ហ្សែនវិវត្តន៍
អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម
Takagi et al ។ទស្សនាវដ្តីរុក្ខជាតិ, 2013
●ការវិភាគជីវព័ត៌មានទូលំទូលាយ៖អនុញ្ញាតឱ្យមានការប៉ាន់ប្រមាណនៃភាពចម្រុះហ្សែន ដែលឆ្លុះបញ្ចាំងពីសក្ដានុពលនៃការវិវត្តន៍នៃប្រភេទសត្វ និងបង្ហាញពីទំនាក់ទំនង phylogenetic ដែលអាចទុកចិត្តបានរវាងប្រភេទសត្វជាមួយនឹងឥទ្ធិពលបង្រួមអប្បបរមានៃការវិវត្តន៍រួមគ្នា និងការវិវត្តន៍ស្របគ្នា។
●ការវិភាគតាមជម្រើស៖ ដូចជាការប៉ាន់ប្រមាណនៃពេលវេលា និងល្បឿនខុសគ្នាដោយផ្អែកលើការប្រែប្រួលនៅកម្រិតនុយក្លេអូទីត និងអាស៊ីតអាមីណូ។
●ជំនាញទូលំទូលាយ និងការបោះពុម្ពកំណត់ត្រា៖ BMKGene បានប្រមូលផ្តុំបទពិសោធន៍ដ៏ធំនៅក្នុងគម្រោងហ្សែនចំនួនប្រជាជន និងវិវត្តន៍អស់រយៈពេលជាង 15 ឆ្នាំ គ្របដណ្តប់រាប់ពាន់ប្រភេទ។ល។ និងបានរួមចំណែកដល់គម្រោងកម្រិតខ្ពស់ជាង 1000 ដែលបានបោះពុម្ពនៅក្នុង Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal ជាដើម។
● ក្រុមជីវព័ត៌មានវិទ្យាដែលមានជំនាញខ្ពស់ និងវដ្តនៃការវិភាគខ្លីៗ៖ ជាមួយនឹងបទពិសោធន៍ដ៏អស្ចារ្យក្នុងការវិភាគហ្សែនកម្រិតខ្ពស់ ក្រុមការងាររបស់ BMKGene ផ្តល់នូវការវិភាគយ៉ាងទូលំទូលាយជាមួយនឹងពេលវេលាផ្លាស់ប្តូរយ៉ាងឆាប់រហ័ស។
● ការគាំទ្រក្រោយការលក់៖ការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងពង្រីកលើសពីការបញ្ចប់គម្រោង ជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយការលក់រយៈពេល 3 ខែ។ ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គ Q&A ដើម្បីដោះស្រាយរាល់សំណួរដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
លក្ខណៈបច្ចេកទេស និងតម្រូវការសេវាកម្ម
| ប្រភេទនៃលំដាប់ | មាត្រដ្ឋានប្រជាជនដែលបានណែនាំ | យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប | តម្រូវការនុយក្លេអូទីត |
| លំដាប់ហ្សែនទាំងមូល | ≥ 30 បុគ្គល ដែលមាន ≥ 10 បុគ្គលពីក្រុមរងនីមួយៗ
| 10x | កំហាប់៖ ≥ 1 ng / µL បរិមាណសរុប≥ 30ng មានកំណត់ ឬគ្មានការរិចរិល ឬការចម្លងរោគ |
| Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) | ជម្រៅស្លាក៖ 10x ចំនួនស្លាក៖ <400 Mb៖ WGS ត្រូវបានណែនាំ <1Gb: ស្លាក 100K 1 Gb > 2Gb: 300K ស្លាក ស្លាកអតិបរមា 500k | កំហាប់ ≥ 5 ng/µL បរិមាណសរុប ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 ជែលអាហ្ការ៉ូសៈ គ្មាន ឬមានកំណត់ ការរិចរិល ឬការចម្លងរោគ
|
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការរចនាពិសោធន៍
ការចែកចាយគំរូ
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
សេវាកម្មរួមមានការវិភាគនៃរចនាសម្ព័ន្ធចំនួនប្រជាជន (មែកធាង phylogenetic, PCA, តារាងបែងចែកចំនួនប្រជាជន) ភាពចម្រុះនៃចំនួនប្រជាជន និងការជ្រើសរើសចំនួនប្រជាជន (ភាពមិនស្មើគ្នានៃតំណភ្ជាប់ ការជ្រើសរើសទីតាំងដែលមានអត្ថប្រយោជន៍)។ សេវាកម្មក៏អាចរួមបញ្ចូលការវិភាគតាមតម្រូវការផងដែរ (ឧទាហរណ៍ ពេលវេលាខុសគ្នា លំហូរហ្សែន)។
