ការវិវត្តន៍ហ្សែន
ភីអិនអេ
ប្រវត្តិដើមកំណើតវិវត្តនិងធ្វើឱ្យប្រវត្តិសាស្រ្តធ្វើឱ្យមានលក្ខណៈពិសេសនៃត្រីមាស (កាស៊ីសៀសអេឌីស)
Pacbio | លីលីណា | ផែនទីហ្សែនប៊ីយ៉ូណូ | ការជួបប្រជុំគ្នាដ៏អស្ចារ្យ Hi-C | ផែនទីហ្សែន | Gwas | rna-seq
គំនួសពណ៌
1. Genome ហ្វីដហ្វីលបានធ្វើឱ្យទាន់សម័យជាមួយនឹងកំណែសន្និបាតដែលមានគុណភាពខ្ពស់យុថ្កា 95,75% នៃ contigs ទៅជា 50 Pseudochromosomes (ScraffolN N50 = 31,84 MB) ។ មន្ទីរពិសោធន៍ពីរត្រូវបានគេធ្វើឱ្យមានជំងឺដាច់សរសៃឈាមខួរក្បាល។
2. តំបន់ចំនួន 2,422 នៃការជ្រើសរើសការជ្រើសរើសក្នុងកំឡុងពេលដែលបានទទួលខុសត្រូវពីទិន្នន័យដែលបានធ្វើដោយបុគ្គល 2010 ដែលបានដាក់បញ្ចូលហ្សែនបេក្ខជនចំនួន 390 ដែលទំនងជាទាក់ទងនឹងចរិតលក្ខណៈនៃការរឹបអូស។
3.gwas នៅលើព្រុយ Dorsal នៅក្នុងត្រីមាសត្រីមាសដែលបានបង្ហាញហ្សែនបេក្ខជនចំនួន 378 ដែលមានសក្តានុពល។ អ្នកយកព័ត៌មាន Kinace Tyrosine-Protein Kinase ត្រូវបានគេកំណត់ថាជាហ្សែនដែលមានវដ្តដែលជាប់ទាក់ទងនឹងតម្លាភាព
ផ្ទៃខាងរេកាយ
ត្រីមាស (ការ៉ាសៀអេស្យូស) គឺជាត្រីដែលមានកសិកម្មសំខាន់បំផុតមួយដែលត្រូវបានធ្វើឱ្យមានចំណុះពុលពីត្រីក្នុងស្រុក Crucian នៅប្រទេសចិនបុរាណ។ ពួកគេត្រូវបានអត្ថាធិប្បាយដោយលោក Charles Darwin ថា "ឆ្លងកាត់ភាពចម្រុះនៃពណ៌ស្ទើរតែគ្មានកំណត់យើងជួបជាមួយការកែប្រែដ៏អស្ចារ្យបំផុតនៃរចនាសម្ព័ន្ធ" ។ លក្ខណៈចម្រុះខ្លាំងណាស់និងប្រវត្តិនៃការចិញ្ចឹមកូនជាយូរមកហើយធ្វើឱ្យមាសក្លាយជាប្រព័ន្ធគំរូហ្សែនដ៏អស្ចារ្យសម្រាប់សរីរវិទ្យាត្រីនិងការវិវត្តន៍។
សមិទ្ធិផល
genome មាស
Jការវិភាគ OIT នៃ PacBio និង Illimina Super-Seconding ទទួលបានការផ្គូផ្គងព្រាង 1.657 ក្រាមដំបូង (Contig N50 = 474 KB) ។ ផែនទីអុបទិកអុបទិក Bionano ត្រូវបានបង្កើតនិងកែសំរួលការជួបប្រជុំគ្នាក្នុងទំហំ 1,73 ជីកាបៃ (ទំហំហ្សែនប៉ាន់ស្មាន: 1.8 ជីកាបៃ) ។ សន្និបាតដែលមានមូលដ្ឋានខ្ពស់ Hi-C បានធ្វើឱ្យប្រសើរឡើងនូវរន្ទា 5050 ពី 606 Kb ដល់ 31,84 MB និងទទួលបានអត្រាយុថ្កាដែលផ្តោតលើតម្លៃ 95,75% (1.65 ជី) និងបញ្ជាទិញអវកាស។ ហ្សែនមានចំនួន 56.251 ហ្សែន Genes និងប្រតិចារិកដែលមិនមែនជាកូដដែលមិនមានកូដរយៈពេល 10.098 ។ លើសពីនេះទៀតតំបន់ចំកណ្តាលសក្តានុពលចំនួន 38 ត្រូវបានគេព្យាករណ៍ពីក្រូម៉ូសូមចំនួន 50 ។
Fall.1 ត្រីមាស Genome Genome
Tសំណុំរងនៃសង្ឈឹៈយ៉ាងច្បាស់ត្រូវបានកំណត់អត្តសញ្ញាណនៅក្នុងក្រូម៉ូសូមមាស 50 ដែលបណ្តាលមកពីព្រឹត្តិការណ៍កូនកាត់បុរាណមួយ។ សំណុំក្រូម៉ូសូមដែលមានសមាមាត្រខ្ពស់នៃការអានបានតម្រឹមរវាងត្រីមាសហើយ Barbina ត្រូវបានកំណត់ថាជាខ្សែស្រឡាយ A (Chra01 ~ A25 ទូទៅសម្រាប់ Barbinome B (chrb01 ~ B25) ។
ការធ្វើចំណាកស្រុកនិងការជ្រើសរើសការជ្រើសរើស
