង្កាំដែលផ្ទុកដោយឧបករណ៍ចាប់សញ្ញាបាកូដតាមលំហ។ បណ្ណាល័យ cDNA, សំបូរទៅដោយ spatial barcodes ត្រូវបានរៀបចំពីបន្ទះឈីប S3000 ហើយបន្តបន្ទាប់គ្នានៅលើវេទិកា Illumina NovaSeq ។ ការរួមបញ្ចូលគ្នានៃគំរូបាកូដតាមលំហ និង UMIs ធានានូវភាពត្រឹមត្រូវ និងជាក់លាក់នៃទិន្នន័យដែលបានបង្កើត។ បន្ទះឈីប BMKManu S3000 មានភាពបត់បែនខ្លាំង ដោយផ្តល់នូវការកំណត់កម្រិតគុណភាពបង្ហាញច្រើនកម្រិត ដែលអាចកែតម្រូវយ៉ាងម៉ត់ចត់ទៅនឹងជាលិកាផ្សេងៗ និងកម្រិតលម្អិតដែលចង់បាន។ ការសម្របខ្លួននេះដាក់បន្ទះឈីបជាជម្រើសដ៏ល្អសម្រាប់ការសិក្សា spatial transcriptomics ចម្រុះ ដែលធានាបាននូវការចង្កោមលំហរច្បាស់លាស់ជាមួយនឹងសំលេងរំខានតិចតួចបំផុត។ ការប្រើប្រាស់បច្ចេកវិជ្ជាបែងចែកកោសិកាជាមួយ BMKManu S3000 អនុញ្ញាតឱ្យកំណត់ព្រំដែននៃទិន្នន័យចម្លងទៅព្រំដែននៃកោសិកា ដែលបណ្តាលឱ្យមានការវិភាគដែលមានអត្ថន័យជីវសាស្ត្រផ្ទាល់។ លើសពីនេះ ការកែលម្អគុណភាពបង្ហាញរបស់ S3000 នាំឱ្យចំនួនហ្សែន និង UMI កាន់តែខ្ពស់ដែលបានរកឃើញក្នុងមួយកោសិកា ដែលអនុញ្ញាតឱ្យមានការវិភាគត្រឹមត្រូវជាងមុននៃលំនាំចម្លងតាមលំហ និងបណ្តុំនៃកោសិកា។
-
លំដាប់ RNA ស្នូលតែមួយ
ការអភិវឌ្ឍន៍នៃការចាប់យកកោសិកាតែមួយ និងបច្ចេកទេសសាងសង់បណ្ណាល័យផ្ទាល់ខ្លួន គួបផ្សំនឹងការបញ្ជូនបន្តតាមលំដាប់លំដោយខ្ពស់ បានធ្វើបដិវត្តការសិក្សាអំពីការបញ្ចេញហ្សែននៅកម្រិតកោសិកា។ របកគំហើញនេះអនុញ្ញាតឱ្យមានការវិភាគកាន់តែស៊ីជម្រៅ និងទូលំទូលាយបន្ថែមទៀតនៃចំនួនកោសិកាស្មុគស្មាញ ដោយយកឈ្នះលើដែនកំណត់ដែលទាក់ទងនឹងការបញ្ចេញហ្សែនជាមធ្យមលើកោសិកាទាំងអស់ និងរក្សាភាពខុសធម្មតាពិតប្រាកដនៅក្នុងចំនួនប្រជាជនទាំងនេះ។ ខណៈពេលដែលលំដាប់ RNA កោសិកាតែមួយ (scRNA-seq) មានគុណសម្បត្តិដែលមិនអាចប្រកែកបាន វាបានជួបប្រទះបញ្ហាប្រឈមនៅក្នុងជាលិកាមួយចំនួន ដែលការបង្កើតការព្យួរកោសិកាតែមួយបង្ហាញពីការលំបាក និងត្រូវការគំរូថ្មីៗ។ នៅ BMKGene យើងដោះស្រាយឧបសគ្គនេះដោយផ្តល់ជូននូវលំដាប់ RNA ស្នូលតែមួយ (snRNA-seq) ដោយប្រើបច្ចេកវិទ្យា 10X Genomics Chromium ដ៏ទំនើប។ វិធីសាស្រ្តនេះពង្រីកវិសាលគមនៃសំណាកគំរូដែលអាចកែប្រែបានចំពោះការវិភាគប្រតិចារិកនៅកម្រិតកោសិកាតែមួយ។