*លទ្ធផលសាកល្បងដែលបង្ហាញនៅទីនេះគឺសុទ្ធតែមកពីហ្សែនដែលត្រូវបានបោះពុម្ពដោយ BMKGENE
ការវិភាគវិវឌ្ឍមានការសាងសង់ដើមឈើ phylogenetic រចនាសម្ព័ន្ធប្រជាជន និង PCA ដោយផ្អែកលើការប្រែប្រួលហ្សែន។
មែកធាង Phylogenetic តំណាងឱ្យទំនាក់ទំនងពន្ធុវិទ្យា និងការវិវត្តក្នុងចំណោមប្រភេទសត្វជាមួយបុព្វបុរសទូទៅ។
PCA មានគោលបំណងមើលឃើញភាពជិតស្និទ្ធរវាងប្រជាជនរង។
រចនាសម្ព័នចំនួនប្រជាជនបង្ហាញពីវត្តមាននៃចំនួនប្រជាជនរងដែលខុសគ្នាពីហ្សែនទាក់ទងនឹងប្រេកង់ allele ។
Chen, et ។ អាល់។ ,PNASឆ្នាំ ២០២០
2. ការជ្រើសរើស
ការបោសសំអាតជ្រើសរើសសំដៅទៅលើដំណើរការដែលគេហទំព័រដែលមានអត្ថប្រយោជន៍ត្រូវបានជ្រើសរើស ហើយភាពញឹកញាប់នៃគេហទំព័រអព្យាក្រឹតដែលត្រូវបានភ្ជាប់ត្រូវបានកើនឡើង ហើយគេហទំព័រដែលមិនភ្ជាប់ត្រូវបានថយចុះ ដែលបណ្តាលឱ្យមានការថយចុះនៃតំបន់។
ការរកឃើញហ្សែនធំទូលាយលើតំបន់ជ្រើសរើសត្រូវបានដំណើរការដោយការគណនាសន្ទស្សន៍ហ្សែនប្រជាជន (π,Fst, Tajima's D) នៃ SNPs ទាំងអស់នៅក្នុងបង្អួចរអិល (100 Kb) នៅជំហានជាក់លាក់ (10 Kb) ។
ភាពចម្រុះនៃនុយក្លេអូទីត(π)
តាជីម៉ា ឌី
សន្ទស្សន៍ជួសជុល (Fst)
Wu, et ។ អាល់។ ,រុក្ខជាតិម៉ូលេគុលឆ្នាំ 2018
3. លំហូរហ្សែន
Wu, et ។ អាល់។ ,រុក្ខជាតិម៉ូលេគុលឆ្នាំ 2018
4. ប្រវត្តិសាស្រ្តប្រជាសាស្រ្ត
Zhang, et ។ អាល់។ ,ធម្មជាតិ និងបរិស្ថានវិទ្យាឆ្នាំ 2021
5. ពេលវេលាខុសគ្នា
Zhang, et ។ អាល់។ ,ធម្មជាតិ និងបរិស្ថានវិទ្យាឆ្នាំ 2021
ស្វែងយល់ពីវឌ្ឍនភាពដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មហ្សែនវិវត្តន៍របស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពដែលបានរៀបចំឡើង៖
ហាសាន់យ៉ារ, AK et al ។ (2023) 'ការរកឃើញនៃសញ្ញាសម្គាល់ម៉ូលេគុល SNP និងហ្សែនបេក្ខជនដែលត្រូវបានផ្សារភ្ជាប់ជាមួយនឹងភាពធន់នឹងមេរោគ Sacbrood នៅក្នុង Apis cerana cerana Larvae ដោយការបន្តពូជហ្សែនទាំងមូល',ទិនានុប្បវត្តិអន្តរជាតិនៃវិទ្យាសាស្ត្រម៉ូលេគុល, ២៤(៧). doi: 10.3390/IJMS24076238។
ឆៃ, J. et al ។ (ឆ្នាំ 2022) 'ការរកឃើញសត្វសាឡាម៉ាន់ឌឺយក្សចិនដ៏បរិសុទ្ធមួយប្រភេទ បង្កើតឱកាសអភិរក្សថ្មី',ការស្រាវជ្រាវសត្វវិទ្យា, 2022, វ៉ុល។ 43, លេខ 3, ទំព័រ: 469-480, 43(3), ទំព័រ 469–480។ doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101។
ហាន, M. et al ។ (2022) 'គំរូសរីរវិទ្យា និងការវិវត្តន៍នៃចំនួនប្រជាជន ប្រវត្តិសាស្រ្តនៃជនជាតិដើមភាគតិច Elymus sibiricus L. នៅលើខ្ពង់រាប Qinghai-ទីបេ',ព្រំដែនក្នុងវិទ្យាសាស្ត្ររុក្ខជាតិ, 13, ទំ។ 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX ។
លោក Wang, J. et al ។ (2022) 'ការយល់ដឹងអំពីពន្ធុវិទ្យាលើការវិវត្តន៍នៃផ្លែវែង ពីការប្រមូលផ្តុំហ្សែនកម្រិតក្រូម៉ូសូម និងហ្សែនចំនួនប្រជាជននៃការចូលប្រើរបស់ផ្លែវែង',ការស្រាវជ្រាវផ្នែកសាកវប្បកម្ម, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
