Eukaryotic mRNA Sequencing-NGS
លក្ខណៈពិសេស
● ការចាប់យក poly mRNA មុនពេលរៀបចំបណ្ណាល័យ
● ការរៀបចំបណ្ណាល័យ mRNA ទិសដៅស្រេចចិត្ត ដើម្បីបើកការទទួលបានទិន្នន័យលំដាប់លំដោយជាក់លាក់
● ការវិភាគជីវព័ត៌មាននៃការបញ្ចេញហ្សែន និងរចនាសម្ព័ន្ធប្រតិចារិក
គុណសម្បត្តិ
●ជំនាញទូលំទូលាយ៖ ក្រុមរបស់យើងបានដំណើរការគំរូជាង 600,000 នៅ BMKgene ដែលលាតសន្ធឹងលើប្រភេទគំរូចម្រុះដូចជា វប្បធម៌កោសិកា ជាលិកា និងវត្ថុរាវក្នុងរាងកាយ។ យើងនាំមកនូវបទពិសោធន៍ជាច្រើនដល់គ្រប់គម្រោង ហើយបានបញ្ចប់ដោយជោគជ័យនូវគម្រោង mRNA-Seq ជាង 100,000 នៅក្នុងដែនស្រាវជ្រាវផ្សេងៗ។
●ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់៖ យើងអនុវត្តចំណុចត្រួតពិនិត្យស្នូលនៅគ្រប់ដំណាក់កាលទាំងអស់ ចាប់ពីការរៀបចំគំរូ និងបណ្ណាល័យ រហូតដល់ការចាត់ថ្នាក់ និងជីវព័ត៌មានវិទ្យា។ ការត្រួតពិនិត្យយ៉ាងម៉ត់ចត់នេះធានាបាននូវលទ្ធផលដែលមានគុណភាពខ្ពស់ជាប់លាប់ ដោយធានាអ្នកថាគម្រោងរបស់អ្នកស្ថិតក្នុងដៃដែលអាចទុកចិត្តបាន។
●ចំណារពន្យល់ទូលំទូលាយ៖ យើងប្រើមូលដ្ឋានទិន្នន័យច្រើនដើម្បីកត់ចំណាំមុខងារនៃហ្សែនដែលបង្ហាញដោយឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DEGs) និងធ្វើការវិភាគការពង្រឹងដែលត្រូវគ្នា។ វិធីសាស្រ្តដ៏ទូលំទូលាយនេះផ្តល់នូវការយល់ដឹងអំពីដំណើរការកោសិកា និងម៉ូលេគុលដែលស្ថិតនៅក្រោមការឆ្លើយតបរបស់ប្រតិចារិក ដោយធានាថាអ្នកត្រូវបានជូនដំណឹងយ៉ាងពេញលេញអំពីលទ្ធផលនៃគម្រោងរបស់អ្នក។
●ការគាំទ្រក្រោយការលក់៖ ការប្តេជ្ញាចិត្តរបស់យើងលើសពីការបញ្ចប់គម្រោងជាមួយនឹងរយៈពេលសេវាកម្មក្រោយការលក់រយៈពេល 3 ខែ។ ក្នុងអំឡុងពេលនេះ យើងផ្តល់ជូននូវការតាមដានគម្រោង ជំនួយដោះស្រាយបញ្ហា និងវគ្គ Q&A ដើម្បីដោះស្រាយរាល់សំណួរដែលទាក់ទងនឹងលទ្ធផល។
តម្រូវការគំរូ និងការដឹកជញ្ជូន
| បណ្ណាល័យ | យុទ្ធសាស្ត្រតម្រៀប | ទិន្នន័យដែលបានណែនាំ | ការត្រួតពិនិត្យគុណភាព |
| Poly A សំបូរទៅដោយ | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
តម្រូវការគំរូ៖
នុយក្លេអូទីត៖
| Conc.(ng/μl) | បរិមាណ (μg) | ភាពបរិសុទ្ធ | សុចរិតភាព | |
| បណ្ណាល័យស្តង់ដារ | ≥ ១០ | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 មានកំណត់ ឬគ្មានការចម្លងរោគ DNA បង្ហាញនៅលើជែល។ | សម្រាប់រុក្ខជាតិ៖ RIN≥4.0; សម្រាប់សត្វ: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; កម្រិតកម្រិត ឬគ្មានកម្រិតមូលដ្ឋាន |
| បណ្ណាល័យទិសដៅ | ≥ ១០ | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 មានកំណត់ ឬគ្មានការចម្លងរោគ DNA បង្ហាញនៅលើជែល។ | សម្រាប់រុក្ខជាតិ៖ RIN≥4.0; សម្រាប់សត្វ: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; កម្រិតកម្រិត ឬគ្មានកម្រិតមូលដ្ឋាន |
● រុក្ខជាតិ៖
ឫស ដើម ឬផ្កាៈ ៤៥០ មីលីក្រាម
ស្លឹកឬគ្រាប់៖ ៣០០ មីលីក្រាម
ផ្លែឈើ៖ ១,២ ក្រាម។
●សត្វ៖
បេះដូង ឬពោះវៀន៖ ៣០០ មីលីក្រាម
Viscera ឬ Brain: 240 mg
សាច់ដុំ៖ ៤៥០ មីលីក្រាម
ឆ្អឹង សក់ ឬស្បែក៖ ១ ក្រាម។
● Arthropods៖
សត្វល្អិត៖ ៦ ក្រាម។
Crustacea: 300 មីលីក្រាម
●ឈាមទាំងមូល: 1 បំពង់
● កោសិកា: ១០6 កោសិកា
ការចែកចាយគំរូដែលបានណែនាំ
កុងតឺន័រ: បំពង់ centrifuge 2 មីលីលីត្រ (ក្រដាសសំណប៉ាហាំងមិនត្រូវបានណែនាំទេ)
ការដាក់ស្លាកគំរូ៖ ក្រុម + ចម្លងឧទាហរណ៍ A1, A2, A3; B1, B2, B3 ......