Aសរុបនៃត្រីត្រីខៀវ Crucian ប្រភេទព្រៃចំនួន 16 និងវ៉ារ្យ៉ង់ពណ៌មាសចំនួន 185 បានកើនឡើងជាមួយនឹងជម្រៅលំដាប់មធ្យមប្រមាណ 12.5 ទៅបង្កើត 4,3 Terabases ទិន្នន័យ។ ការកសាងប្រសាទជីវប្រវត្តិនិងការវិភាគ PCA បានបញ្ជាក់ពីទំនាក់ទំនងជិតស្និទ្ធរវាងត្រីមាសធម្មតានិងត្រីគល់រាំងដ៏ខ្ពង់ខ្ពស់ជាងត្រីមាសផ្សេងទៀតដែលក្រោយមកត្រូវបានបែងចែកជាពីរ។
Lការវិភាគរបស់ D ការពុករលួយនៅខាងលើចំនួនបួននៅខាងលើបានគាំទ្រអត្ថិភាពនៃភាពរាំងស្ទះហ្សែនរបស់ប្រជាជនក្នុងកំឡុងពេលនៃការធ្វើបដិរូបកម្មនិងការជ្រើសរើសសិប្បនិម្មិតដ៏ខ្លាំងនៅក្នុងត្រីមាស។ ការបង្កើនភាពចម្រុះហ្សែន (π) ពីត្រីគល់រាំង Crucian ទៅនឹងត្រីមាសធម្មតាបន្ថែមទៀតដើម្បីធ្វើឱ្យមានត្រីមាសនិងត្រីមាសបានបង្ហាញពីការប្រមូលផ្តុំដ៏សំខាន់នៃបំរែបំរួលហ្សែនក្នុងអំឡុងការធ្វើអាជីវកម្មហ្សែន។ 50 តំបន់ដែលលាតសន្ធឹងបានជ្រើសរើសតំបន់ដែលមានទំហំ 25,2 មេកាបៃនិងហ្សែនចំនួន 946 ត្រូវបានកំណត់អត្តសញ្ញាណពីទិន្នន័យតំណាង (33 គ្រាប់មាសនិង 163 គ្រាប់ Crocian Crucian) ។ ការពង្រីកការវិភាគដល់បុគ្គលឆ្នាំ 201 393 ហ្សែនដែលបានចង្អុលបង្ហាញពីតំបន់ដែលបានជ្រើសរើសបានបញ្ចប់។ ហ្សែនទាំងនេះត្រូវបានគេរកឃើញនៃភាពចម្រុះទាបដែលទំនងជាបានរួមចំណែកដល់ផាំងផតដែលទាក់ទងនឹងលក្ខណៈពិសេសសំខាន់ៗនៅក្នុងត្រីមាស។
រូបភាពទី 3 ការវិភាគទាក់ទងនឹងការធ្វើសមាហរណកម្ម
Gwas នៅលើ Goldfish Countfish
DOrsal FUN គឺជាលក្ខណៈសំខាន់មួយដែលសម្គាល់ការធ្វើឱ្យមានត្រីមាសភ្លឺថ្លាពីត្រីមាស។ Gwas នៃបំណែកនៃ dorsal នៅលើ 96 Goldfish ត្រីនិងត្រីមាស 87 បានបង្ហាញហ្សែនរបស់បេក្ខជនចំនួន 378 នៅទូទាំងក្រូម៉ូសូមចំនួន 13 និងការចែកចាយដែលមិនស្មើគ្នានៃហ្សែនទាំងនេះរវាងសាំងហ្គាទិចត្រូវបានគេសង្កេតឃើញ។ ការវិភាគមុខងារលើហ្សែនបេក្ខជនទាំងនេះបានរំលេចដំណើរការជីវសាស្ត្ររួមមាន "សញ្ញាផ្ទៃក្រឡា" "ការដឹកជញ្ជូន Transmembran" "ការអភិវឌ្ឍប្រព័ន្ធគ្រោងឆ្អឹង" ។ ល។
រូបភាពព្រីនធ័រឌុកដលនៅលើមាសត្រីមាស
IN Gwas នៃចរិតដែលទាក់ទងនឹងមាត្រដ្ឋានដែលជាសមាគមសមាគមដ៏រឹងមាំមួយត្រូវបានរកឃើញ។ ហ្សែនអ៊ិនកូដមួយដែលមានប្រូហ្ស៊ីនប្រូតេអ៊ីនដែលមានជាតិប្រូតេអ៊ីន Kinase ដែលត្រូវបានគេកំណត់អត្តសញ្ញាណនៅក្នុងតំបន់មួយក្នុងចំណោមតំបន់បេក្ខជន។
រូបភាព 5 Gwas នៃចរិតដែលទាក់ទងនឹងមាត្រដ្ឋានប្រកបដោយតម្លាភាព
ឯកសារយោង
Cហេនឌី et al ។ ប្រវត្តិដើមកំណើតវិវត្តនិងធ្វើឱ្យប្រវត្ដិសាស្ដ្រធម្មជាតិរបស់ត្រីមាស (កាស៊ីសៀអាឌុក) ។ PNAs (2020)
ប៍តមាន មានគោលបំណងចែករំលែកករណីជោគជ័យចុងក្រោយបំផុតជាមួយបច្ចេកវិទ្យាជីវឧស្ម័នចាប់យកសមិទ្ធិផលវិទ្យាសាស្ត្រប្រលោមលោកក៏ដូចជាបច្ចេកទេសលេចធ្លោដែលបានអនុវត្តក្នុងកំឡុងពេលសិក្សា។
ពេលវេលាក្រោយ: មករាមករា - 04-2022