ភាពឯកោនៃស្នូលត្រូវបានសម្រេចតាមរយៈបន្ទះឈីប 10X Genomics Chromium ប្រកបដោយភាពច្នៃប្រឌិត ដែលបង្ហាញនូវប្រព័ន្ធមីក្រូហ្វ្លុយឌីកចំនួនប្រាំបីឆានែលជាមួយនឹងការឆ្លងកាត់ពីរដង។ នៅក្នុងប្រព័ន្ធនេះ អង្កាំជែលដែលបញ្ចូលបាកូដ សារធាតុ primers អង់ស៊ីម និងស្នូលតែមួយត្រូវបានខ្ចប់នៅក្នុងដំណក់ប្រេងទំហំ nanoliter បង្កើតជា Gel Bead-in-Emulsion (GEM)។ បន្ទាប់ពីការបង្កើត GEM កោសិកា និងការបញ្ចេញបាកូដកើតឡើងនៅក្នុង GEM នីមួយៗ។ ក្រោយមក ម៉ូលេគុល mRNA ឆ្លងកាត់ការចម្លងបញ្ច្រាសទៅក្នុង cDNAs ដោយបញ្ចូលលេខកូដ 10X និងឧបករណ៍កំណត់អត្តសញ្ញាណម៉ូលេគុលពិសេស (UMIs)។ បន្ទាប់មក cDNAs ទាំងនេះត្រូវបានទទួលរងនូវការសាងសង់បណ្ណាល័យតាមលំដាប់លំដោយ ដែលជួយសម្រួលដល់ការរុករកដ៏រឹងមាំ និងទូលំទូលាយនៃទម្រង់កន្សោមហ្សែននៅកម្រិតកោសិកាតែមួយ។
វេទិកា៖ 10 × Genomics Chromium និង Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics គឺជាបច្ចេកវិទ្យាទំនើបមួយដែលអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកស្រាវជ្រាវស៊ើបអង្កេតគំរូនៃការបញ្ចេញហ្សែននៅក្នុងជាលិកាខណៈពេលដែលរក្សាបរិបទទំហំរបស់វា។ វេទិកាដ៏មានអានុភាពមួយនៅក្នុងដែននេះគឺ 10x Genomics Visium គួបផ្សំជាមួយនឹងលំដាប់ Illumina ។ គោលការណ៍នៃ 10X Visium ស្ថិតនៅលើបន្ទះឈីបឯកទេសមួយដែលមានតំបន់ចាប់យកដែលបានកំណត់ដែលផ្នែកជាលិកាត្រូវបានដាក់។ កន្លែងចាប់យកនេះមានកន្លែងដាក់បាកូដ ដែលនីមួយៗត្រូវគ្នាទៅនឹងទីតាំងលំហតែមួយគត់នៅក្នុងជាលិកា។ បន្ទាប់មក ម៉ូលេគុល RNA ដែលចាប់យកពីជាលិកាត្រូវបានដាក់ស្លាកជាមួយឧបករណ៍កំណត់អត្តសញ្ញាណម៉ូលេគុលពិសេស (UMIs) កំឡុងពេលដំណើរការចម្លងបញ្ច្រាស។ ចំណុច និង UMIs ដែលមានបាកូដទាំងនេះអនុញ្ញាតឱ្យមានការគូសផែនទីលំហជាក់លាក់ និងបរិមាណនៃការបញ្ចេញហ្សែននៅកម្រិតដំណោះស្រាយកោសិកាតែមួយ។ ការរួមបញ្ចូលគ្នានៃគំរូបាកូដតាមលំហ និង UMIs ធានានូវភាពត្រឹមត្រូវ និងជាក់លាក់នៃទិន្នន័យដែលបានបង្កើត។ ដោយប្រើបច្ចេកវិទ្យា Spatial Transcriptomics នេះ អ្នកស្រាវជ្រាវអាចទទួលបានការយល់ដឹងកាន់តែស៊ីជម្រៅអំពីការរៀបចំលំហនៃកោសិកា និងអន្តរកម្មម៉ូលេគុលដ៏ស្មុគស្មាញដែលកើតឡើងនៅក្នុងជាលិកា ដោយផ្តល់នូវការយល់ដឹងដែលមិនអាចកាត់ថ្លៃបានចំពោះយន្តការដែលស្ថិតនៅក្រោមដំណើរការជីវសាស្ត្រក្នុងវិស័យជាច្រើន រួមទាំងជំងឺមហារីកវិទ្យា សរសៃប្រសាទ ជីវវិទ្យាអភិវឌ្ឍន៍ ភាពស៊ាំ។ និងការសិក្សារុក្ខសាស្ត្រ។
វេទិកា៖ 10X Genomics Visium និង Illumina NovaSeq