ការដឹកជញ្ជូន៖
1. ទឹកកកស្ងួត៖ គំរូត្រូវវេចខ្ចប់ក្នុងថង់ ហើយកប់ក្នុងទឹកកកស្ងួត។
2. RNAs table tubes: សំណាក RNA អាចត្រូវបានស្ងួតនៅក្នុងបំពង់ស្ថេរភាព RNA (ឧ. RNAstable®) និងដឹកជញ្ជូនក្នុងសីតុណ្ហភាពបន្ទប់។
លំហូរការងារសេវាកម្ម
ការរចនាពិសោធន៍
ការចែកចាយគំរូ
ការទាញយក RNA
ការសាងសង់បណ្ណាល័យ
លំដាប់
ការវិភាគទិន្នន័យ
សេវាកម្មក្រោយពេលលក់
ជីវព័ត៌មានវិទ្យា
Eukaryotic លំហូរការងារការវិភាគតាមលំដាប់ mRNA
ជីវព័ត៌មានវិទ្យា
Øការត្រួតពិនិត្យគុណភាពទិន្នន័យឆៅ
Øការតម្រឹមហ្សែនយោង
Øការវិភាគរចនាសម្ព័ន្ធប្រតិចារិក
Øបរិមាណនៃការបញ្ចេញមតិ
Øការវិភាគការបញ្ចេញមតិឌីផេរ៉ង់ស្យែល
Øចំណារពន្យល់មុខងារ និងការពង្រឹង
ការតម្រឹមហ្សែនយោង
តិត្ថិភាពទិន្នន័យ
ការជាប់ទាក់ទងគ្នានៃគំរូ និងការវាយតម្លៃនៃការចម្លងជីវសាស្ត្រ
ហ្សែនដែលបង្ហាញដោយឌីផេរ៉ង់ស្យែល (DEGs)
កំណត់ចំណាំមុខងារនៃ DEGs
ការពង្រឹងមុខងារនៃ DEGs
ស្វែងរកភាពជឿនលឿនដែលសម្របសម្រួលដោយសេវាកម្មតម្រៀប NGS mRNA eukaryotic របស់ BMKGene តាមរយៈបណ្តុំនៃការបោះពុម្ពផ្សាយ។
លោក Huang, L. et al ។ (2023) 'Triclosan និង triclocarban ធ្វើឱ្យសមត្ថភាព olfactory របស់ត្រីមាសចុះខ្សោយ ដោយរារាំងការទទួលស្គាល់ក្លិន រំខានដល់ការបញ្ជូនសញ្ញា olfactory និងដំណើរការព័ត៌មាន olfactory រំខាន', Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al ។ (2023) 'Aspergillus fumigatus ប្លន់មនុស្ស p11 ដើម្បីប្តូរទិស phagosomes ដែលមានផ្ទុកផ្សិតទៅជាផ្លូវដែលមិនរលួយ', Cell Host & Microbe, 31(3), ទំព័រ 373-388.e10។ doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002 ។
Jin, K. et al ។ (2022) 'កត្តាប្រតិចារិក TCP ជាប់ពាក់ព័ន្ធក្នុងការអភិវឌ្ឍន៍ពន្លករបស់ Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX ។
Wen, X. et al ។ (2022) 'ហ្សែន Chrysanthemum lavandulifolium និងយន្តការម៉ូលេគុលដែលស្ថិតនៅក្រោមប្រភេទ capitulum ចម្រុះ', ការស្រាវជ្រាវសាកវប្បកម្ម, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022។
Zhang, Yujie et al ។ (2023) 'A cascade nanoreactor សម្រាប់ការពង្រឹងការព្យាបាលដោយ sonodynamic លើជំងឺមហារីកពោះវៀនធំតាមរយៈការបង្កើន ROS និង autophagy blockage', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
